MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_017342	AAC	2	6	2240492	2240497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868008
53002	NC_017342	TAT	2	6	2240651	2240656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53003	NC_017342	ATT	2	6	2240661	2240666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868009
53004	NC_017342	CAT	2	6	2240677	2240682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53005	NC_017342	CTT	2	6	2240700	2240705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53006	NC_017342	TCTT	2	8	2240733	2240740	0 %	75 %	0 %	25 %	384868009
53007	NC_017342	CAA	2	6	2240766	2240771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53008	NC_017342	TCA	3	9	2240774	2240782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53009	NC_017342	CTT	2	6	2240799	2240804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53010	NC_017342	TTGT	2	8	2240832	2240839	0 %	75 %	25 %	0 %	384868009
53011	NC_017342	ACGT	2	8	2240860	2240867	25 %	25 %	25 %	25 %	384868009
53012	NC_017342	TGTTT	2	10	2240876	2240885	0 %	80 %	20 %	0 %	384868009
53013	NC_017342	CAA	2	6	2240928	2240933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53014	NC_017342	ACG	2	6	2241049	2241054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868009
53015	NC_017342	TTC	2	6	2241088	2241093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53016	NC_017342	TAA	2	6	2241105	2241110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
53017	NC_017342	CA	3	6	2241309	2241314	50 %	0 %	0 %	50 %	384868009
53018	NC_017342	TAA	2	6	2241333	2241338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
53019	NC_017342	ACG	2	6	2241376	2241381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868009
53020	NC_017342	TTG	2	6	2241487	2241492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868009
53021	NC_017342	TCA	2	6	2241590	2241595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53022	NC_017342	CTT	2	6	2241615	2241620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53023	NC_017342	CTT	2	6	2241699	2241704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53024	NC_017342	TAATT	2	10	2241775	2241784	40 %	60 %	0 %	0 %	384868009
53025	NC_017342	ACCAAT	2	12	2241829	2241840	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53026	NC_017342	CAA	2	6	2241865	2241870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53027	NC_017342	TCA	2	6	2241893	2241898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53028	NC_017342	AAT	2	6	2241928	2241933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
53029	NC_017342	ATC	2	6	2241958	2241963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53030	NC_017342	AGCT	2	8	2241981	2241988	25 %	25 %	25 %	25 %	384868009
53031	NC_017342	CTG	2	6	2241999	2242004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868009
53032	NC_017342	ACA	2	6	2242013	2242018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53033	NC_017342	AATA	2	8	2242054	2242061	75 %	25 %	0 %	0 %	384868009
53034	NC_017342	ACA	2	6	2242079	2242084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53035	NC_017342	AAC	4	12	2242120	2242131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53036	NC_017342	T	6	6	2242156	2242161	0 %	100 %	0 %	0 %	384868009
53037	NC_017342	CTA	3	9	2242203	2242211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53038	NC_017342	ATA	2	6	2242235	2242240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
53039	NC_017342	CCA	2	6	2242253	2242258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868009
53040	NC_017342	TAA	2	6	2242290	2242295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
53041	NC_017342	CT	3	6	2242348	2242353	0 %	50 %	0 %	50 %	384868009
53042	NC_017342	AAC	2	6	2242424	2242429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
53043	NC_017342	CTA	2	6	2242434	2242439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
53044	NC_017342	GTT	2	6	2242442	2242447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868009
53045	NC_017342	AAT	2	6	2242468	2242473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
53046	NC_017342	TCT	2	6	2242490	2242495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
53047	NC_017342	TTA	2	6	2242499	2242504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868009
53048	NC_017342	CTT	2	6	2242522	2242527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53049	NC_017342	T	6	6	2242559	2242564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53050	NC_017342	A	8	8	2242618	2242625	100 %	0 %	0 %	0 %	384868010
53051	NC_017342	TAT	2	6	2242675	2242680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868010
53052	NC_017342	ATG	2	6	2242713	2242718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868010
53053	NC_017342	TAC	2	6	2242763	2242768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868010
53054	NC_017342	A	6	6	2242773	2242778	100 %	0 %	0 %	0 %	384868010
53055	NC_017342	CA	3	6	2242837	2242842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53056	NC_017342	ATG	2	6	2242848	2242853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53057	NC_017342	TAT	2	6	2242888	2242893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53058	NC_017342	ATT	2	6	2242955	2242960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868011
53059	NC_017342	GTT	2	6	2242979	2242984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868011
53060	NC_017342	TC	3	6	2243036	2243041	0 %	50 %	0 %	50 %	384868011
53061	NC_017342	TCC	2	6	2243148	2243153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868011
53062	NC_017342	AT	3	6	2243185	2243190	50 %	50 %	0 %	0 %	384868011
53063	NC_017342	CTT	2	6	2243254	2243259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868011
53064	NC_017342	TC	3	6	2243285	2243290	0 %	50 %	0 %	50 %	384868011
53065	NC_017342	AAT	2	6	2243328	2243333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868011
53066	NC_017342	TTAGA	2	10	2243342	2243351	40 %	40 %	20 %	0 %	384868011
53067	NC_017342	CAT	2	6	2243432	2243437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868011
53068	NC_017342	TTG	2	6	2243499	2243504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868011
53069	NC_017342	CAA	2	6	2243537	2243542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868011
53070	NC_017342	CTT	2	6	2243585	2243590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868011
53071	NC_017342	TGA	2	6	2243602	2243607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868011
53072	NC_017342	TCT	2	6	2243644	2243649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868011
53073	NC_017342	CTT	2	6	2243744	2243749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868011
53074	NC_017342	CAT	2	6	2243786	2243791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868011
53075	NC_017342	TAT	2	6	2243805	2243810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53076	NC_017342	CTT	2	6	2243834	2243839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53077	NC_017342	AGG	2	6	2243928	2243933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53078	NC_017342	ATAC	2	8	2244023	2244030	50 %	25 %	0 %	25 %	384868012
53079	NC_017342	CTT	2	6	2244068	2244073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868012
53080	NC_017342	AGA	2	6	2244123	2244128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868012
53081	NC_017342	TCC	2	6	2244137	2244142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868012
53082	NC_017342	TGTT	2	8	2244229	2244236	0 %	75 %	25 %	0 %	384868012
53083	NC_017342	CATG	2	8	2244248	2244255	25 %	25 %	25 %	25 %	384868012
53084	NC_017342	GAAA	2	8	2244291	2244298	75 %	0 %	25 %	0 %	384868012
53085	NC_017342	CAA	2	6	2244312	2244317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868012
53086	NC_017342	TGA	2	6	2244323	2244328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868012
53087	NC_017342	TTA	2	6	2244370	2244375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868012
53088	NC_017342	GAT	3	9	2244387	2244395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868012
53089	NC_017342	AAG	2	6	2244400	2244405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868012
53090	NC_017342	A	6	6	2244429	2244434	100 %	0 %	0 %	0 %	384868012
53091	NC_017342	CAC	2	6	2244463	2244468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868012
53092	NC_017342	AGA	2	6	2244512	2244517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868012
53093	NC_017342	ATAA	2	8	2244551	2244558	75 %	25 %	0 %	0 %	384868012
53094	NC_017342	ATA	2	6	2244569	2244574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53095	NC_017342	TTAC	2	8	2244610	2244617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53096	NC_017342	ATA	2	6	2244638	2244643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53097	NC_017342	A	7	7	2244656	2244662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53098	NC_017342	AAAT	2	8	2244666	2244673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53099	NC_017342	TTA	2	6	2244701	2244706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53100	NC_017342	AAG	2	6	2244717	2244722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53101	NC_017342	AAT	2	6	2244741	2244746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868013
53102	NC_017342	CAA	2	6	2244757	2244762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868013
53103	NC_017342	ACAAT	2	10	2244790	2244799	60 %	20 %	0 %	20 %	384868013
53104	NC_017342	ATC	2	6	2244808	2244813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868013
53105	NC_017342	TTA	2	6	2244858	2244863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
53106	NC_017342	GC	3	6	2244916	2244921	0 %	0 %	50 %	50 %	384868013
53107	NC_017342	ATT	2	6	2245042	2245047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
53108	NC_017342	ATT	2	6	2245077	2245082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
53109	NC_017342	TAC	2	6	2245204	2245209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868013
53110	NC_017342	TTG	2	6	2245249	2245254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868013
53111	NC_017342	TCA	2	6	2245305	2245310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868013
53112	NC_017342	TAT	2	6	2245394	2245399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
53113	NC_017342	CAA	2	6	2245405	2245410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868013
53114	NC_017342	TCA	2	6	2245437	2245442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868013
53115	NC_017342	GAA	2	6	2245479	2245484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868013
53116	NC_017342	TTA	3	9	2245557	2245565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
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53118	NC_017342	CAA	2	6	2245663	2245668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868013
53119	NC_017342	ATT	2	6	2245688	2245693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
53120	NC_017342	ATT	2	6	2245703	2245708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868013
53121	NC_017342	ACT	2	6	2245886	2245891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868013
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53222	NC_017342	GAT	2	6	2249871	2249876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868018
53223	NC_017342	AATG	2	8	2249891	2249898	50 %	25 %	25 %	0 %	384868018
53224	NC_017342	CCATA	2	10	2249935	2249944	40 %	20 %	0 %	40 %	384868018
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53227	NC_017342	ATAA	2	8	2250024	2250031	75 %	25 %	0 %	0 %	384868018
53228	NC_017342	CTT	2	6	2250076	2250081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868018
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53230	NC_017342	TA	3	6	2250206	2250211	50 %	50 %	0 %	0 %	384868018
53231	NC_017342	ACT	2	6	2250225	2250230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868018
53232	NC_017342	ATG	2	6	2250262	2250267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868018
53233	NC_017342	TAAAT	2	10	2250269	2250278	60 %	40 %	0 %	0 %	384868018
53234	NC_017342	TAA	2	6	2250314	2250319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868018
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53236	NC_017342	AAT	2	6	2250365	2250370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868018
53237	NC_017342	TAA	2	6	2250380	2250385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868018
53238	NC_017342	CGAG	2	8	2250401	2250408	25 %	0 %	50 %	25 %	384868018
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53240	NC_017342	TAA	2	6	2250445	2250450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868018
53241	NC_017342	TTA	2	6	2250454	2250459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868018
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53257	NC_017342	CAA	2	6	2251016	2251021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868019
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53265	NC_017342	T	7	7	2251425	2251431	0 %	100 %	0 %	0 %	384868019
53266	NC_017342	AAT	2	6	2251477	2251482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868019
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53284	NC_017342	TCA	2	6	2252038	2252043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868020
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53298	NC_017342	CGAA	2	8	2252427	2252434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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53345	NC_017342	TGC	2	6	2254414	2254419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868023
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53348	NC_017342	TTTCA	2	10	2254558	2254567	20 %	60 %	0 %	20 %	384868023
53349	NC_017342	TCA	2	6	2254616	2254621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868023
53350	NC_017342	TAA	2	6	2254669	2254674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868023
53351	NC_017342	CCG	2	6	2254689	2254694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384868023
53352	NC_017342	CTT	2	6	2254737	2254742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868023
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53443	NC_017342	ATTAC	2	10	2258634	2258643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53444	NC_017342	TATAA	2	10	2258686	2258695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53445	NC_017342	ATAA	2	8	2258713	2258720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53446	NC_017342	T	6	6	2258761	2258766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53463	NC_017342	TTCT	2	8	2259641	2259648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53464	NC_017342	ATTT	2	8	2259672	2259679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53465	NC_017342	TAA	2	6	2259680	2259685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53467	NC_017342	TCAT	2	8	2259749	2259756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53468	NC_017342	T	6	6	2259802	2259807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53469	NC_017342	ATG	2	6	2259820	2259825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53472	NC_017342	GAT	2	6	2259868	2259873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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