MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus T0131 chromosome

Total Repeats: 69566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69502	NC_017347	TCTTCA	2	12	2911146	2911157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384871296
69503	NC_017347	TTG	2	6	2911175	2911180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384871296
69504	NC_017347	CAG	2	6	2911219	2911224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384871296
69505	NC_017347	TG	3	6	2911258	2911263	0 %	50 %	50 %	0 %	384871296
69506	NC_017347	AAC	2	6	2911313	2911318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384871296
69507	NC_017347	CAC	2	6	2911405	2911410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384871296
69508	NC_017347	CAT	2	6	2911468	2911473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384871296
69509	NC_017347	CCT	2	6	2911495	2911500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69510	NC_017347	CTT	2	6	2911520	2911525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69511	NC_017347	TCA	2	6	2911596	2911601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384871297
69512	NC_017347	AAT	2	6	2911616	2911621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384871297
69513	NC_017347	CTG	2	6	2911687	2911692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384871297
69514	NC_017347	CTTG	2	8	2911719	2911726	0 %	50 %	25 %	25 %	384871297
69515	NC_017347	TAA	2	6	2911730	2911735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384871297
69516	NC_017347	CCA	2	6	2911788	2911793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384871297
69517	NC_017347	TCA	2	6	2911824	2911829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384871297
69518	NC_017347	CTT	2	6	2911834	2911839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384871297
69519	NC_017347	TTA	2	6	2911926	2911931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384871297
69520	NC_017347	TCT	2	6	2911980	2911985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384871297
69521	NC_017347	TCT	2	6	2912068	2912073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384871297
69522	NC_017347	CTA	2	6	2912074	2912079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384871297
69523	NC_017347	TCT	2	6	2912082	2912087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384871297
69524	NC_017347	CAG	2	6	2912101	2912106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384871297
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69531	NC_017347	CAT	2	6	2912377	2912382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384871297
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69533	NC_017347	T	6	6	2912447	2912452	0 %	100 %	0 %	0 %	384871297
69534	NC_017347	GAC	2	6	2912467	2912472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384871297
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69537	NC_017347	CTT	2	6	2912734	2912739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384871297
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69540	NC_017347	TAAT	2	8	2912778	2912785	50 %	50 %	0 %	0 %	384871297
69541	NC_017347	CAT	2	6	2912800	2912805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384871297
69542	NC_017347	TA	3	6	2912824	2912829	50 %	50 %	0 %	0 %	384871297
69543	NC_017347	CCT	2	6	2912944	2912949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69544	NC_017347	ATT	2	6	2912978	2912983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69545	NC_017347	GT	3	6	2913030	2913035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69546	NC_017347	CT	3	6	2913054	2913059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69547	NC_017347	CTTA	2	8	2913075	2913082	25 %	50 %	0 %	25 %	384871298
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69551	NC_017347	AT	3	6	2913198	2913203	50 %	50 %	0 %	0 %	384871298
69552	NC_017347	T	6	6	2913274	2913279	0 %	100 %	0 %	0 %	384871298
69553	NC_017347	TAT	2	6	2913318	2913323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384871298
69554	NC_017347	ACA	2	6	2913335	2913340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384871298
69555	NC_017347	T	6	6	2913367	2913372	0 %	100 %	0 %	0 %	384871298
69556	NC_017347	AT	3	6	2913373	2913378	50 %	50 %	0 %	0 %	384871298
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69559	NC_017347	A	7	7	2913520	2913526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69560	NC_017347	TGA	2	6	2913533	2913538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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69563	NC_017347	T	6	6	2913607	2913612	0 %	100 %	0 %	0 %	384871299
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69565	NC_017347	TAC	2	6	2913873	2913878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69566	NC_017347	T	7	7	2913886	2913892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.