MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 85921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017566	TTG	2	6	559205	559210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312289
10003	NC_017566	CGC	2	6	559243	559248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312289
10004	NC_017566	TGA	2	6	559254	559259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312289
10005	NC_017566	ATT	2	6	559313	559318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312289
10006	NC_017566	GC	4	8	559368	559375	0 %	0 %	50 %	50 %	386312289
10007	NC_017566	ATC	2	6	559414	559419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312289
10008	NC_017566	GAC	2	6	559437	559442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312289
10009	NC_017566	GAA	2	6	559486	559491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312289
10010	NC_017566	CAT	2	6	559563	559568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312289
10011	NC_017566	TAT	2	6	559569	559574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312289
10012	NC_017566	ATT	2	6	559819	559824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312289
10013	NC_017566	GAA	2	6	559900	559905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312289
10014	NC_017566	TGA	2	6	559997	560002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312289
10015	NC_017566	GTT	2	6	560075	560080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312290
10016	NC_017566	ATT	2	6	560108	560113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312290
10017	NC_017566	TA	3	6	560151	560156	50 %	50 %	0 %	0 %	386312290
10018	NC_017566	A	6	6	560156	560161	100 %	0 %	0 %	0 %	386312290
10019	NC_017566	ATC	2	6	560167	560172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312290
10020	NC_017566	TCGATA	2	12	560380	560391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386312290
10021	NC_017566	GAC	2	6	560414	560419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10022	NC_017566	TC	3	6	560484	560489	0 %	50 %	0 %	50 %	386312290
10023	NC_017566	GTT	2	6	560507	560512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312290
10024	NC_017566	CAG	2	6	560517	560522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10025	NC_017566	TAA	2	6	560564	560569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312290
10026	NC_017566	ATTACA	2	12	560633	560644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386312290
10027	NC_017566	ATCT	2	8	560694	560701	25 %	50 %	0 %	25 %	386312290
10028	NC_017566	GCGTC	2	10	560733	560742	0 %	20 %	40 %	40 %	386312290
10029	NC_017566	GAT	2	6	560840	560845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10030	NC_017566	GCA	2	6	560914	560919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10031	NC_017566	CAG	2	6	561021	561026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10032	NC_017566	TGA	2	6	561029	561034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10033	NC_017566	ATT	2	6	561080	561085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312290
10034	NC_017566	A	6	6	561177	561182	100 %	0 %	0 %	0 %	386312290
10035	NC_017566	GGAT	2	8	561229	561236	25 %	25 %	50 %	0 %	386312290
10036	NC_017566	TTG	2	6	561379	561384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312290
10037	NC_017566	ATG	2	6	561439	561444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10038	NC_017566	GCC	2	6	561504	561509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312290
10039	NC_017566	A	6	6	561521	561526	100 %	0 %	0 %	0 %	386312290
10040	NC_017566	TGC	2	6	561527	561532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10041	NC_017566	TGA	2	6	561590	561595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10042	NC_017566	TGA	2	6	561665	561670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10043	NC_017566	AGC	2	6	561689	561694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10044	NC_017566	TATT	2	8	561844	561851	25 %	75 %	0 %	0 %	386312290
10045	NC_017566	ATA	2	6	562069	562074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312290
10046	NC_017566	CAT	2	6	562290	562295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312290
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10048	NC_017566	ATG	2	6	562489	562494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10049	NC_017566	GATGAG	2	12	562602	562613	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386312290
10050	NC_017566	TTG	2	6	562696	562701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312290
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10052	NC_017566	TGA	2	6	562736	562741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10053	NC_017566	GTC	2	6	562795	562800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10054	NC_017566	CAA	2	6	562815	562820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312290
10055	NC_017566	TGC	2	6	562943	562948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312290
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10057	NC_017566	CAG	2	6	563184	563189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10058	NC_017566	ATG	2	6	563217	563222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312290
10059	NC_017566	GC	3	6	563323	563328	0 %	0 %	50 %	50 %	386312290
10060	NC_017566	CTTTG	2	10	563369	563378	0 %	60 %	20 %	20 %	386312290
10061	NC_017566	AGTG	2	8	563399	563406	25 %	25 %	50 %	0 %	386312290
10062	NC_017566	GTG	2	6	563541	563546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312290
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10070	NC_017566	AGCC	2	8	564007	564014	25 %	0 %	25 %	50 %	386312290
10071	NC_017566	CTG	2	6	564133	564138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312290
10072	NC_017566	TGG	2	6	564222	564227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312291
10073	NC_017566	GCC	2	6	564301	564306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312291
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10077	NC_017566	ACGGGT	2	12	564802	564813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386312291
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10081	NC_017566	GCA	2	6	564968	564973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_017566	AG	3	6	565034	565039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_017566	TTA	2	6	565075	565080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312292
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10085	NC_017566	CAT	2	6	565203	565208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312292
10086	NC_017566	GGTGTG	2	12	565237	565248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312292
10087	NC_017566	A	6	6	565265	565270	100 %	0 %	0 %	0 %	386312292
10088	NC_017566	CGA	2	6	565287	565292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312292
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10090	NC_017566	GGA	2	6	565431	565436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312292
10091	NC_017566	A	7	7	565441	565447	100 %	0 %	0 %	0 %	386312292
10092	NC_017566	GTG	2	6	565507	565512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312292
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10101	NC_017566	TGGC	2	8	565809	565816	0 %	25 %	50 %	25 %	386312292
10102	NC_017566	GCA	2	6	565877	565882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312292
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10105	NC_017566	CGA	2	6	565980	565985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312292
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10107	NC_017566	CAG	2	6	566153	566158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312292
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10110	NC_017566	TGG	2	6	566366	566371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312292
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10113	NC_017566	AGG	2	6	566532	566537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017566	CCA	2	6	566555	566560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_017566	ATC	2	6	566569	566574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_017566	AAC	2	6	566593	566598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_017566	TGGCT	2	10	566628	566637	0 %	40 %	40 %	20 %	386312293
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10119	NC_017566	CAA	2	6	566711	566716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312293
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10233	NC_017566	AATA	2	8	572349	572356	75 %	25 %	0 %	0 %	386312297
10234	NC_017566	TAATC	2	10	572371	572380	40 %	40 %	0 %	20 %	386312297
10235	NC_017566	AAT	2	6	572411	572416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_017566	GTT	2	6	572476	572481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_017566	TGG	2	6	572484	572489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_017566	TTA	2	6	572503	572508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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