MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_017342	TTGAT	2	10	1218687	1218696	20 %	60 %	20 %	0 %	384867030
28503	NC_017342	TGAT	2	8	1218699	1218706	25 %	50 %	25 %	0 %	384867030
28504	NC_017342	CTT	2	6	1218743	1218748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384867030
28505	NC_017342	AAC	2	6	1218795	1218800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384867030
28506	NC_017342	TCG	2	6	1218823	1218828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384867030
28507	NC_017342	ATCA	2	8	1218873	1218880	50 %	25 %	0 %	25 %	384867030
28508	NC_017342	TTTTG	2	10	1218967	1218976	0 %	80 %	20 %	0 %	384867030
28509	NC_017342	ATAG	2	8	1218991	1218998	50 %	25 %	25 %	0 %	384867030
28510	NC_017342	CTT	2	6	1219007	1219012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384867030
28511	NC_017342	CATTA	2	10	1219104	1219113	40 %	40 %	0 %	20 %	384867030
28512	NC_017342	ACG	2	6	1219141	1219146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384867030
28513	NC_017342	GCA	2	6	1219180	1219185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384867030
28514	NC_017342	CAT	2	6	1219232	1219237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867030
28515	NC_017342	GTA	2	6	1219256	1219261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384867030
28516	NC_017342	CAC	2	6	1219265	1219270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384867030
28517	NC_017342	AATA	2	8	1219282	1219289	75 %	25 %	0 %	0 %	384867030
28518	NC_017342	CTA	2	6	1219316	1219321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867030
28519	NC_017342	T	6	6	1219355	1219360	0 %	100 %	0 %	0 %	384867030
28520	NC_017342	GTT	2	6	1219367	1219372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384867030
28521	NC_017342	TAAAT	3	15	1219466	1219480	60 %	40 %	0 %	0 %	384867031
28522	NC_017342	ATCTC	2	10	1219654	1219663	20 %	40 %	0 %	40 %	384867031
28523	NC_017342	CCA	2	6	1219687	1219692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384867031
28524	NC_017342	TAAT	2	8	1219760	1219767	50 %	50 %	0 %	0 %	384867031
28525	NC_017342	CAA	2	6	1219793	1219798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384867031
28526	NC_017342	ACG	2	6	1219867	1219872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384867031
28527	NC_017342	TCA	2	6	1219915	1219920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867031
28528	NC_017342	CGC	2	6	1219973	1219978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384867031
28529	NC_017342	TAA	2	6	1219985	1219990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384867031
28530	NC_017342	AGAT	2	8	1220021	1220028	50 %	25 %	25 %	0 %	384867031
28531	NC_017342	CAT	2	6	1220042	1220047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867031
28532	NC_017342	AG	3	6	1220059	1220064	50 %	0 %	50 %	0 %	384867031
28533	NC_017342	TCTT	2	8	1220158	1220165	0 %	75 %	0 %	25 %	384867031
28534	NC_017342	TAA	2	6	1220177	1220182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384867031
28535	NC_017342	CCA	2	6	1220194	1220199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384867031
28536	NC_017342	CAT	2	6	1220210	1220215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867031
28537	NC_017342	GCGT	2	8	1220258	1220265	0 %	25 %	50 %	25 %	384867031
28538	NC_017342	ACC	2	6	1220352	1220357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384867031
28539	NC_017342	CAT	2	6	1220381	1220386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867031
28540	NC_017342	GCT	2	6	1220455	1220460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384867031
28541	NC_017342	ACTG	2	8	1220487	1220494	25 %	25 %	25 %	25 %	384867031
28542	NC_017342	GGCA	2	8	1220594	1220601	25 %	0 %	50 %	25 %	384867031
28543	NC_017342	TTC	2	6	1220622	1220627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384867031
28544	NC_017342	CTT	2	6	1220642	1220647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384867031
28545	NC_017342	TGA	2	6	1220673	1220678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384867031
28546	NC_017342	CCA	2	6	1220725	1220730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384867031
28547	NC_017342	GCT	2	6	1220764	1220769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384867031
28548	NC_017342	AAT	2	6	1220862	1220867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384867031
28549	NC_017342	CAT	2	6	1220918	1220923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867031
28550	NC_017342	AATGG	2	10	1220947	1220956	40 %	20 %	40 %	0 %	384867031
28551	NC_017342	CTT	2	6	1220975	1220980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384867031
28552	NC_017342	CT	3	6	1220997	1221002	0 %	50 %	0 %	50 %	384867031
28553	NC_017342	GC	3	6	1221086	1221091	0 %	0 %	50 %	50 %	384867031
28554	NC_017342	CTT	2	6	1221109	1221114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384867031
28555	NC_017342	T	6	6	1221135	1221140	0 %	100 %	0 %	0 %	384867031
28556	NC_017342	TAA	2	6	1221203	1221208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28557	NC_017342	A	7	7	1221235	1221241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28558	NC_017342	ATT	2	6	1221251	1221256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28559	NC_017342	TAA	2	6	1221341	1221346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28560	NC_017342	AAT	3	9	1221347	1221355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28561	NC_017342	TAT	2	6	1221400	1221405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28562	NC_017342	TA	3	6	1221423	1221428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28563	NC_017342	ATTTA	2	10	1221466	1221475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28564	NC_017342	CAA	2	6	1221496	1221501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384867032
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28566	NC_017342	ATA	2	6	1221649	1221654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384867033
28567	NC_017342	GATAAA	2	12	1221671	1221682	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384867033
28568	NC_017342	ATGAA	2	10	1221691	1221700	60 %	20 %	20 %	0 %	384867033
28569	NC_017342	GTG	2	6	1221736	1221741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384867033
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28572	NC_017342	A	6	6	1221869	1221874	100 %	0 %	0 %	0 %	384867033
28573	NC_017342	CAT	2	6	1221885	1221890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867033
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28578	NC_017342	GTT	2	6	1222061	1222066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384867033
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28585	NC_017342	ATT	2	6	1222434	1222439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384867034
28586	NC_017342	GAC	2	6	1222460	1222465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384867034
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28588	NC_017342	AT	3	6	1222530	1222535	50 %	50 %	0 %	0 %	384867034
28589	NC_017342	T	6	6	1222557	1222562	0 %	100 %	0 %	0 %	384867034
28590	NC_017342	AGA	2	6	1222563	1222568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384867034
28591	NC_017342	ACCA	2	8	1222574	1222581	50 %	0 %	0 %	50 %	384867034
28592	NC_017342	TTTA	2	8	1222582	1222589	25 %	75 %	0 %	0 %	384867034
28593	NC_017342	GAT	2	6	1222618	1222623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384867034
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28595	NC_017342	GATA	2	8	1222677	1222684	50 %	25 %	25 %	0 %	384867034
28596	NC_017342	TACA	2	8	1222697	1222704	50 %	25 %	0 %	25 %	384867034
28597	NC_017342	AG	3	6	1222779	1222784	50 %	0 %	50 %	0 %	384867035
28598	NC_017342	AGA	2	6	1222793	1222798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384867035
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28600	NC_017342	ATT	2	6	1222926	1222931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384867035
28601	NC_017342	GAT	2	6	1222989	1222994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384867035
28602	NC_017342	TGTGA	2	10	1223061	1223070	20 %	40 %	40 %	0 %	384867035
28603	NC_017342	TAA	3	9	1223090	1223098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384867035
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28606	NC_017342	AT	3	6	1223213	1223218	50 %	50 %	0 %	0 %	384867036
28607	NC_017342	TGA	2	6	1223244	1223249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384867036
28608	NC_017342	A	6	6	1223268	1223273	100 %	0 %	0 %	0 %	384867036
28609	NC_017342	AAC	3	9	1223379	1223387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384867036
28610	NC_017342	TCA	2	6	1223541	1223546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384867036
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28612	NC_017342	AGA	2	6	1223577	1223582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384867036
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28616	NC_017342	TTGG	2	8	1223808	1223815	0 %	50 %	50 %	0 %	384867036
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