MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	T	6	6	19	24	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017345	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017345	TA	3	6	37	42	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017345	A	6	6	68	73	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017345	AAT	3	9	124	132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017345	T	6	6	167	172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017345	ATA	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017345	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017345	ATA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017345	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017345	ATTT	2	8	304	311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017345	TAA	2	6	361	366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017345	TAT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017345	TAA	2	6	417	422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017345	ACA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017345	TTTA	2	8	496	503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017345	GAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017345	A	6	6	545	550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017345	A	7	7	552	558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017345	TC	3	6	564	569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017345	CCA	2	6	638	643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017345	GTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017345	A	7	7	706	712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017345	T	6	6	723	728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017345	TACA	2	8	762	769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017345	TA	3	6	794	799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017345	CAT	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017345	T	7	7	835	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017345	AT	4	8	861	868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017345	T	10	10	868	877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017345	A	7	7	936	942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017345	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017345	CGT	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017345	ACCT	2	8	1090	1097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017345	A	6	6	1100	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017345	ATTTTA	2	12	1121	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017345	T	6	6	1133	1138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017345	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017345	TACT	2	8	1174	1181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017345	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017345	A	7	7	1315	1321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017345	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017345	TCA	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017345	AAC	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017345	AAAT	2	8	1381	1388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017345	AAAT	2	8	1396	1403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017345	ACC	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017345	GGT	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017345	T	7	7	1475	1481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017345	TTC	3	9	1486	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017345	ATA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017345	A	6	6	1601	1606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017345	ATA	2	6	1631	1636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017345	CTAG	2	8	1648	1655	25 %	25 %	25 %	25 %	384868561
55	NC_017345	ATG	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
56	NC_017345	TA	3	6	1718	1723	50 %	50 %	0 %	0 %	384868561
57	NC_017345	GAT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
58	NC_017345	ATT	2	6	1827	1832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868561
59	NC_017345	TAA	2	6	1955	1960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
60	NC_017345	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
61	NC_017345	ATAA	2	8	2051	2058	75 %	25 %	0 %	0 %	384868561
62	NC_017345	TAA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
63	NC_017345	GCTT	2	8	2113	2120	0 %	50 %	25 %	25 %	384868561
64	NC_017345	TTC	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868561
65	NC_017345	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868561
66	NC_017345	ATG	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
67	NC_017345	TC	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	384868561
68	NC_017345	AT	3	6	2225	2230	50 %	50 %	0 %	0 %	384868561
69	NC_017345	TAG	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
70	NC_017345	AAT	2	6	2309	2314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
71	NC_017345	T	6	6	2332	2337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017345	TAT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017345	TAAAAA	2	12	2410	2421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017345	CCGA	2	8	2466	2473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017345	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
76	NC_017345	GTTG	2	8	2614	2621	0 %	50 %	50 %	0 %	384868562
77	NC_017345	CAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868562
78	NC_017345	A	6	6	2639	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	384868562
79	NC_017345	CTAA	2	8	2685	2692	50 %	25 %	0 %	25 %	384868562
80	NC_017345	TTG	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
81	NC_017345	TAA	2	6	2771	2776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868562
82	NC_017345	A	7	7	2840	2846	100 %	0 %	0 %	0 %	384868562
83	NC_017345	TA	3	6	2853	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	384868562
84	NC_017345	AAG	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
85	NC_017345	TGT	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
86	NC_017345	T	6	6	3014	3019	0 %	100 %	0 %	0 %	384868562
87	NC_017345	TGACGA	2	12	3023	3034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384868562
88	NC_017345	A	7	7	3034	3040	100 %	0 %	0 %	0 %	384868562
89	NC_017345	TGG	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868562
90	NC_017345	TAATT	2	10	3155	3164	40 %	60 %	0 %	0 %	384868562
91	NC_017345	TGA	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868562
92	NC_017345	GAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
93	NC_017345	ATT	3	9	3247	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868562
94	NC_017345	TGA	2	6	3267	3272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017345	T	6	6	3281	3286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017345	T	6	6	3292	3297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017345	A	6	6	3300	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017345	TGTA	2	8	3333	3340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017345	TAT	2	6	3427	3432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017345	A	6	6	3597	3602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017345	TTTG	2	8	3627	3634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017345	AT	3	6	3645	3650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017345	T	6	6	3792	3797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017345	T	6	6	3809	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
105	NC_017345	TTTA	2	8	3824	3831	25 %	75 %	0 %	0 %	384868563
106	NC_017345	ATT	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868563
107	NC_017345	T	7	7	3853	3859	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
108	NC_017345	T	6	6	3864	3869	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
109	NC_017345	T	6	6	3927	3932	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
110	NC_017345	T	7	7	3936	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
111	NC_017345	A	7	7	3966	3972	100 %	0 %	0 %	0 %	384868563
112	NC_017345	GAC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868563
113	NC_017345	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017345	TA	3	6	4170	4175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017345	CAT	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017345	GCTA	2	8	4237	4244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017345	T	6	6	4287	4292	0 %	100 %	0 %	0 %	384868564
118	NC_017345	TTTTC	2	10	4322	4331	0 %	80 %	0 %	20 %	384868564
119	NC_017345	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	384868564
120	NC_017345	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868564
121	NC_017345	TAT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
122	NC_017345	TAG	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868564
123	NC_017345	TAT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
124	NC_017345	TTAGA	2	10	4448	4457	40 %	40 %	20 %	0 %	384868564
125	NC_017345	T	7	7	4480	4486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017345	ATTTT	2	10	4494	4503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017345	TA	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017345	CAAGA	2	10	4585	4594	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017345	CT	3	6	4636	4641	0 %	50 %	0 %	50 %	384868565
130	NC_017345	TAA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
131	NC_017345	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
132	NC_017345	TA	3	6	4710	4715	50 %	50 %	0 %	0 %	384868565
133	NC_017345	ATG	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868565
134	NC_017345	AC	3	6	4778	4783	50 %	0 %	0 %	50 %	384868565
135	NC_017345	TCT	2	6	4790	4795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
136	NC_017345	ATA	2	6	4806	4811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
137	NC_017345	TCT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
138	NC_017345	T	6	6	4839	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	384868565
139	NC_017345	ATC	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868565
140	NC_017345	A	6	6	4883	4888	100 %	0 %	0 %	0 %	384868565
141	NC_017345	ATCAC	2	10	4925	4934	40 %	20 %	0 %	40 %	384868565
142	NC_017345	AAT	3	9	5014	5022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
143	NC_017345	TA	3	6	5038	5043	50 %	50 %	0 %	0 %	384868566
144	NC_017345	AAT	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
145	NC_017345	CAA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
146	NC_017345	AAG	2	6	5129	5134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868566
147	NC_017345	AAAATT	2	12	5135	5146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
148	NC_017345	AGTA	2	8	5161	5168	50 %	25 %	25 %	0 %	384868566
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