MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017339	AGAA	2	8	18342	18349	75 %	0 %	25 %	0 %	384551498
502	NC_017339	T	6	6	18358	18363	0 %	100 %	0 %	0 %	384551498
503	NC_017339	AAC	2	6	18366	18371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551498
504	NC_017339	ATT	2	6	18441	18446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017339	AG	3	6	18506	18511	50 %	0 %	50 %	0 %	384551499
506	NC_017339	AT	3	6	18545	18550	50 %	50 %	0 %	0 %	384551499
507	NC_017339	TCCT	2	8	18600	18607	0 %	50 %	0 %	50 %	384551499
508	NC_017339	TTAA	2	8	18658	18665	50 %	50 %	0 %	0 %	384551499
509	NC_017339	A	6	6	18682	18687	100 %	0 %	0 %	0 %	384551499
510	NC_017339	AG	4	8	18709	18716	50 %	0 %	50 %	0 %	384551499
511	NC_017339	TGG	2	6	18757	18762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384551499
512	NC_017339	TTTC	2	8	18765	18772	0 %	75 %	0 %	25 %	384551499
513	NC_017339	CATT	2	8	18798	18805	25 %	50 %	0 %	25 %	384551499
514	NC_017339	AGA	2	6	18904	18909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017339	AT	3	6	18931	18936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017339	T	6	6	19003	19008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017339	TAT	2	6	19032	19037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017339	T	6	6	19037	19042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017339	TAA	2	6	19059	19064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017339	TAACG	2	10	19070	19079	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017339	ATG	2	6	19104	19109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017339	TCAT	2	8	19122	19129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_017339	CCT	2	6	19138	19143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017339	CT	3	6	19142	19147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017339	GA	3	6	19165	19170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017339	GAC	2	6	19173	19178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017339	TC	3	6	19196	19201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_017339	TAA	2	6	19225	19230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017339	TGT	2	6	19232	19237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017339	TA	3	6	19238	19243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017339	ATAA	2	8	19250	19257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017339	AAG	2	6	19297	19302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551500
533	NC_017339	AAG	2	6	19321	19326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551500
534	NC_017339	ATTT	2	8	19338	19345	25 %	75 %	0 %	0 %	384551500
535	NC_017339	CAA	2	6	19349	19354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551500
536	NC_017339	TAT	2	6	19368	19373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551500
537	NC_017339	AAG	2	6	19382	19387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551500
538	NC_017339	ATT	2	6	19407	19412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551500
539	NC_017339	TTTG	2	8	19587	19594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017339	GAT	2	6	19607	19612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017339	A	6	6	19634	19639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017339	TTAA	2	8	19672	19679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017339	GAC	2	6	19696	19701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551501
544	NC_017339	TTC	2	6	19727	19732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
545	NC_017339	TCT	2	6	19740	19745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
546	NC_017339	TCT	2	6	19782	19787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
547	NC_017339	CTT	2	6	19795	19800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
548	NC_017339	TCG	2	6	19815	19820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551501
549	NC_017339	AT	3	6	19834	19839	50 %	50 %	0 %	0 %	384551501
550	NC_017339	TTC	2	6	19868	19873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
551	NC_017339	TAG	2	6	19900	19905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551501
552	NC_017339	T	6	6	19912	19917	0 %	100 %	0 %	0 %	384551501
553	NC_017339	TAG	2	6	19945	19950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551501
554	NC_017339	TTTTTC	2	12	19976	19987	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384551501
555	NC_017339	CT	3	6	20022	20027	0 %	50 %	0 %	50 %	384551501
556	NC_017339	TCTT	2	8	20063	20070	0 %	75 %	0 %	25 %	384551501
557	NC_017339	TTG	2	6	20095	20100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551501
558	NC_017339	GAC	2	6	20107	20112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551501
559	NC_017339	ATT	2	6	20132	20137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551501
560	NC_017339	CTA	2	6	20167	20172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551501
561	NC_017339	T	8	8	20216	20223	0 %	100 %	0 %	0 %	384551501
562	NC_017339	T	6	6	20287	20292	0 %	100 %	0 %	0 %	384551501
563	NC_017339	TCT	2	6	20304	20309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
564	NC_017339	TAA	2	6	20311	20316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551501
565	NC_017339	ATT	2	6	20363	20368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551501
566	NC_017339	TTC	2	6	20396	20401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551501
567	NC_017339	ATC	2	6	20426	20431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017339	TAA	3	9	20488	20496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017339	T	6	6	20597	20602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017339	TAA	2	6	20622	20627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017339	ACT	2	6	20650	20655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017339	TAA	2	6	20675	20680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017339	TTTA	2	8	20696	20703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017339	TA	3	6	20702	20707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017339	TA	3	6	20725	20730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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