MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017328	TCT	2	6	168136	168141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017328	CT	3	6	168140	168145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_017328	GCC	2	6	168201	168206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541730
3504	NC_017328	CAT	2	6	168236	168241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541730
3505	NC_017328	TAA	2	6	168273	168278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541730
3506	NC_017328	CCG	2	6	168297	168302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541730
3507	NC_017328	ATA	2	6	168303	168308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541730
3508	NC_017328	CGC	2	6	168379	168384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541730
3509	NC_017328	TGGC	2	8	168524	168531	0 %	25 %	50 %	25 %	384541730
3510	NC_017328	TGT	2	6	168838	168843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541731
3511	NC_017328	ATA	2	6	168853	168858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541731
3512	NC_017328	GGTCC	2	10	168950	168959	0 %	20 %	40 %	40 %	384541731
3513	NC_017328	T	6	6	169140	169145	0 %	100 %	0 %	0 %	384541731
3514	NC_017328	CAG	2	6	169188	169193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541731
3515	NC_017328	GGA	2	6	169444	169449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541731
3516	NC_017328	GCT	2	6	169461	169466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541731
3517	NC_017328	CGG	2	6	169487	169492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541731
3518	NC_017328	TGA	2	6	169526	169531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541731
3519	NC_017328	CG	3	6	169532	169537	0 %	0 %	50 %	50 %	384541731
3520	NC_017328	GCG	2	6	169540	169545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541731
3521	NC_017328	ACA	2	6	169727	169732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541732
3522	NC_017328	TGA	2	6	169842	169847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541732
3523	NC_017328	CGC	2	6	169854	169859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541732
3524	NC_017328	CGT	2	6	170001	170006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541732
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3526	NC_017328	CAG	2	6	170113	170118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541732
3527	NC_017328	CCG	2	6	170210	170215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541732
3528	NC_017328	GCA	2	6	170250	170255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541732
3529	NC_017328	CTT	3	9	170262	170270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541732
3530	NC_017328	ATG	2	6	170282	170287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541732
3531	NC_017328	GATT	2	8	170390	170397	25 %	50 %	25 %	0 %	384541733
3532	NC_017328	A	8	8	170402	170409	100 %	0 %	0 %	0 %	384541733
3533	NC_017328	TCG	2	6	170420	170425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541733
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3542	NC_017328	AGCC	2	8	170820	170827	25 %	0 %	25 %	50 %	384541733
3543	NC_017328	CTGA	2	8	170829	170836	25 %	25 %	25 %	25 %	384541733
3544	NC_017328	GGC	2	6	170852	170857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541733
3545	NC_017328	ACGGG	2	10	170867	170876	20 %	0 %	60 %	20 %	384541733
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3553	NC_017328	AGC	2	6	171247	171252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541733
3554	NC_017328	ATC	2	6	171256	171261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541733
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3557	NC_017328	TAAA	2	8	171403	171410	75 %	25 %	0 %	0 %	384541733
3558	NC_017328	CTGC	2	8	171447	171454	0 %	25 %	25 %	50 %	384541733
3559	NC_017328	ATT	2	6	171482	171487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541733
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3564	NC_017328	TTA	2	6	171630	171635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541733
3565	NC_017328	ATT	2	6	171802	171807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541733
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3569	NC_017328	GAA	2	6	171982	171987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017328	A	8	8	172032	172039	100 %	0 %	0 %	0 %	384541734
3571	NC_017328	CT	3	6	172092	172097	0 %	50 %	0 %	50 %	384541734
3572	NC_017328	CGG	2	6	172102	172107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541734
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3580	NC_017328	GGC	3	9	172335	172343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541734
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3582	NC_017328	GTC	2	6	172404	172409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541734
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3588	NC_017328	ATCGGT	2	12	172812	172823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384541734
3589	NC_017328	TGG	2	6	172867	172872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541734
3590	NC_017328	TAT	2	6	172904	172909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541734
3591	NC_017328	TCC	2	6	172995	173000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541734
3592	NC_017328	GTGAT	2	10	173026	173035	20 %	40 %	40 %	0 %	384541734
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3600	NC_017328	GTGAT	2	10	173317	173326	20 %	40 %	40 %	0 %	384541734
3601	NC_017328	CAG	2	6	173340	173345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541734
3602	NC_017328	GCG	2	6	173419	173424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541734
3603	NC_017328	TCA	2	6	173531	173536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017328	TACGT	2	10	173562	173571	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3605	NC_017328	GGA	2	6	173599	173604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017328	TGGC	3	12	173609	173620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_017328	CAT	2	6	173667	173672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017328	GCG	2	6	173720	173725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_017328	GTC	2	6	173785	173790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_017328	ATG	2	6	173947	173952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017328	TTG	2	6	173977	173982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017328	GAA	2	6	174004	174009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017328	TGA	2	6	174014	174019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017328	GATC	2	8	174077	174084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_017328	TCAA	2	8	174085	174092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_017328	GTG	2	6	174099	174104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017328	TTG	2	6	174109	174114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017328	ACA	2	6	174161	174166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_017328	TAA	2	6	174197	174202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017328	TGG	2	6	174205	174210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017328	TGG	2	6	174232	174237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3623	NC_017328	AAC	2	6	174301	174306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3991	NC_017328	GAA	2	6	193949	193954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541753
3992	NC_017328	TTG	2	6	193971	193976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541753
3993	NC_017328	GTC	2	6	193986	193991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541753
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3995	NC_017328	CATT	2	8	194128	194135	25 %	50 %	0 %	25 %	384541753
3996	NC_017328	ATGCC	2	10	194286	194295	20 %	20 %	20 %	40 %	384541753
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