MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_2

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017332	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017332	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017332	GAAC	2	8	133	140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017332	AT	3	6	148	153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017332	TAT	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017332	AAAT	2	8	205	212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017332	AT	3	6	211	216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017332	T	6	6	237	242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017332	AT	3	6	541	546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017332	TACA	2	8	572	579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017332	T	6	6	607	612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017332	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017332	A	6	6	626	631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017332	TCA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017332	ATA	2	6	658	663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144418
16	NC_017332	CTT	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144418
17	NC_017332	TCA	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144418
18	NC_017332	ATTA	2	8	745	752	50 %	50 %	0 %	0 %	387144418
19	NC_017332	CCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144418
20	NC_017332	T	7	7	872	878	0 %	100 %	0 %	0 %	387144418
21	NC_017332	A	6	6	893	898	100 %	0 %	0 %	0 %	387144418
22	NC_017332	TTC	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144418
23	NC_017332	TA	3	6	1054	1059	50 %	50 %	0 %	0 %	387144418
24	NC_017332	T	7	7	1066	1072	0 %	100 %	0 %	0 %	387144418
25	NC_017332	CAT	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144418
26	NC_017332	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144418
27	NC_017332	CAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144418
28	NC_017332	TTAG	2	8	1220	1227	25 %	50 %	25 %	0 %	387144418
29	NC_017332	CAAC	2	8	1291	1298	50 %	0 %	0 %	50 %	387144418
30	NC_017332	CTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144418
31	NC_017332	TCGG	2	8	1439	1446	0 %	25 %	50 %	25 %	387144418
32	NC_017332	T	6	6	1490	1495	0 %	100 %	0 %	0 %	387144418
33	NC_017332	TTTTC	2	10	1539	1548	0 %	80 %	0 %	20 %	387144418
34	NC_017332	TC	3	6	1547	1552	0 %	50 %	0 %	50 %	387144418
35	NC_017332	GTT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144418
36	NC_017332	TAT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144418
37	NC_017332	TAG	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144418
38	NC_017332	TAT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144418
39	NC_017332	TAT	2	6	1658	1663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017332	TAA	2	6	1680	1685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017332	T	6	6	1697	1702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017332	TA	5	10	1767	1776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017332	TA	3	6	1792	1797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017332	CAAGA	2	10	1802	1811	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017332	TAAA	2	8	1878	1885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017332	AATA	2	8	1904	1911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017332	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017332	A	6	6	1996	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017332	TAAA	2	8	2002	2009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017332	ATATT	2	10	2046	2055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017332	AACAA	2	10	2070	2079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017332	AATG	2	8	2092	2099	50 %	25 %	25 %	0 %	387144419
53	NC_017332	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	387144419
54	NC_017332	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	387144419
55	NC_017332	AATTTT	2	12	2177	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144419
56	NC_017332	AAG	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144419
57	NC_017332	CAAAA	2	10	2204	2213	80 %	0 %	0 %	20 %	387144419
58	NC_017332	ACA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144419
59	NC_017332	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	387144419
60	NC_017332	ATT	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144419
61	NC_017332	GATATG	2	12	2352	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144419
62	NC_017332	TGG	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144419
63	NC_017332	GCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144419
64	NC_017332	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144419
65	NC_017332	GCA	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144419
66	NC_017332	A	7	7	2572	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	387144419
67	NC_017332	CTA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144419
68	NC_017332	AT	3	6	2675	2680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017332	TCG	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017332	TTC	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017332	TAAA	2	8	2869	2876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017332	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017332	TTCA	2	8	2918	2925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017332	TAA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.