MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017342	T	6	6	619986	619991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_017342	ATG	2	6	619998	620003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_017342	TTAAT	2	10	620005	620014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_017342	GTTA	2	8	620017	620024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_017342	TTG	2	6	620032	620037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_017342	TGA	2	6	620059	620064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_017342	TA	3	6	620160	620165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_017342	GAA	2	6	620171	620176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_017342	T	7	7	620193	620199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_017342	A	7	7	620278	620284	100 %	0 %	0 %	0 %	384866445
14511	NC_017342	ATT	2	6	620291	620296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866445
14512	NC_017342	TAG	2	6	620357	620362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866445
14513	NC_017342	ACTAT	2	10	620368	620377	40 %	40 %	0 %	20 %	384866445
14514	NC_017342	ATC	2	6	620390	620395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866445
14515	NC_017342	AAT	2	6	620443	620448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14516	NC_017342	A	7	7	620465	620471	100 %	0 %	0 %	0 %	384866445
14517	NC_017342	CAAACA	2	12	620531	620542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866445
14518	NC_017342	ACA	2	6	620599	620604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866445
14519	NC_017342	CAA	2	6	620615	620620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866445
14520	NC_017342	CTG	2	6	620660	620665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866445
14521	NC_017342	AAG	2	6	620693	620698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866445
14522	NC_017342	ATA	2	6	620714	620719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14523	NC_017342	ATG	2	6	620729	620734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866445
14524	NC_017342	TAA	2	6	620736	620741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14525	NC_017342	CAA	2	6	620747	620752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866445
14526	NC_017342	ATC	2	6	620793	620798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866445
14527	NC_017342	GTA	2	6	620884	620889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866445
14528	NC_017342	TGC	2	6	620892	620897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866445
14529	NC_017342	GGC	2	6	620997	621002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384866445
14530	NC_017342	ATT	2	6	621038	621043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866445
14531	NC_017342	ATA	2	6	621104	621109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14532	NC_017342	TGT	2	6	621147	621152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866445
14533	NC_017342	TTTA	2	8	621252	621259	25 %	75 %	0 %	0 %	384866445
14534	NC_017342	ATG	2	6	621293	621298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866445
14535	NC_017342	AATATT	2	12	621301	621312	50 %	50 %	0 %	0 %	384866445
14536	NC_017342	ATA	2	6	621329	621334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14537	NC_017342	TCT	2	6	621397	621402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866445
14538	NC_017342	ATT	2	6	621406	621411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866445
14539	NC_017342	GAA	2	6	621526	621531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866445
14540	NC_017342	AAGT	2	8	621542	621549	50 %	25 %	25 %	0 %	384866445
14541	NC_017342	CTA	2	6	621609	621614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866445
14542	NC_017342	AAG	2	6	621641	621646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866445
14543	NC_017342	ATAA	2	8	621715	621722	75 %	25 %	0 %	0 %	384866445
14544	NC_017342	TGT	2	6	621729	621734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866445
14545	NC_017342	ATA	2	6	621755	621760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14546	NC_017342	AAT	2	6	621841	621846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14547	NC_017342	TGT	2	6	621852	621857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866445
14548	NC_017342	CAG	2	6	621890	621895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866445
14549	NC_017342	ACC	2	6	621921	621926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866445
14550	NC_017342	CGGATT	2	12	622031	622042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384866445
14551	NC_017342	GACTCA	2	12	622105	622116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384866445
14552	NC_017342	TCAGAT	2	12	622180	622191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
14553	NC_017342	GATTCA	2	12	622195	622206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
14554	NC_017342	TCAGAT	2	12	622234	622245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
14555	NC_017342	GATTCA	2	12	622537	622548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
14556	NC_017342	TCAGAT	2	12	622684	622695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
14557	NC_017342	GACTCA	2	12	622717	622728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384866445
14558	NC_017342	TCAGAC	2	12	622756	622767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384866445
14559	NC_017342	TCAGAC	2	12	622774	622785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384866445
14560	NC_017342	ACC	2	6	622863	622868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866445
14561	NC_017342	AAT	2	6	622870	622875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14562	NC_017342	TAA	2	6	622920	622925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866445
14563	NC_017342	ACA	2	6	622935	622940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866445
14564	NC_017342	TGG	2	6	623009	623014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866445
14565	NC_017342	ATT	2	6	623016	623021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866445
14566	NC_017342	GCAA	2	8	623048	623055	50 %	0 %	25 %	25 %	384866445
14567	NC_017342	T	6	6	623081	623086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_017342	T	6	6	623110	623115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_017342	CAA	2	6	623222	623227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866446
14570	NC_017342	CTT	2	6	623274	623279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866446
14571	NC_017342	TAA	2	6	623280	623285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866446
14572	NC_017342	TGT	2	6	623318	623323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866446
14573	NC_017342	TGA	2	6	623340	623345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866446
14574	NC_017342	AT	3	6	623352	623357	50 %	50 %	0 %	0 %	384866446
14575	NC_017342	TAT	2	6	623461	623466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866446
14576	NC_017342	TCA	2	6	623496	623501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866446
14577	NC_017342	A	6	6	623518	623523	100 %	0 %	0 %	0 %	384866446
14578	NC_017342	TGA	2	6	623526	623531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866446
14579	NC_017342	GGA	2	6	623557	623562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384866446
14580	NC_017342	CTG	2	6	623624	623629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866446
14581	NC_017342	TG	3	6	623789	623794	0 %	50 %	50 %	0 %	384866446
14582	NC_017342	ATT	2	6	623837	623842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866446
14583	NC_017342	ATGG	2	8	623934	623941	25 %	25 %	50 %	0 %	384866446
14584	NC_017342	ATTA	2	8	623948	623955	50 %	50 %	0 %	0 %	384866446
14585	NC_017342	AGTG	2	8	623992	623999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_017342	AATT	2	8	624041	624048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_017342	ATC	2	6	624126	624131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_017342	TAT	2	6	624158	624163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_017342	TCA	3	9	624189	624197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866447
14590	NC_017342	TGT	2	6	624228	624233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866447
14591	NC_017342	TAC	2	6	624259	624264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866447
14592	NC_017342	TGA	2	6	624268	624273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866447
14593	NC_017342	GTATG	2	10	624286	624295	20 %	40 %	40 %	0 %	384866447
14594	NC_017342	CAT	2	6	624305	624310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866447
14595	NC_017342	T	6	6	624313	624318	0 %	100 %	0 %	0 %	384866447
14596	NC_017342	T	6	6	624320	624325	0 %	100 %	0 %	0 %	384866447
14597	NC_017342	ATT	2	6	624431	624436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866447
14598	NC_017342	A	6	6	624467	624472	100 %	0 %	0 %	0 %	384866447
14599	NC_017342	ATT	2	6	624532	624537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866447
14600	NC_017342	AT	4	8	624543	624550	50 %	50 %	0 %	0 %	384866447
14601	NC_017342	CAA	2	6	624551	624556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866447
14602	NC_017342	ATG	2	6	624573	624578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866447
14603	NC_017342	TTA	2	6	624618	624623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866447
14604	NC_017342	AAAG	2	8	624641	624648	75 %	0 %	25 %	0 %	384866447
14605	NC_017342	A	6	6	624690	624695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_017342	TAA	2	6	624712	624717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_017342	TAATT	2	10	624725	624734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_017342	ATG	2	6	624771	624776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_017342	A	6	6	624777	624782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_017342	A	6	6	624828	624833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_017342	A	6	6	624886	624891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_017342	T	7	7	624923	624929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_017342	AT	3	6	624943	624948	50 %	50 %	0 %	0 %	384866448
14614	NC_017342	ATT	2	6	624954	624959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866448
14615	NC_017342	TGTT	2	8	625115	625122	0 %	75 %	25 %	0 %	384866448
14616	NC_017342	TCTTTT	2	12	625146	625157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866448
14617	NC_017342	T	6	6	625154	625159	0 %	100 %	0 %	0 %	384866448
14618	NC_017342	AGT	2	6	625161	625166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866448
14619	NC_017342	T	6	6	625187	625192	0 %	100 %	0 %	0 %	384866448
14620	NC_017342	T	6	6	625196	625201	0 %	100 %	0 %	0 %	384866448
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14622	NC_017342	TAA	2	6	625240	625245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866448
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