MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_017341	TTAC	2	8	2278245	2278252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54502	NC_017341	TCAAT	2	10	2278256	2278265	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54503	NC_017341	ACCA	2	8	2278310	2278317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54504	NC_017341	ATC	2	6	2278352	2278357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54505	NC_017341	ATA	2	6	2278473	2278478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54506	NC_017341	T	8	8	2278485	2278492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54507	NC_017341	TAC	2	6	2278529	2278534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54508	NC_017341	T	6	6	2278536	2278541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54509	NC_017341	TCA	2	6	2278558	2278563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54510	NC_017341	TCA	2	6	2278616	2278621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54511	NC_017341	CTT	2	6	2278622	2278627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54512	NC_017341	TAG	2	6	2278647	2278652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54513	NC_017341	CTT	3	9	2278658	2278666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54514	NC_017341	ATA	3	9	2278681	2278689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54515	NC_017341	TCA	2	6	2278699	2278704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54516	NC_017341	TCT	2	6	2278807	2278812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54517	NC_017341	T	6	6	2278860	2278865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54518	NC_017341	AAAT	2	8	2278879	2278886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54519	NC_017341	CATT	2	8	2278888	2278895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54520	NC_017341	AT	3	6	2278901	2278906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54521	NC_017341	CATA	2	8	2278965	2278972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54522	NC_017341	CAA	2	6	2278989	2278994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54523	NC_017341	CAA	2	6	2279155	2279160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54524	NC_017341	A	6	6	2279262	2279267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_017341	ACT	2	6	2279294	2279299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54526	NC_017341	CAACA	2	10	2279302	2279311	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54527	NC_017341	CAT	2	6	2279455	2279460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862783
54528	NC_017341	CTT	2	6	2279485	2279490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862783
54529	NC_017341	GAA	2	6	2279513	2279518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384862783
54530	NC_017341	TG	3	6	2279520	2279525	0 %	50 %	50 %	0 %	384862783
54531	NC_017341	TAA	2	6	2279588	2279593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862783
54532	NC_017341	AATC	2	8	2279626	2279633	50 %	25 %	0 %	25 %	384862783
54533	NC_017341	ATC	2	6	2279645	2279650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862783
54534	NC_017341	CGA	2	6	2279656	2279661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862783
54535	NC_017341	TAG	2	6	2279752	2279757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862783
54536	NC_017341	AAT	2	6	2279857	2279862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862783
54537	NC_017341	TCT	2	6	2279878	2279883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862783
54538	NC_017341	ATA	2	6	2279889	2279894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862783
54539	NC_017341	CAG	2	6	2279908	2279913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862783
54540	NC_017341	CAT	2	6	2279953	2279958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862783
54541	NC_017341	CTG	2	6	2279986	2279991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384862783
54542	NC_017341	ATC	2	6	2279999	2280004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862783
54543	NC_017341	CTTTT	2	10	2280073	2280082	0 %	80 %	0 %	20 %	384862783
54544	NC_017341	TAT	2	6	2280124	2280129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862783
54545	NC_017341	CAA	2	6	2280136	2280141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862783
54546	NC_017341	ATA	2	6	2280161	2280166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862783
54547	NC_017341	TCA	2	6	2280186	2280191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862783
54548	NC_017341	AT	3	6	2280195	2280200	50 %	50 %	0 %	0 %	384862783
54549	NC_017341	AAAT	2	8	2280204	2280211	75 %	25 %	0 %	0 %	384862783
54550	NC_017341	TGTC	2	8	2280331	2280338	0 %	50 %	25 %	25 %	384862783
54551	NC_017341	TAA	2	6	2280380	2280385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862783
54552	NC_017341	A	6	6	2280399	2280404	100 %	0 %	0 %	0 %	384862783
54553	NC_017341	AT	3	6	2280442	2280447	50 %	50 %	0 %	0 %	384862783
54554	NC_017341	ACA	2	6	2280468	2280473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862783
54555	NC_017341	ATT	2	6	2280518	2280523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862783
54556	NC_017341	AAT	2	6	2280565	2280570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862784
54557	NC_017341	ATT	2	6	2280620	2280625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862784
54558	NC_017341	TAAT	2	8	2280636	2280643	50 %	50 %	0 %	0 %	384862784
54559	NC_017341	TCA	2	6	2280647	2280652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862784
54560	NC_017341	CTA	2	6	2280696	2280701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862784
54561	NC_017341	TTG	2	6	2280735	2280740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862784
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54563	NC_017341	CTT	2	6	2280813	2280818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862784
54564	NC_017341	AAAT	2	8	2280832	2280839	75 %	25 %	0 %	0 %	384862784
54565	NC_017341	ATTC	2	8	2280864	2280871	25 %	50 %	0 %	25 %	384862784
54566	NC_017341	GATTT	2	10	2280934	2280943	20 %	60 %	20 %	0 %	384862784
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54571	NC_017341	TGT	2	6	2281082	2281087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862784
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54581	NC_017341	TA	3	6	2281681	2281686	50 %	50 %	0 %	0 %	384862784
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54584	NC_017341	ATC	2	6	2281750	2281755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54585	NC_017341	ATT	2	6	2281782	2281787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54586	NC_017341	ATG	2	6	2281811	2281816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54587	NC_017341	TTTA	2	8	2281831	2281838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54588	NC_017341	TAA	2	6	2281849	2281854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54589	NC_017341	ACA	2	6	2281946	2281951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54590	NC_017341	CAA	2	6	2281970	2281975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54591	NC_017341	AGT	2	6	2281999	2282004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54592	NC_017341	AGG	2	6	2282009	2282014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54593	NC_017341	AATG	2	8	2282032	2282039	50 %	25 %	25 %	0 %	384862785
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54597	NC_017341	CATT	2	8	2282189	2282196	25 %	50 %	0 %	25 %	384862785
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54605	NC_017341	AAACG	2	10	2282453	2282462	60 %	0 %	20 %	20 %	384862785
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54608	NC_017341	TCAA	2	8	2282502	2282509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54609	NC_017341	TAT	2	6	2282568	2282573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54610	NC_017341	A	6	6	2282585	2282590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54611	NC_017341	ATTT	2	8	2282630	2282637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54612	NC_017341	GATT	2	8	2282789	2282796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54613	NC_017341	TTAA	2	8	2282824	2282831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54614	NC_017341	ATA	2	6	2282846	2282851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54615	NC_017341	TAA	2	6	2282973	2282978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54620	NC_017341	CTT	2	6	2283141	2283146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862786
54621	NC_017341	T	7	7	2283162	2283168	0 %	100 %	0 %	0 %	384862786
54622	NC_017341	ATC	2	6	2283199	2283204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862786
54623	NC_017341	CAT	2	6	2283232	2283237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862786
54624	NC_017341	T	6	6	2283286	2283291	0 %	100 %	0 %	0 %	384862786
54625	NC_017341	TCG	2	6	2283353	2283358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384862786
54626	NC_017341	TAA	2	6	2283372	2283377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862786
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54651	NC_017341	ATT	2	6	2284391	2284396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862787
54652	NC_017341	TTA	2	6	2284445	2284450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54653	NC_017341	ATC	2	6	2284502	2284507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54654	NC_017341	ATG	2	6	2284517	2284522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54655	NC_017341	TA	3	6	2284547	2284552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54656	NC_017341	AATCTG	2	12	2284595	2284606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384862788
54657	NC_017341	TCT	2	6	2284684	2284689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862788
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54674	NC_017341	TTGA	2	8	2285303	2285310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54675	NC_017341	CATA	2	8	2285362	2285369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54676	NC_017341	AAAC	2	8	2285396	2285403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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54711	NC_017341	TTATA	2	10	2286893	2286902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54731	NC_017341	TATT	2	8	2287579	2287586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54732	NC_017341	T	6	6	2287597	2287602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54733	NC_017341	TTA	3	9	2287644	2287652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54735	NC_017341	TTA	2	6	2287760	2287765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54736	NC_017341	T	6	6	2287827	2287832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54737	NC_017341	ATCCT	2	10	2287873	2287882	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54738	NC_017341	CTT	2	6	2287885	2287890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54739	NC_017341	AT	3	6	2287904	2287909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54986	NC_017341	TTA	3	9	2297898	2297906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54987	NC_017341	TCA	2	6	2297908	2297913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54988	NC_017341	ACA	2	6	2297934	2297939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54989	NC_017341	GAT	2	6	2297950	2297955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54991	NC_017341	TA	3	6	2297964	2297969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54992	NC_017341	CATT	2	8	2297976	2297983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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