MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 65555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017349	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017349	AGA	2	6	171	176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017349	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017349	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017349	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017349	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017349	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017349	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017349	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017349	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017349	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017349	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779218
14	NC_017349	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387779218
15	NC_017349	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387779218
16	NC_017349	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387779218
17	NC_017349	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
18	NC_017349	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387779218
19	NC_017349	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387779218
20	NC_017349	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387779218
21	NC_017349	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	387779218
22	NC_017349	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779218
23	NC_017349	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	387779218
24	NC_017349	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387779218
25	NC_017349	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387779218
26	NC_017349	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779218
27	NC_017349	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779218
28	NC_017349	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779218
29	NC_017349	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
30	NC_017349	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387779218
31	NC_017349	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
32	NC_017349	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387779218
33	NC_017349	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387779218
34	NC_017349	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
35	NC_017349	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
36	NC_017349	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387779218
37	NC_017349	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	387779218
38	NC_017349	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387779218
39	NC_017349	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779218
40	NC_017349	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387779218
41	NC_017349	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	387779218
42	NC_017349	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	387779218
43	NC_017349	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	387779218
44	NC_017349	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
45	NC_017349	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387779218
46	NC_017349	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	387779218
47	NC_017349	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	387779218
48	NC_017349	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
49	NC_017349	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779218
50	NC_017349	TA	3	6	1908	1913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017349	TAA	3	9	1921	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017349	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017349	AC	3	6	2009	2014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017349	CCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017349	CTA	3	9	2090	2098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017349	TA	3	6	2118	2123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017349	TA	4	8	2126	2133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017349	TAAT	2	8	2152	2159	50 %	50 %	0 %	0 %	387779219
59	NC_017349	ATT	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779219
60	NC_017349	TTA	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779219
61	NC_017349	AAC	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387779219
62	NC_017349	AGT	2	6	2382	2387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779219
63	NC_017349	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387779219
64	NC_017349	A	7	7	2418	2424	100 %	0 %	0 %	0 %	387779219
65	NC_017349	ATTA	2	8	2472	2479	50 %	50 %	0 %	0 %	387779219
66	NC_017349	AATTT	2	10	2495	2504	40 %	60 %	0 %	0 %	387779219
67	NC_017349	TTA	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779219
68	NC_017349	CAATT	2	10	2561	2570	40 %	40 %	0 %	20 %	387779219
69	NC_017349	AGA	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779219
70	NC_017349	TCA	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387779219
71	NC_017349	TAAA	2	8	2789	2796	75 %	25 %	0 %	0 %	387779219
72	NC_017349	GAA	2	6	2812	2817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779219
73	NC_017349	TCT	2	6	2828	2833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387779219
74	NC_017349	TTTA	2	8	2850	2857	25 %	75 %	0 %	0 %	387779219
75	NC_017349	ATT	2	6	2886	2891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779219
76	NC_017349	ACA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387779219
77	NC_017349	AAATT	2	10	2939	2948	60 %	40 %	0 %	0 %	387779219
78	NC_017349	TTA	2	6	2995	3000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779219
79	NC_017349	GGT	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387779219
80	NC_017349	TTA	2	6	3023	3028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779219
81	NC_017349	TGA	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779219
82	NC_017349	GTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387779219
83	NC_017349	TCT	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387779219
84	NC_017349	AGA	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779219
85	NC_017349	GGT	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387779219
86	NC_017349	TTCA	2	8	3138	3145	25 %	50 %	0 %	25 %	387779219
87	NC_017349	AT	3	6	3153	3158	50 %	50 %	0 %	0 %	387779219
88	NC_017349	GATG	2	8	3159	3166	25 %	25 %	50 %	0 %	387779219
89	NC_017349	ATG	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779219
90	NC_017349	GTTGAA	2	12	3193	3204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779219
91	NC_017349	TTC	2	6	3205	3210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387779219
92	NC_017349	GAC	2	6	3247	3252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387779219
93	NC_017349	AATT	2	8	3263	3270	50 %	50 %	0 %	0 %	387779219
94	NC_017349	ATAAAT	2	12	3294	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017349	ATTA	2	8	3319	3326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017349	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017349	AAAT	2	8	3376	3383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017349	TAA	2	6	3449	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017349	TTTAAA	2	12	3471	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017349	A	6	6	3539	3544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017349	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017349	AATT	2	8	3575	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017349	A	7	7	3631	3637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017349	AT	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017349	ATT	2	6	3675	3680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017349	AAG	2	6	3688	3693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779220
107	NC_017349	GTA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779220
108	NC_017349	ATT	2	6	3744	3749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779220
109	NC_017349	TGG	2	6	3755	3760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387779220
110	NC_017349	ATTA	2	8	3794	3801	50 %	50 %	0 %	0 %	387779220
111	NC_017349	TTCT	2	8	3884	3891	0 %	75 %	0 %	25 %	387779220
112	NC_017349	TCAT	2	8	3895	3902	25 %	50 %	0 %	25 %	387779220
113	NC_017349	ATG	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779221
114	NC_017349	A	6	6	4178	4183	100 %	0 %	0 %	0 %	387779221
115	NC_017349	GTC	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387779221
116	NC_017349	AT	3	6	4231	4236	50 %	50 %	0 %	0 %	387779221
117	NC_017349	AGA	2	6	4267	4272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779221
118	NC_017349	CTC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387779221
119	NC_017349	GAC	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387779221
120	NC_017349	CTG	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387779221
121	NC_017349	AAT	2	6	4394	4399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387779221
122	NC_017349	A	7	7	4425	4431	100 %	0 %	0 %	0 %	387779221
123	NC_017349	CAG	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387779221
124	NC_017349	ATT	2	6	4584	4589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779221
125	NC_017349	GAA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779221
126	NC_017349	ATA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387779221
127	NC_017349	GAT	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779221
128	NC_017349	TTA	3	9	4850	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779221
129	NC_017349	GAT	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779221
130	NC_017349	TTA	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779221
131	NC_017349	ACA	2	6	5061	5066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387779222
132	NC_017349	GTAT	2	8	5133	5140	25 %	50 %	25 %	0 %	387779222
133	NC_017349	AG	4	8	5155	5162	50 %	0 %	50 %	0 %	387779222
134	NC_017349	ATA	2	6	5193	5198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387779222
135	NC_017349	CAAAT	2	10	5226	5235	60 %	20 %	0 %	20 %	387779222
136	NC_017349	GTT	2	6	5240	5245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387779222
137	NC_017349	A	6	6	5310	5315	100 %	0 %	0 %	0 %	387779222
138	NC_017349	TGG	2	6	5359	5364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387779222
139	NC_017349	CGG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387779222
140	NC_017349	TGG	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387779222
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143	NC_017349	TCA	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387779222
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