MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017342	GTG	2	6	642298	642303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866462
15002	NC_017342	CAT	2	6	642304	642309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866462
15003	NC_017342	CAT	2	6	642320	642325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866462
15004	NC_017342	TGA	2	6	642326	642331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866462
15005	NC_017342	CAA	2	6	642368	642373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866462
15006	NC_017342	AT	3	6	642390	642395	50 %	50 %	0 %	0 %	384866462
15007	NC_017342	GCA	2	6	642403	642408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866462
15008	NC_017342	A	6	6	642415	642420	100 %	0 %	0 %	0 %	384866462
15009	NC_017342	TGG	2	6	642501	642506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866462
15010	NC_017342	TTATTT	2	12	642566	642577	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384866462
15011	NC_017342	ATG	2	6	642580	642585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866462
15012	NC_017342	AAG	2	6	642650	642655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866462
15013	NC_017342	AGA	3	9	642690	642698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866462
15014	NC_017342	ATG	2	6	642726	642731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_017342	TATT	2	8	642795	642802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_017342	TCA	2	6	642847	642852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_017342	ATC	2	6	642859	642864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_017342	GTT	2	6	642871	642876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_017342	AATTTT	2	12	642883	642894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866463
15020	NC_017342	AGA	2	6	642902	642907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866463
15021	NC_017342	TAA	2	6	642981	642986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866463
15022	NC_017342	TG	3	6	643018	643023	0 %	50 %	50 %	0 %	384866463
15023	NC_017342	ATA	2	6	643074	643079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866463
15024	NC_017342	T	6	6	643130	643135	0 %	100 %	0 %	0 %	384866463
15025	NC_017342	TGT	2	6	643185	643190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866463
15026	NC_017342	TTG	2	6	643211	643216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866463
15027	NC_017342	TGA	2	6	643284	643289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866463
15028	NC_017342	TCA	2	6	643296	643301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866463
15029	NC_017342	TGTC	2	8	643376	643383	0 %	50 %	25 %	25 %	384866463
15030	NC_017342	AATT	2	8	643390	643397	50 %	50 %	0 %	0 %	384866463
15031	NC_017342	TTG	2	6	643421	643426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866463
15032	NC_017342	TGTT	2	8	643428	643435	0 %	75 %	25 %	0 %	384866463
15033	NC_017342	TCA	2	6	643447	643452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866463
15034	NC_017342	CAT	2	6	643466	643471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866463
15035	NC_017342	AAAT	2	8	643485	643492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_017342	A	7	7	643518	643524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_017342	TAAA	2	8	643566	643573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_017342	GTT	2	6	643606	643611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_017342	TAAA	2	8	643666	643673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_017342	GTT	2	6	643695	643700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_017342	AT	3	6	643735	643740	50 %	50 %	0 %	0 %	384866464
15042	NC_017342	AAG	2	6	643803	643808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15043	NC_017342	CTG	2	6	643905	643910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866464
15044	NC_017342	A	6	6	643922	643927	100 %	0 %	0 %	0 %	384866464
15045	NC_017342	AGA	2	6	644008	644013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15046	NC_017342	GAT	2	6	644030	644035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866464
15047	NC_017342	TGG	2	6	644080	644085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866464
15048	NC_017342	TGAT	2	8	644091	644098	25 %	50 %	25 %	0 %	384866464
15049	NC_017342	TTA	2	6	644180	644185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866464
15050	NC_017342	CAT	2	6	644190	644195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866464
15051	NC_017342	GTT	2	6	644223	644228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866464
15052	NC_017342	AAC	2	6	644263	644268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866464
15053	NC_017342	GAA	2	6	644291	644296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15054	NC_017342	TGC	2	6	644434	644439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866464
15055	NC_017342	TAA	2	6	644440	644445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866464
15056	NC_017342	TGA	2	6	644497	644502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866464
15057	NC_017342	TGG	2	6	644539	644544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866464
15058	NC_017342	CAG	2	6	644571	644576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866464
15059	NC_017342	AGCA	2	8	644619	644626	50 %	0 %	25 %	25 %	384866464
15060	NC_017342	A	7	7	644642	644648	100 %	0 %	0 %	0 %	384866464
15061	NC_017342	TAA	2	6	644713	644718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866464
15062	NC_017342	CAA	2	6	644757	644762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866464
15063	NC_017342	TGG	2	6	644770	644775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866464
15064	NC_017342	TTC	2	6	644813	644818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866464
15065	NC_017342	AAG	2	6	644865	644870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15066	NC_017342	AAG	2	6	644916	644921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15067	NC_017342	TA	3	6	644944	644949	50 %	50 %	0 %	0 %	384866464
15068	NC_017342	ACAA	2	8	645078	645085	75 %	0 %	0 %	25 %	384866464
15069	NC_017342	AAG	2	6	645111	645116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15070	NC_017342	AGA	2	6	645121	645126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866464
15071	NC_017342	ACAAAT	2	12	645152	645163	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384866464
15072	NC_017342	TTTGT	2	10	645239	645248	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_017342	TTGA	2	8	645264	645271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_017342	ATT	2	6	645303	645308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_017342	ACA	2	6	645429	645434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_017342	AAAT	2	8	645465	645472	75 %	25 %	0 %	0 %	384866465
15077	NC_017342	TCA	2	6	645485	645490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866465
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15082	NC_017342	ATTT	2	8	645593	645600	25 %	75 %	0 %	0 %	384866465
15083	NC_017342	CTG	2	6	645611	645616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866465
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15086	NC_017342	A	6	6	645854	645859	100 %	0 %	0 %	0 %	384866465
15087	NC_017342	ATG	2	6	645896	645901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866465
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15089	NC_017342	AGA	2	6	646156	646161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866465
15090	NC_017342	TAC	2	6	646256	646261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866465
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15092	NC_017342	ATG	2	6	646571	646576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866465
15093	NC_017342	AAATC	2	10	646652	646661	60 %	20 %	0 %	20 %	384866465
15094	NC_017342	ATT	2	6	646697	646702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866465
15095	NC_017342	AGA	3	9	646710	646718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866465
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15097	NC_017342	TGG	2	6	646791	646796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866465
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15102	NC_017342	ATT	2	6	647096	647101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866465
15103	NC_017342	ATG	2	6	647117	647122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866465
15104	NC_017342	TAAA	2	8	647157	647164	75 %	25 %	0 %	0 %	384866465
15105	NC_017342	TAG	2	6	647171	647176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_017342	TATTG	2	10	647194	647203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_017342	T	6	6	647213	647218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_017342	TGT	2	6	647246	647251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_017342	GT	3	6	647261	647266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017342	TGA	2	6	647304	647309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017342	GACA	2	8	647325	647332	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15112	NC_017342	TA	3	6	647412	647417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_017342	GA	3	6	647426	647431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_017342	AT	3	6	647455	647460	50 %	50 %	0 %	0 %	384866466
15115	NC_017342	GAT	2	6	647474	647479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866466
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15117	NC_017342	ATTC	2	8	647523	647530	25 %	50 %	0 %	25 %	384866466
15118	NC_017342	TCA	2	6	647572	647577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866466
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15120	NC_017342	AAT	2	6	647763	647768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866467
15121	NC_017342	AAG	2	6	647832	647837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866467
15122	NC_017342	TAAT	2	8	647852	647859	50 %	50 %	0 %	0 %	384866467
15123	NC_017342	GAAT	2	8	647868	647875	50 %	25 %	25 %	0 %	384866467
15124	NC_017342	AAATG	2	10	647911	647920	60 %	20 %	20 %	0 %	384866468
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15131	NC_017342	TA	3	6	648081	648086	50 %	50 %	0 %	0 %	384866468
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15137	NC_017342	ATGTC	2	10	648420	648429	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15237	NC_017342	AAT	2	6	653531	653536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_017342	TTAA	2	8	653544	653551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15243	NC_017342	ATAG	2	8	653721	653728	50 %	25 %	25 %	0 %	384866473
15244	NC_017342	AAAT	2	8	653768	653775	75 %	25 %	0 %	0 %	384866473
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