MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62501	NC_017341	CAT	2	6	2610758	2610763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62502	NC_017341	TATG	2	8	2610829	2610836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62503	NC_017341	TTTG	2	8	2610856	2610863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62504	NC_017341	ATG	2	6	2610904	2610909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62505	NC_017341	TTA	2	6	2610910	2610915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62506	NC_017341	ATT	3	9	2610919	2610927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62507	NC_017341	T	6	6	2610959	2610964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62508	NC_017341	TAT	2	6	2610976	2610981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62509	NC_017341	GTT	2	6	2610992	2610997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62510	NC_017341	A	6	6	2611005	2611010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62511	NC_017341	ATT	2	6	2611029	2611034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62512	NC_017341	TAA	2	6	2611053	2611058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62513	NC_017341	TCA	2	6	2611135	2611140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62514	NC_017341	GACA	2	8	2611224	2611231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62515	NC_017341	A	7	7	2611237	2611243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62516	NC_017341	CAAC	2	8	2611244	2611251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62517	NC_017341	GTT	2	6	2611266	2611271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62518	NC_017341	TGT	3	9	2611287	2611295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62519	NC_017341	ATTA	2	8	2611316	2611323	50 %	50 %	0 %	0 %	384863090
62520	NC_017341	AT	5	10	2611417	2611426	50 %	50 %	0 %	0 %	384863090
62521	NC_017341	TGT	2	6	2611430	2611435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863090
62522	NC_017341	TTC	2	6	2611480	2611485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863090
62523	NC_017341	TTC	2	6	2611529	2611534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863090
62524	NC_017341	T	6	6	2611543	2611548	0 %	100 %	0 %	0 %	384863090
62525	NC_017341	ATA	2	6	2611582	2611587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863090
62526	NC_017341	TTC	2	6	2611594	2611599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863090
62527	NC_017341	GCT	2	6	2611646	2611651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863090
62528	NC_017341	TCC	2	6	2611691	2611696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384863090
62529	NC_017341	ATA	2	6	2611716	2611721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863090
62530	NC_017341	TAC	2	6	2611753	2611758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863090
62531	NC_017341	TAT	2	6	2611764	2611769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863090
62532	NC_017341	TTC	2	6	2611852	2611857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863090
62533	NC_017341	CT	3	6	2611868	2611873	0 %	50 %	0 %	50 %	384863090
62534	NC_017341	TCA	2	6	2611923	2611928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62535	NC_017341	TAT	2	6	2611957	2611962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62536	NC_017341	AT	3	6	2611961	2611966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62537	NC_017341	A	6	6	2611978	2611983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62538	NC_017341	A	6	6	2612014	2612019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62539	NC_017341	TAT	3	9	2612030	2612038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62540	NC_017341	ATT	2	6	2612061	2612066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62541	NC_017341	T	6	6	2612065	2612070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62542	NC_017341	AATC	2	8	2612132	2612139	50 %	25 %	0 %	25 %	384863091
62543	NC_017341	TTA	2	6	2612154	2612159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863091
62544	NC_017341	CAT	2	6	2612209	2612214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
62545	NC_017341	CAG	2	6	2612227	2612232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384863091
62546	NC_017341	ATCAT	2	10	2612235	2612244	40 %	40 %	0 %	20 %	384863091
62547	NC_017341	ATT	2	6	2612357	2612362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863091
62548	NC_017341	TGC	2	6	2612372	2612377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863091
62549	NC_017341	AAT	2	6	2612405	2612410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863091
62550	NC_017341	AT	3	6	2612438	2612443	50 %	50 %	0 %	0 %	384863091
62551	NC_017341	TCA	2	6	2612533	2612538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
62552	NC_017341	T	6	6	2612545	2612550	0 %	100 %	0 %	0 %	384863091
62553	NC_017341	ATT	2	6	2612552	2612557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863091
62554	NC_017341	CAT	2	6	2612584	2612589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
62555	NC_017341	CAT	3	9	2612636	2612644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
62556	NC_017341	TGC	2	6	2612726	2612731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863091
62557	NC_017341	AAC	2	6	2612732	2612737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863091
62558	NC_017341	ATT	2	6	2612748	2612753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863091
62559	NC_017341	T	6	6	2612752	2612757	0 %	100 %	0 %	0 %	384863091
62560	NC_017341	ATTCA	2	10	2612759	2612768	40 %	40 %	0 %	20 %	384863091
62561	NC_017341	ATT	2	6	2612778	2612783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863091
62562	NC_017341	A	7	7	2612812	2612818	100 %	0 %	0 %	0 %	384863091
62563	NC_017341	CAGTG	2	10	2612852	2612861	20 %	20 %	40 %	20 %	384863091
62564	NC_017341	CAT	2	6	2612867	2612872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
62565	NC_017341	TCAA	2	8	2612903	2612910	50 %	25 %	0 %	25 %	384863091
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62570	NC_017341	ATGA	2	8	2613120	2613127	50 %	25 %	25 %	0 %	384863091
62571	NC_017341	ATATC	2	10	2613131	2613140	40 %	40 %	0 %	20 %	384863091
62572	NC_017341	ATC	2	6	2613153	2613158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
62573	NC_017341	CAT	2	6	2613167	2613172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863091
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62579	NC_017341	CAA	2	6	2613391	2613396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863091
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62586	NC_017341	AT	3	6	2613758	2613763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62587	NC_017341	AC	5	10	2613771	2613780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62588	NC_017341	AACC	2	8	2613784	2613791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62589	NC_017341	TTGG	2	8	2613807	2613814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62590	NC_017341	T	6	6	2613815	2613820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62591	NC_017341	TAAC	2	8	2613842	2613849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62592	NC_017341	GAT	3	9	2613857	2613865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62593	NC_017341	AGT	2	6	2613915	2613920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62594	NC_017341	T	6	6	2613951	2613956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62595	NC_017341	GAC	2	6	2614028	2614033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62596	NC_017341	ATA	2	6	2614146	2614151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62597	NC_017341	CAT	2	6	2614199	2614204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62598	NC_017341	ATC	2	6	2614289	2614294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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62601	NC_017341	TAA	2	6	2614337	2614342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62602	NC_017341	TAC	2	6	2614356	2614361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863092
62603	NC_017341	GGT	2	6	2614363	2614368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384863092
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62605	NC_017341	ACC	2	6	2614428	2614433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384863092
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62608	NC_017341	T	6	6	2614545	2614550	0 %	100 %	0 %	0 %	384863092
62609	NC_017341	CTC	2	6	2614551	2614556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384863092
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62611	NC_017341	GAA	2	6	2614629	2614634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863092
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62617	NC_017341	ATCAA	2	10	2614826	2614835	60 %	20 %	0 %	20 %	384863092
62618	NC_017341	TAA	2	6	2614884	2614889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863092
62619	NC_017341	GCAG	2	8	2614912	2614919	25 %	0 %	50 %	25 %	384863092
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62978	NC_017341	TAA	2	6	2631227	2631232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863108
62979	NC_017341	AAC	2	6	2631259	2631264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863108
62980	NC_017341	TGAC	2	8	2631492	2631499	25 %	25 %	25 %	25 %	384863108
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62982	NC_017341	TTCC	2	8	2631532	2631539	0 %	50 %	0 %	50 %	384863108
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