MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017328	GTG	2	6	98215	98220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541668
2003	NC_017328	GCA	2	6	98262	98267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541668
2004	NC_017328	GT	3	6	98297	98302	0 %	50 %	50 %	0 %	384541668
2005	NC_017328	GTGG	2	8	98308	98315	0 %	25 %	75 %	0 %	384541668
2006	NC_017328	TGC	2	6	98358	98363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541668
2007	NC_017328	CAA	2	6	98413	98418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541668
2008	NC_017328	GCA	2	6	98454	98459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541668
2009	NC_017328	TGA	2	6	98478	98483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541668
2010	NC_017328	GGC	3	9	98487	98495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541668
2011	NC_017328	GTC	2	6	98512	98517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541668
2012	NC_017328	CGC	2	6	98553	98558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541668
2013	NC_017328	GTT	2	6	98574	98579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541668
2014	NC_017328	AGC	2	6	98660	98665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541668
2015	NC_017328	GGT	2	6	98705	98710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541668
2016	NC_017328	TTA	2	6	98722	98727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541668
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2023	NC_017328	GCA	2	6	99038	99043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541669
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2035	NC_017328	TGA	2	6	99560	99565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541669
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2048	NC_017328	CG	3	6	100027	100032	0 %	0 %	50 %	50 %	384541669
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2104	NC_017328	TAT	2	6	103207	103212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541672
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2106	NC_017328	CGA	2	6	103360	103365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_017328	GA	3	6	103398	103403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_017328	TCGGCG	2	12	103454	103465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384541673
2109	NC_017328	GCG	4	12	103463	103474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541673
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2118	NC_017328	GTC	2	6	103795	103800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541673
2119	NC_017328	AAG	2	6	103825	103830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541673
2120	NC_017328	CT	3	6	103881	103886	0 %	50 %	0 %	50 %	384541673
2121	NC_017328	CTG	2	6	103909	103914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541673
2122	NC_017328	CTG	2	6	103939	103944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541673
2123	NC_017328	TGA	2	6	104021	104026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541673
2124	NC_017328	ATG	2	6	104077	104082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541673
2125	NC_017328	TGGCG	2	10	104088	104097	0 %	20 %	60 %	20 %	384541673
2126	NC_017328	GAA	2	6	104116	104121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541673
2127	NC_017328	GCT	2	6	104122	104127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541673
2128	NC_017328	TCT	2	6	104140	104145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541673
2129	NC_017328	GCT	2	6	104148	104153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541673
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2131	NC_017328	CGG	2	6	104201	104206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541673
2132	NC_017328	GGTA	2	8	104238	104245	25 %	25 %	50 %	0 %	384541673
2133	NC_017328	ATGA	2	8	104311	104318	50 %	25 %	25 %	0 %	384541673
2134	NC_017328	GTT	2	6	104335	104340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541673
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2137	NC_017328	AGT	2	6	104475	104480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541673
2138	NC_017328	AAGC	2	8	104545	104552	50 %	0 %	25 %	25 %	384541673
2139	NC_017328	CCG	2	6	104606	104611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_017328	ATA	2	6	104652	104657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_017328	GAT	2	6	104659	104664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541674
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2143	NC_017328	TCG	2	6	104776	104781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541674
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2145	NC_017328	TGC	2	6	104902	104907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541674
2146	NC_017328	CTG	2	6	104999	105004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541674
2147	NC_017328	CGA	2	6	105019	105024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541674
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2152	NC_017328	ATT	2	6	105419	105424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541674
2153	NC_017328	CTG	2	6	105470	105475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541674
2154	NC_017328	GAC	2	6	105524	105529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541674
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2156	NC_017328	T	9	9	105648	105656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2157	NC_017328	A	6	6	105675	105680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2158	NC_017328	TTA	2	6	105868	105873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541675
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2162	NC_017328	GAA	2	6	106123	106128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541675
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2164	NC_017328	AAC	2	6	106319	106324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541675
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2166	NC_017328	TAT	2	6	106378	106383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541676
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2172	NC_017328	CTGC	2	8	106721	106728	0 %	25 %	25 %	50 %	384541676
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2183	NC_017328	CTG	2	6	107234	107239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541676
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2196	NC_017328	TGG	2	6	107739	107744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541676
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2201	NC_017328	A	6	6	107985	107990	100 %	0 %	0 %	0 %	384541676
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2224	NC_017328	A	6	6	109052	109057	100 %	0 %	0 %	0 %	384541676
2225	NC_017328	T	6	6	109127	109132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2226	NC_017328	GGTA	2	8	109167	109174	25 %	25 %	50 %	0 %	384541677
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2231	NC_017328	G	6	6	109420	109425	0 %	0 %	100 %	0 %	384541677
2232	NC_017328	AAG	2	6	109436	109441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541677
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2234	NC_017328	GAT	2	6	109483	109488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541677
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2236	NC_017328	CGC	2	6	109554	109559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541678
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2240	NC_017328	GCA	2	6	109983	109988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541680
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2242	NC_017328	GCC	2	6	110197	110202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541680
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2357	NC_017328	TCTGT	2	10	115668	115677	0 %	60 %	20 %	20 %	384541686
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2370	NC_017328	CAC	2	6	116459	116464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2371	NC_017328	TGT	2	6	116483	116488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541687
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2474	NC_017328	GATA	2	8	120747	120754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2475	NC_017328	GAA	2	6	120844	120849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541691
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2493	NC_017328	CTG	2	6	121669	121674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2494	NC_017328	TGA	2	6	121706	121711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541691
2495	NC_017328	CTT	2	6	121776	121781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541691
2496	NC_017328	GCA	2	6	121801	121806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2497	NC_017328	GACTG	2	10	121816	121825	20 %	20 %	40 %	20 %	384541691
2498	NC_017328	GTG	2	6	121850	121855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541691
2499	NC_017328	GAA	2	6	121866	121871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541691
2500	NC_017328	GCGT	2	8	122015	122022	0 %	25 %	50 %	25 %	384541691

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