MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 65555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65501	NC_017349	TCA	2	6	2748530	2748535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781646
65502	NC_017349	AAT	2	6	2748550	2748555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781646
65503	NC_017349	CTG	2	6	2748621	2748626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781646
65504	NC_017349	CTTG	2	8	2748653	2748660	0 %	50 %	25 %	25 %	387781646
65505	NC_017349	TAA	2	6	2748664	2748669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781646
65506	NC_017349	CCA	2	6	2748722	2748727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387781646
65507	NC_017349	TCA	2	6	2748758	2748763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781646
65508	NC_017349	CTT	2	6	2748768	2748773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781646
65509	NC_017349	TTA	2	6	2748860	2748865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781646
65510	NC_017349	TCT	2	6	2748914	2748919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781646
65511	NC_017349	TCT	2	6	2749002	2749007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781646
65512	NC_017349	CTA	2	6	2749008	2749013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781646
65513	NC_017349	TCT	2	6	2749016	2749021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781646
65514	NC_017349	CAG	2	6	2749035	2749040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781646
65515	NC_017349	TAT	2	6	2749131	2749136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781646
65516	NC_017349	ATT	2	6	2749147	2749152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781646
65517	NC_017349	GAT	2	6	2749160	2749165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781646
65518	NC_017349	CAA	2	6	2749185	2749190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781646
65519	NC_017349	TAA	2	6	2749240	2749245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781646
65520	NC_017349	AGT	2	6	2749294	2749299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781646
65521	NC_017349	CAT	2	6	2749311	2749316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781646
65522	NC_017349	GTT	2	6	2749377	2749382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781646
65523	NC_017349	T	6	6	2749381	2749386	0 %	100 %	0 %	0 %	387781646
65524	NC_017349	GAC	2	6	2749401	2749406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781646
65525	NC_017349	ACC	2	6	2749594	2749599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387781646
65526	NC_017349	AATT	2	8	2749605	2749612	50 %	50 %	0 %	0 %	387781646
65527	NC_017349	CTT	2	6	2749668	2749673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781646
65528	NC_017349	CTT	2	6	2749680	2749685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781646
65529	NC_017349	AAT	2	6	2749699	2749704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781646
65530	NC_017349	TAAT	2	8	2749712	2749719	50 %	50 %	0 %	0 %	387781646
65531	NC_017349	CAT	2	6	2749734	2749739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781646
65532	NC_017349	TA	3	6	2749758	2749763	50 %	50 %	0 %	0 %	387781646
65533	NC_017349	CCT	2	6	2749878	2749883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65534	NC_017349	TTA	2	6	2749913	2749918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65535	NC_017349	CTTCC	2	10	2749987	2749996	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
65536	NC_017349	CTTA	2	8	2750008	2750015	25 %	50 %	0 %	25 %	387781647
65537	NC_017349	TTA	2	6	2750022	2750027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781647
65538	NC_017349	GTC	2	6	2750079	2750084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781647
65539	NC_017349	GCTG	2	8	2750094	2750101	0 %	25 %	50 %	25 %	387781647
65540	NC_017349	AAT	2	6	2750114	2750119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781647
65541	NC_017349	AT	3	6	2750131	2750136	50 %	50 %	0 %	0 %	387781647
65542	NC_017349	T	6	6	2750207	2750212	0 %	100 %	0 %	0 %	387781647
65543	NC_017349	ACA	2	6	2750268	2750273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781647
65544	NC_017349	T	6	6	2750300	2750305	0 %	100 %	0 %	0 %	387781647
65545	NC_017349	AT	3	6	2750306	2750311	50 %	50 %	0 %	0 %	387781647
65546	NC_017349	TTAT	2	8	2750370	2750377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65547	NC_017349	TATT	2	8	2750432	2750439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65548	NC_017349	A	8	8	2750453	2750460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65549	NC_017349	TGA	2	6	2750467	2750472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65550	NC_017349	ACG	3	9	2750510	2750518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781648
65551	NC_017349	GC	3	6	2750519	2750524	0 %	0 %	50 %	50 %	387781648
65552	NC_017349	T	6	6	2750541	2750546	0 %	100 %	0 %	0 %	387781648
65553	NC_017349	ACT	2	6	2750760	2750765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65554	NC_017349	TAC	2	6	2750807	2750812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65555	NC_017349	T	7	7	2750820	2750826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.