MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017342	GTT	2	6	666334	666339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866486
15503	NC_017342	GTA	2	6	666349	666354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866486
15504	NC_017342	ATTT	2	8	666396	666403	25 %	75 %	0 %	0 %	384866486
15505	NC_017342	ACG	2	6	666440	666445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866486
15506	NC_017342	TGA	2	6	666569	666574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866486
15507	NC_017342	GGC	2	6	666582	666587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384866486
15508	NC_017342	AGC	2	6	666635	666640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866486
15509	NC_017342	ATT	2	6	666658	666663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866486
15510	NC_017342	A	6	6	666733	666738	100 %	0 %	0 %	0 %	384866486
15511	NC_017342	CAA	2	6	666864	666869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866486
15512	NC_017342	TAA	2	6	666890	666895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866486
15513	NC_017342	AGGC	2	8	666952	666959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15514	NC_017342	TTAT	2	8	667042	667049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_017342	ATC	2	6	667050	667055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_017342	CAT	2	6	667121	667126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866487
15517	NC_017342	TCA	2	6	667234	667239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866487
15518	NC_017342	TCT	2	6	667311	667316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866487
15519	NC_017342	TG	3	6	667335	667340	0 %	50 %	50 %	0 %	384866487
15520	NC_017342	TGT	2	6	667345	667350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866487
15521	NC_017342	T	7	7	667366	667372	0 %	100 %	0 %	0 %	384866487
15522	NC_017342	ATT	2	6	667448	667453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_017342	AT	3	6	667471	667476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_017342	CTT	2	6	667477	667482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_017342	TAA	2	6	667500	667505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_017342	ATG	2	6	667587	667592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866488
15527	NC_017342	TGA	2	6	667659	667664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866488
15528	NC_017342	CAT	2	6	667695	667700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866488
15529	NC_017342	CGC	2	6	667727	667732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384866488
15530	NC_017342	TTTG	2	8	667759	667766	0 %	75 %	25 %	0 %	384866488
15531	NC_017342	GAC	2	6	667811	667816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866488
15532	NC_017342	CTT	2	6	667829	667834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866488
15533	NC_017342	TTA	2	6	667840	667845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866488
15534	NC_017342	GAT	2	6	667887	667892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866488
15535	NC_017342	T	6	6	667995	668000	0 %	100 %	0 %	0 %	384866488
15536	NC_017342	TGT	2	6	668004	668009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866488
15537	NC_017342	CGT	2	6	668105	668110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866488
15538	NC_017342	TA	3	6	668133	668138	50 %	50 %	0 %	0 %	384866488
15539	NC_017342	ATT	2	6	668250	668255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866488
15540	NC_017342	CAT	2	6	668279	668284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866488
15541	NC_017342	TAA	2	6	668289	668294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866488
15542	NC_017342	ACC	2	6	668343	668348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866488
15543	NC_017342	GCT	2	6	668416	668421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866488
15544	NC_017342	CGTA	2	8	668438	668445	25 %	25 %	25 %	25 %	384866488
15545	NC_017342	CGA	2	6	668498	668503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866488
15546	NC_017342	TAGT	2	8	668549	668556	25 %	50 %	25 %	0 %	384866488
15547	NC_017342	TAAT	2	8	668597	668604	50 %	50 %	0 %	0 %	384866488
15548	NC_017342	AT	3	6	668661	668666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_017342	AT	3	6	668672	668677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_017342	ATC	2	6	668774	668779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15551	NC_017342	ATA	2	6	668793	668798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_017342	ATGA	2	8	668830	668837	50 %	25 %	25 %	0 %	384866489
15553	NC_017342	AGTG	2	8	668886	668893	25 %	25 %	50 %	0 %	384866489
15554	NC_017342	ACGGAT	2	12	668926	668937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384866489
15555	NC_017342	TGC	2	6	668982	668987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866489
15556	NC_017342	TGA	2	6	669080	669085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866489
15557	NC_017342	AGA	2	6	669093	669098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866489
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15561	NC_017342	GTC	2	6	669437	669442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866489
15562	NC_017342	TGG	2	6	669510	669515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866489
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15564	NC_017342	TAA	2	6	669543	669548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866489
15565	NC_017342	TATT	2	8	669601	669608	25 %	75 %	0 %	0 %	384866489
15566	NC_017342	ACA	2	6	669685	669690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866489
15567	NC_017342	TTA	2	6	669697	669702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_017342	ATA	3	9	669715	669723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_017342	T	6	6	669782	669787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_017342	TTG	2	6	669789	669794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_017342	AAAAT	2	10	669796	669805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_017342	AAT	2	6	669919	669924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_017342	AT	3	6	669977	669982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_017342	TAA	2	6	669995	670000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_017342	AAT	2	6	670007	670012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15593	NC_017342	GAT	2	6	670619	670624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866491
15594	NC_017342	GAA	2	6	670639	670644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866491
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15603	NC_017342	ATA	2	6	670920	670925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866492
15604	NC_017342	TATT	2	8	670991	670998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_017342	AAAT	2	8	671011	671018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_017342	GAT	2	6	671078	671083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_017342	TCAT	2	8	671095	671102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15608	NC_017342	TAA	2	6	671136	671141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_017342	A	6	6	671140	671145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_017342	ATT	2	6	671251	671256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_017342	CAT	2	6	671317	671322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866493
15612	NC_017342	TAT	2	6	671331	671336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866493
15613	NC_017342	CGGTGC	2	12	671337	671348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384866493
15614	NC_017342	AGGTAT	2	12	671352	671363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866493
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15616	NC_017342	CATT	2	8	671428	671435	25 %	50 %	0 %	25 %	384866493
15617	NC_017342	CAT	2	6	671471	671476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866493
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15620	NC_017342	GAT	2	6	671656	671661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866493
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15993	NC_017342	GTA	2	6	688581	688586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866510
15994	NC_017342	TA	3	6	688590	688595	50 %	50 %	0 %	0 %	384866510
15995	NC_017342	ATT	2	6	688632	688637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866510
15996	NC_017342	TAC	2	6	688672	688677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866510
15997	NC_017342	ATC	2	6	688717	688722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866511
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