MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	ATT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
3	NC_017339	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	384551480
4	NC_017339	TTA	2	6	62	67	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
5	NC_017339	TAT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
6	NC_017339	ACA	2	6	122	127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551480
7	NC_017339	T	6	6	172	177	0 %	100 %	0 %	0 %	384551480
8	NC_017339	AT	3	6	189	194	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
9	NC_017339	ATG	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551480
10	NC_017339	GGTTG	2	10	265	274	0 %	40 %	60 %	0 %	384551480
11	NC_017339	ATTT	2	8	292	299	25 %	75 %	0 %	0 %	384551480
12	NC_017339	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
13	NC_017339	AT	3	6	326	331	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
14	NC_017339	A	6	6	340	345	100 %	0 %	0 %	0 %	384551480
15	NC_017339	AAAG	2	8	363	370	75 %	0 %	25 %	0 %	384551480
16	NC_017339	TAC	3	9	390	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017339	AAGA	2	8	399	406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017339	TTTA	2	8	432	439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017339	AGA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017339	AGC	2	6	503	508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017339	AAG	2	6	539	544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017339	AAAT	2	8	602	609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017339	ATGA	2	8	613	620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017339	GAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017339	AATAT	2	10	751	760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017339	AATC	2	8	765	772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017339	ATC	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017339	A	6	6	851	856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017339	TGG	2	6	914	919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017339	TAAA	2	8	926	933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017339	TAAT	2	8	976	983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017339	TGA	2	6	989	994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017339	GAA	3	9	1011	1019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017339	ATT	3	9	1056	1064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017339	T	7	7	1090	1096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017339	T	6	6	1102	1107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017339	A	7	7	1110	1116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017339	TGTA	2	8	1144	1151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017339	CA	3	6	1190	1195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017339	CATT	2	8	1241	1248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017339	TTAAA	2	10	1292	1301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017339	AGA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017339	A	6	6	1410	1415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017339	TTTTTG	2	12	1437	1448	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017339	AT	3	6	1457	1462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017339	TA	3	6	1494	1499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017339	A	6	6	1574	1579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017339	C	7	7	1586	1592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_017339	TTTC	2	8	1612	1619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017339	TCG	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017339	A	6	6	1644	1649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017339	GTA	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017339	AATT	2	8	1708	1715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017339	A	7	7	1763	1769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017339	CGA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017339	ACG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017339	TTAT	2	8	1931	1938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017339	TAA	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017339	GAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017339	ATT	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017339	TAT	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
62	NC_017339	GTT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
63	NC_017339	GCT	3	9	2304	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551481
64	NC_017339	CAG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551481
65	NC_017339	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
66	NC_017339	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
67	NC_017339	T	6	6	2361	2366	0 %	100 %	0 %	0 %	384551481
68	NC_017339	TAT	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
69	NC_017339	TTAG	2	8	2439	2446	25 %	50 %	25 %	0 %	384551481
70	NC_017339	ATG	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551481
71	NC_017339	AG	3	6	2566	2571	50 %	0 %	50 %	0 %	384551481
72	NC_017339	A	6	6	2574	2579	100 %	0 %	0 %	0 %	384551481
73	NC_017339	TGAA	2	8	2584	2591	50 %	25 %	25 %	0 %	384551481
74	NC_017339	ATA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551481
75	NC_017339	TTAC	2	8	2706	2713	25 %	50 %	0 %	25 %	384551481
76	NC_017339	TAATTT	2	12	2728	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
77	NC_017339	TCT	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551481
78	NC_017339	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
79	NC_017339	TA	3	6	2832	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	384551481
80	NC_017339	TTTA	2	8	2846	2853	25 %	75 %	0 %	0 %	384551481
81	NC_017339	TTA	3	9	2851	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
82	NC_017339	TGTGA	2	10	2940	2949	20 %	40 %	40 %	0 %	384551482
83	NC_017339	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	384551482
84	NC_017339	AGA	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
85	NC_017339	A	6	6	3031	3036	100 %	0 %	0 %	0 %	384551482
86	NC_017339	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551482
87	NC_017339	GAA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
88	NC_017339	AGA	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
89	NC_017339	TG	3	6	3091	3096	0 %	50 %	50 %	0 %	384551482
90	NC_017339	CAT	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551482
91	NC_017339	TA	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384551482
92	NC_017339	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
93	NC_017339	TTA	2	6	3214	3219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
94	NC_017339	AG	3	6	3234	3239	50 %	0 %	50 %	0 %	384551482
95	NC_017339	AGG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384551482
96	NC_017339	TCT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017339	A	6	6	3307	3312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017339	TA	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017339	GAC	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017339	TATC	2	8	3348	3355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017339	GAT	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017339	ATA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017339	TC	3	6	3395	3400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017339	AG	3	6	3419	3424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017339	CAT	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017339	TCA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017339	GCTGT	2	10	3481	3490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017339	TAT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017339	CAA	2	6	3521	3526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017339	TAAT	2	8	3528	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017339	A	6	6	3560	3565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017339	AGT	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017339	TAG	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017339	ATA	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017339	AGT	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017339	AT	3	6	3702	3707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017339	T	6	6	3721	3726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017339	AT	3	6	3738	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
119	NC_017339	TCA	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551483
120	NC_017339	AGA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
121	NC_017339	AGT	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
122	NC_017339	TAA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
123	NC_017339	CAG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551483
124	NC_017339	AGT	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
125	NC_017339	ATA	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
126	NC_017339	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551483
127	NC_017339	GAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
128	NC_017339	TA	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
129	NC_017339	A	6	6	4084	4089	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
130	NC_017339	AAAGT	2	10	4163	4172	60 %	20 %	20 %	0 %	384551483
131	NC_017339	TGGA	2	8	4221	4228	25 %	25 %	50 %	0 %	384551483
132	NC_017339	A	7	7	4257	4263	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
133	NC_017339	A	7	7	4266	4272	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
134	NC_017339	T	6	6	4308	4313	0 %	100 %	0 %	0 %	384551483
135	NC_017339	AGA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
136	NC_017339	ATGT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	25 %	0 %	384551483
137	NC_017339	CA	3	6	4366	4371	50 %	0 %	0 %	50 %	384551483
138	NC_017339	TGA	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
139	NC_017339	AAT	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
140	NC_017339	TCAT	2	8	4441	4448	25 %	50 %	0 %	25 %	384551483
141	NC_017339	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
142	NC_017339	TTAA	2	8	4507	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
143	NC_017339	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
144	NC_017339	A	7	7	4589	4595	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
145	NC_017339	ATA	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
146	NC_017339	TAAA	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	384551483
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