MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017341	CCT	2	6	527251	527256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_017341	AT	3	6	527265	527270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017341	TCT	2	6	527279	527284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_017341	AGA	2	6	527287	527292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_017341	TTTA	2	8	527331	527338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_017341	T	6	6	527350	527355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_017341	TAAG	2	8	527435	527442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017341	AAT	2	6	527511	527516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017341	TAA	2	6	527547	527552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_017341	TGG	2	6	527612	527617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017341	TTA	2	6	527632	527637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017341	ACG	2	6	527689	527694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_017341	GTAA	2	8	527712	527719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017341	GGA	2	6	527838	527843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_017341	AGAA	2	8	527846	527853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017341	TAG	2	6	527867	527872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_017341	GCGA	2	8	527875	527882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12518	NC_017341	CAA	2	6	527901	527906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017341	GCTT	2	8	527907	527914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12520	NC_017341	GAC	2	6	527952	527957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_017341	ATC	2	6	527967	527972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_017341	TAA	2	6	527995	528000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_017341	TGT	2	6	528016	528021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017341	CT	3	6	528022	528027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_017341	ACG	2	6	528044	528049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_017341	GGA	2	6	528077	528082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_017341	CT	3	6	528103	528108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_017341	AGT	2	6	528198	528203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017341	GGA	2	6	528394	528399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017341	TC	3	6	528480	528485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12531	NC_017341	TGA	2	6	528513	528518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017341	AATT	2	8	528592	528599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017341	ACC	2	6	528658	528663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_017341	AT	3	6	528679	528684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017341	AGC	2	6	528738	528743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_017341	CAT	2	6	528744	528749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_017341	ACC	2	6	529064	529069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_017341	G	6	6	529089	529094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_017341	GATTG	2	10	529120	529129	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017341	TAGA	2	8	529249	529256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_017341	GAGC	2	8	529313	529320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12542	NC_017341	AGA	2	6	529395	529400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_017341	CGG	2	6	529553	529558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_017341	GA	3	6	529651	529656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_017341	TAGG	2	8	529769	529776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_017341	TGG	2	6	529815	529820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_017341	TAC	2	6	529823	529828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_017341	CAC	2	6	529855	529860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12549	NC_017341	GTG	2	6	529866	529871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_017341	CCT	2	6	529911	529916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12551	NC_017341	TCAT	2	8	529963	529970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12552	NC_017341	GGT	2	6	530047	530052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_017341	CGT	2	6	530242	530247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_017341	CGT	2	6	530268	530273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_017341	GAG	2	6	530291	530296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_017341	TG	3	6	530377	530382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_017341	C	6	6	530418	530423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12558	NC_017341	GAT	2	6	530466	530471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017341	ATCG	2	8	530527	530534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_017341	AAAT	2	8	530547	530554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017341	TACT	2	8	530578	530585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12562	NC_017341	AGG	2	6	530636	530641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_017341	A	6	6	530735	530740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_017341	T	7	7	530777	530783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_017341	TAG	2	6	530884	530889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_017341	GAA	2	6	530913	530918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017341	AAGC	2	8	530927	530934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_017341	CGA	2	6	530964	530969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_017341	T	7	7	531034	531040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_017341	TAG	2	6	531141	531146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_017341	AAGC	2	8	531184	531191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_017341	AATG	2	8	531274	531281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017341	TAA	2	6	531315	531320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017341	ATT	2	6	531333	531338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_017341	TAT	2	6	531379	531384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_017341	CAG	2	6	531395	531400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_017341	ATC	2	6	531422	531427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_017341	CTG	2	6	531431	531436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_017341	ATTA	2	8	531486	531493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_017341	AAG	2	6	531540	531545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_017341	TA	3	6	531552	531557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_017341	TAAA	2	8	531595	531602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_017341	TAAA	2	8	531632	531639	75 %	25 %	0 %	0 %	384861142
12584	NC_017341	AAG	3	9	531656	531664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384861142
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12588	NC_017341	ATG	2	6	531827	531832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384861142
12589	NC_017341	CAC	2	6	531852	531857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384861142
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12591	NC_017341	CAA	2	6	531961	531966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384861142
12592	NC_017341	TAA	2	6	532014	532019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384861142
12593	NC_017341	AAT	2	6	532039	532044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384861142
12594	NC_017341	AGA	2	6	532104	532109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384861142
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12596	NC_017341	TGT	2	6	532224	532229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384861142
12597	NC_017341	TAT	2	6	532311	532316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384861142
12598	NC_017341	T	6	6	532417	532422	0 %	100 %	0 %	0 %	384861142
12599	NC_017341	AG	3	6	532427	532432	50 %	0 %	50 %	0 %	384861142
12600	NC_017341	GAA	2	6	532455	532460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384861142
12601	NC_017341	TGA	2	6	532482	532487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384861142
12602	NC_017341	GAC	2	6	532579	532584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384861142
12603	NC_017341	CAT	2	6	532615	532620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384861142
12604	NC_017341	GAT	2	6	532621	532626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384861142
12605	NC_017341	TATT	2	8	532630	532637	25 %	75 %	0 %	0 %	384861142
12606	NC_017341	A	6	6	532678	532683	100 %	0 %	0 %	0 %	384861142
12607	NC_017341	AAAC	2	8	532699	532706	75 %	0 %	0 %	25 %	384861142
12608	NC_017341	AAC	2	6	532716	532721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384861142
12609	NC_017341	TAT	2	6	532833	532838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384861142
12610	NC_017341	ATA	2	6	532925	532930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384861142
12611	NC_017341	TAAT	2	8	533007	533014	50 %	50 %	0 %	0 %	384861143
12612	NC_017341	ATG	2	6	533043	533048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384861143
12613	NC_017341	GGT	2	6	533069	533074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384861143
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12615	NC_017341	TGC	2	6	533152	533157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384861143
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12618	NC_017341	TGTGT	2	10	533215	533224	0 %	60 %	40 %	0 %	384861143
12619	NC_017341	GAA	2	6	533282	533287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384861143
12620	NC_017341	ATTT	2	8	533339	533346	25 %	75 %	0 %	0 %	384861143
12621	NC_017341	TAT	2	6	533377	533382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384861143
12622	NC_017341	TAGAT	2	10	533404	533413	40 %	40 %	20 %	0 %	384861143
12623	NC_017341	AAG	2	6	533415	533420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384861143
12624	NC_017341	TCAT	2	8	533463	533470	25 %	50 %	0 %	25 %	384861143
12625	NC_017341	TGT	2	6	533521	533526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384861143
12626	NC_017341	ATC	2	6	533546	533551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384861143
12627	NC_017341	GATAT	2	10	533566	533575	40 %	40 %	20 %	0 %	384861143
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