MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_017341	TTTC	2	8	2129641	2129648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51002	NC_017341	TTTGA	2	10	2129673	2129682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51003	NC_017341	AAT	2	6	2129691	2129696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51004	NC_017341	TAC	2	6	2129728	2129733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51005	NC_017341	TTA	2	6	2129857	2129862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51006	NC_017341	AAC	2	6	2129912	2129917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51007	NC_017341	CTC	2	6	2130007	2130012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51008	NC_017341	TAAA	2	8	2130025	2130032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_017341	GAA	2	6	2130038	2130043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_017341	TTAA	2	8	2130045	2130052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51011	NC_017341	CCG	2	6	2130127	2130132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51012	NC_017341	AAAT	2	8	2130136	2130143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51013	NC_017341	TAA	2	6	2130193	2130198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51014	NC_017341	AT	3	6	2130226	2130231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51015	NC_017341	TGTT	2	8	2130392	2130399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51016	NC_017341	AGCC	2	8	2130478	2130485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51017	NC_017341	A	6	6	2130561	2130566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51018	NC_017341	TAAT	2	8	2130568	2130575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51019	NC_017341	GCA	3	9	2130678	2130686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51020	NC_017341	ACC	2	6	2130689	2130694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51021	NC_017341	TTC	2	6	2130773	2130778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51022	NC_017341	CTA	2	6	2130826	2130831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51023	NC_017341	ACC	2	6	2130953	2130958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51024	NC_017341	TTG	2	6	2131018	2131023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51025	NC_017341	GCTA	2	8	2131025	2131032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51026	NC_017341	TCT	2	6	2131063	2131068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51027	NC_017341	TTC	2	6	2131073	2131078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51028	NC_017341	T	6	6	2131118	2131123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51029	NC_017341	GA	3	6	2131171	2131176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51030	NC_017341	GATT	2	8	2131184	2131191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51031	NC_017341	TGC	2	6	2131280	2131285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51032	NC_017341	TCA	2	6	2131317	2131322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51033	NC_017341	TAAT	2	8	2131354	2131361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51034	NC_017341	AACCT	2	10	2131447	2131456	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51035	NC_017341	CTG	2	6	2131498	2131503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51036	NC_017341	CTT	2	6	2131541	2131546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51037	NC_017341	CCG	2	6	2131554	2131559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51038	NC_017341	TGC	3	9	2131625	2131633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51039	NC_017341	ATC	2	6	2131662	2131667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51040	NC_017341	T	6	6	2131790	2131795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51041	NC_017341	T	6	6	2131819	2131824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51042	NC_017341	AAT	2	6	2131840	2131845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51043	NC_017341	TTGT	2	8	2131859	2131866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51044	NC_017341	ATC	2	6	2131946	2131951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51045	NC_017341	TTG	2	6	2132000	2132005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51046	NC_017341	GTT	2	6	2132039	2132044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51047	NC_017341	TGC	2	6	2132117	2132122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51048	NC_017341	ATCCAA	2	12	2132123	2132134	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51049	NC_017341	TTCT	2	8	2132155	2132162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51050	NC_017341	T	6	6	2132167	2132172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51051	NC_017341	CCT	2	6	2132174	2132179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51052	NC_017341	A	6	6	2132184	2132189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51053	NC_017341	A	7	7	2132194	2132200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51054	NC_017341	GGTTAA	2	12	2132216	2132227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862625
51055	NC_017341	TTC	2	6	2132254	2132259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862625
51056	NC_017341	AT	3	6	2132284	2132289	50 %	50 %	0 %	0 %	384862625
51057	NC_017341	CAT	2	6	2132356	2132361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862625
51058	NC_017341	CATT	2	8	2132492	2132499	25 %	50 %	0 %	25 %	384862626
51059	NC_017341	TGCA	2	8	2132508	2132515	25 %	25 %	25 %	25 %	384862626
51060	NC_017341	ATC	2	6	2132628	2132633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862626
51061	NC_017341	AAATG	2	10	2132664	2132673	60 %	20 %	20 %	0 %	384862626
51062	NC_017341	GTG	2	6	2132678	2132683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384862626
51063	NC_017341	TAATT	2	10	2132697	2132706	40 %	60 %	0 %	0 %	384862626
51064	NC_017341	TCT	2	6	2132722	2132727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862626
51065	NC_017341	AAT	2	6	2132736	2132741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862626
51066	NC_017341	AAATA	2	10	2132786	2132795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51067	NC_017341	ATTG	2	8	2132911	2132918	25 %	50 %	25 %	0 %	384862627
51068	NC_017341	TGT	2	6	2132938	2132943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862627
51069	NC_017341	ACTT	2	8	2132955	2132962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51070	NC_017341	CTA	2	6	2132976	2132981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51072	NC_017341	TTC	2	6	2133120	2133125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862628
51073	NC_017341	CCA	2	6	2133172	2133177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384862628
51074	NC_017341	AT	3	6	2133205	2133210	50 %	50 %	0 %	0 %	384862628
51075	NC_017341	TAT	2	6	2133227	2133232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862628
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51077	NC_017341	TTGTT	2	10	2133400	2133409	0 %	80 %	20 %	0 %	384862628
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51079	NC_017341	GCAT	2	8	2133487	2133494	25 %	25 %	25 %	25 %	384862628
51080	NC_017341	CCA	2	6	2133574	2133579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384862628
51081	NC_017341	T	6	6	2133593	2133598	0 %	100 %	0 %	0 %	384862628
51082	NC_017341	CTT	2	6	2133644	2133649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862628
51083	NC_017341	TCC	2	6	2133730	2133735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384862629
51084	NC_017341	A	6	6	2133740	2133745	100 %	0 %	0 %	0 %	384862629
51085	NC_017341	TTC	2	6	2133783	2133788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862629
51086	NC_017341	TA	3	6	2133789	2133794	50 %	50 %	0 %	0 %	384862629
51087	NC_017341	ATA	2	6	2133839	2133844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862629
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51089	NC_017341	GTC	2	6	2133981	2133986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384862629
51090	NC_017341	CAATAA	2	12	2133995	2134006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384862629
51091	NC_017341	TATT	2	8	2134036	2134043	25 %	75 %	0 %	0 %	384862629
51092	NC_017341	ATT	2	6	2134053	2134058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862629
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51095	NC_017341	ATCA	2	8	2134122	2134129	50 %	25 %	0 %	25 %	384862629
51096	NC_017341	T	6	6	2134133	2134138	0 %	100 %	0 %	0 %	384862630
51097	NC_017341	ATTA	2	8	2134358	2134365	50 %	50 %	0 %	0 %	384862630
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51103	NC_017341	ATA	2	6	2134553	2134558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862631
51104	NC_017341	TAT	2	6	2134566	2134571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862631
51105	NC_017341	TTC	2	6	2134642	2134647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862631
51106	NC_017341	AAT	2	6	2134656	2134661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862631
51107	NC_017341	TA	3	6	2134767	2134772	50 %	50 %	0 %	0 %	384862631
51108	NC_017341	TCT	2	6	2134781	2134786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862631
51109	NC_017341	ATT	2	6	2134807	2134812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862631
51110	NC_017341	T	6	6	2134870	2134875	0 %	100 %	0 %	0 %	384862631
51111	NC_017341	TCT	2	6	2134890	2134895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862631
51112	NC_017341	TAT	2	6	2134925	2134930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862632
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51114	NC_017341	T	6	6	2135046	2135051	0 %	100 %	0 %	0 %	384862632
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51118	NC_017341	T	8	8	2135214	2135221	0 %	100 %	0 %	0 %	384862633
51119	NC_017341	TAA	2	6	2135241	2135246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862633
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51121	NC_017341	CAA	2	6	2135316	2135321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862633
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51123	NC_017341	TTC	2	6	2135461	2135466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862634
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51125	NC_017341	TAT	2	6	2135526	2135531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862634
51126	NC_017341	ATC	2	6	2135578	2135583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862634
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51241	NC_017341	TCA	2	6	2140070	2140075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862637
51242	NC_017341	CAT	2	6	2140083	2140088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862637
51243	NC_017341	AT	4	8	2140096	2140103	50 %	50 %	0 %	0 %	384862637
51244	NC_017341	TTCT	2	8	2140131	2140138	0 %	75 %	0 %	25 %	384862637
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51348	NC_017341	GTT	3	9	2143948	2143956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862647
51349	NC_017341	ACA	2	6	2144078	2144083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862647
51350	NC_017341	TTC	2	6	2144091	2144096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862647
51351	NC_017341	CAT	2	6	2144128	2144133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862647
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51354	NC_017341	AGTT	2	8	2144207	2144214	25 %	50 %	25 %	0 %	384862648
51355	NC_017341	TA	4	8	2144249	2144256	50 %	50 %	0 %	0 %	384862648
51356	NC_017341	CAG	2	6	2144269	2144274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862648
51357	NC_017341	TAA	2	6	2144328	2144333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862648
51358	NC_017341	TAC	2	6	2144342	2144347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862648
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51481	NC_017341	CTT	2	6	2149927	2149932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862655
51482	NC_017341	CTT	2	6	2149935	2149940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862655
51483	NC_017341	TCA	2	6	2149993	2149998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862655
51484	NC_017341	TCA	2	6	2150005	2150010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862655
51485	NC_017341	TCA	2	6	2150044	2150049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862655
51486	NC_017341	AT	3	6	2150053	2150058	50 %	50 %	0 %	0 %	384862655
51487	NC_017341	TTCG	2	8	2150065	2150072	0 %	50 %	25 %	25 %	384862655
51488	NC_017341	T	6	6	2150099	2150104	0 %	100 %	0 %	0 %	384862655
51489	NC_017341	T	6	6	2150133	2150138	0 %	100 %	0 %	0 %	384862655
51490	NC_017341	T	7	7	2150209	2150215	0 %	100 %	0 %	0 %	384862655
51491	NC_017341	AGC	2	6	2150272	2150277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862655
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51496	NC_017341	T	6	6	2150429	2150434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51497	NC_017341	T	6	6	2150472	2150477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51498	NC_017341	GATT	2	8	2150497	2150504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51499	NC_017341	TTGT	2	8	2150526	2150533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51500	NC_017341	TGA	2	6	2150580	2150585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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