MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 67367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_017338	TGAC	2	8	2663120	2663127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64002	NC_017338	T	6	6	2663158	2663163	0 %	100 %	0 %	0 %	384551351
64003	NC_017338	ATC	2	6	2663169	2663174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551351
64004	NC_017338	ATG	2	6	2663218	2663223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551351
64005	NC_017338	CAAT	2	8	2663239	2663246	50 %	25 %	0 %	25 %	384551351
64006	NC_017338	ACC	2	6	2663261	2663266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384551351
64007	NC_017338	CATCGT	2	12	2663282	2663293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384551351
64008	NC_017338	A	6	6	2663321	2663326	100 %	0 %	0 %	0 %	384551351
64009	NC_017338	AGT	2	6	2663334	2663339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551351
64010	NC_017338	TAA	2	6	2663363	2663368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64011	NC_017338	AAAAT	2	10	2663419	2663428	80 %	20 %	0 %	0 %	384551351
64012	NC_017338	TAA	2	6	2663456	2663461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64013	NC_017338	ATA	2	6	2663464	2663469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64014	NC_017338	GTT	2	6	2663659	2663664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551351
64015	NC_017338	TAT	2	6	2663689	2663694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551351
64016	NC_017338	TGC	2	6	2663858	2663863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551351
64017	NC_017338	GCT	2	6	2663874	2663879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551351
64018	NC_017338	ATC	2	6	2663964	2663969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551351
64019	NC_017338	CAG	2	6	2663998	2664003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551351
64020	NC_017338	ATA	2	6	2664085	2664090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64021	NC_017338	AT	3	6	2664100	2664105	50 %	50 %	0 %	0 %	384551351
64022	NC_017338	TGT	2	6	2664119	2664124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551351
64023	NC_017338	ATAC	2	8	2664151	2664158	50 %	25 %	0 %	25 %	384551351
64024	NC_017338	CAA	2	6	2664224	2664229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551351
64025	NC_017338	GTC	2	6	2664268	2664273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551351
64026	NC_017338	TCGC	2	8	2664312	2664319	0 %	25 %	25 %	50 %	384551351
64027	NC_017338	GAA	2	6	2664327	2664332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551351
64028	NC_017338	TAA	2	6	2664377	2664382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64029	NC_017338	TAA	2	6	2664427	2664432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64030	NC_017338	AAT	2	6	2664436	2664441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551351
64031	NC_017338	TCATA	2	10	2664478	2664487	40 %	40 %	0 %	20 %	384551351
64032	NC_017338	AAT	2	6	2664525	2664530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551352
64033	NC_017338	T	7	7	2664548	2664554	0 %	100 %	0 %	0 %	384551352
64034	NC_017338	TCA	2	6	2664719	2664724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551352
64035	NC_017338	TGT	2	6	2664727	2664732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551352
64036	NC_017338	TGT	2	6	2664751	2664756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551352
64037	NC_017338	TTG	2	6	2664766	2664771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551352
64038	NC_017338	T	6	6	2664782	2664787	0 %	100 %	0 %	0 %	384551352
64039	NC_017338	TGATA	2	10	2664855	2664864	40 %	40 %	20 %	0 %	384551352
64040	NC_017338	CATT	2	8	2664906	2664913	25 %	50 %	0 %	25 %	384551352
64041	NC_017338	T	6	6	2665043	2665048	0 %	100 %	0 %	0 %	384551352
64042	NC_017338	GCA	2	6	2665061	2665066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551352
64043	NC_017338	TTA	2	6	2665109	2665114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551352
64044	NC_017338	TGT	2	6	2665225	2665230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551352
64045	NC_017338	CAT	2	6	2665251	2665256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551352
64046	NC_017338	AT	3	6	2665263	2665268	50 %	50 %	0 %	0 %	384551352
64047	NC_017338	TC	3	6	2665341	2665346	0 %	50 %	0 %	50 %	384551352
64048	NC_017338	TTC	2	6	2665357	2665362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551352
64049	NC_017338	TAAATG	2	12	2665365	2665376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384551352
64050	NC_017338	AATG	2	8	2665478	2665485	50 %	25 %	25 %	0 %	384551352
64051	NC_017338	AAT	2	6	2665507	2665512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551352
64052	NC_017338	TCT	2	6	2665517	2665522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551352
64053	NC_017338	ATACCT	2	12	2665550	2665561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551352
64054	NC_017338	GCA	2	6	2665562	2665567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551352
64055	NC_017338	ATA	2	6	2665577	2665582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551352
64056	NC_017338	ATG	2	6	2665591	2665596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551352
64057	NC_017338	TAA	2	6	2665656	2665661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64058	NC_017338	T	6	6	2665768	2665773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64059	NC_017338	ATTT	2	8	2665896	2665903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64060	NC_017338	CGT	2	6	2665904	2665909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64061	NC_017338	TTG	2	6	2665941	2665946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551353
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64063	NC_017338	ATA	2	6	2666076	2666081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551353
64064	NC_017338	TAA	2	6	2666174	2666179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551353
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64067	NC_017338	ATTT	2	8	2666233	2666240	25 %	75 %	0 %	0 %	384551353
64068	NC_017338	TCC	2	6	2666241	2666246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551354
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64070	NC_017338	CTT	2	6	2666299	2666304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551354
64071	NC_017338	TGC	2	6	2666337	2666342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551354
64072	NC_017338	CGT	2	6	2666364	2666369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551354
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64078	NC_017338	TAT	2	6	2666673	2666678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551355
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64087	NC_017338	ATT	2	6	2666915	2666920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64088	NC_017338	AT	3	6	2666934	2666939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64089	NC_017338	ATT	2	6	2666992	2666997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64090	NC_017338	AATA	2	8	2667003	2667010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64091	NC_017338	ATTTT	2	10	2667111	2667120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64092	NC_017338	A	6	6	2667129	2667134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64093	NC_017338	ATT	2	6	2667194	2667199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64094	NC_017338	TAA	2	6	2667214	2667219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64095	NC_017338	TGT	2	6	2667226	2667231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551356
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64102	NC_017338	ACC	2	6	2667502	2667507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384551356
64103	NC_017338	TAA	2	6	2667523	2667528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551356
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64105	NC_017338	CTT	2	6	2667816	2667821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551356
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64109	NC_017338	GTATCC	2	12	2667977	2667988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384551356
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64112	NC_017338	TAT	2	6	2668118	2668123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64113	NC_017338	GAT	2	6	2668137	2668142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64114	NC_017338	AT	3	6	2668239	2668244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64115	NC_017338	AT	3	6	2668250	2668255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64116	NC_017338	ATTA	2	8	2668312	2668319	50 %	50 %	0 %	0 %	384551357
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64118	NC_017338	GTC	2	6	2668412	2668417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551357
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64213	NC_017338	TCC	2	6	2672191	2672196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64214	NC_017338	TGA	2	6	2672254	2672259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64216	NC_017338	ACAA	2	8	2672296	2672303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64217	NC_017338	TA	3	6	2672483	2672488	50 %	50 %	0 %	0 %	384551362
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64223	NC_017338	TGG	2	6	2672848	2672853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384551362
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64226	NC_017338	CAA	2	6	2673034	2673039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551362
64227	NC_017338	GAT	2	6	2673055	2673060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551362
64228	NC_017338	CTA	2	6	2673106	2673111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551362
64229	NC_017338	AGA	2	6	2673183	2673188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551362
64230	NC_017338	TAC	2	6	2673229	2673234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551362
64231	NC_017338	AGA	2	6	2673285	2673290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551362
64232	NC_017338	GTCAGC	2	12	2673363	2673374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384551362
64233	NC_017338	CA	3	6	2673427	2673432	50 %	0 %	0 %	50 %	384551362
64234	NC_017338	TAG	2	6	2673450	2673455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551362
64235	NC_017338	ACA	2	6	2673489	2673494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551362
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