MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017328	TGG	2	6	881292	881297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542420
18002	NC_017328	GGAAAC	2	12	881302	881313	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384542420
18003	NC_017328	CAT	2	6	881348	881353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542420
18004	NC_017328	CCG	2	6	881422	881427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542420
18005	NC_017328	GAA	2	6	881473	881478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542420
18006	NC_017328	CGT	2	6	881720	881725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
18007	NC_017328	GCT	2	6	881746	881751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
18008	NC_017328	A	7	7	881753	881759	100 %	0 %	0 %	0 %	384542420
18009	NC_017328	TGGC	2	8	881777	881784	0 %	25 %	50 %	25 %	384542420
18010	NC_017328	GC	3	6	881783	881788	0 %	0 %	50 %	50 %	384542420
18011	NC_017328	CG	3	6	881792	881797	0 %	0 %	50 %	50 %	384542420
18012	NC_017328	T	6	6	881875	881880	0 %	100 %	0 %	0 %	384542421
18013	NC_017328	CGC	2	6	881952	881957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542421
18014	NC_017328	CTT	2	6	882000	882005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542421
18015	NC_017328	AAT	2	6	882055	882060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542421
18016	NC_017328	ACAG	2	8	882087	882094	50 %	0 %	25 %	25 %	384542421
18017	NC_017328	TCG	2	6	882141	882146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542421
18018	NC_017328	CA	3	6	882228	882233	50 %	0 %	0 %	50 %	384542421
18019	NC_017328	CTT	2	6	882297	882302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542421
18020	NC_017328	ATC	2	6	882314	882319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542421
18021	NC_017328	TTC	2	6	882406	882411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542421
18022	NC_017328	GTAAC	2	10	882445	882454	40 %	20 %	20 %	20 %	384542421
18023	NC_017328	AAC	2	6	882536	882541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542421
18024	NC_017328	GTTC	2	8	882567	882574	0 %	50 %	25 %	25 %	384542421
18025	NC_017328	GCA	2	6	882612	882617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542421
18026	NC_017328	GCT	2	6	882700	882705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542421
18027	NC_017328	GA	3	6	882706	882711	50 %	0 %	50 %	0 %	384542421
18028	NC_017328	TTG	2	6	882847	882852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_017328	GAA	2	6	882927	882932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542422
18030	NC_017328	CGTTA	2	10	882934	882943	20 %	40 %	20 %	20 %	384542422
18031	NC_017328	GC	3	6	883100	883105	0 %	0 %	50 %	50 %	384542422
18032	NC_017328	A	7	7	883155	883161	100 %	0 %	0 %	0 %	384542422
18033	NC_017328	AGG	2	6	883211	883216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542422
18034	NC_017328	CG	3	6	883240	883245	0 %	0 %	50 %	50 %	384542422
18035	NC_017328	GCA	2	6	883251	883256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542422
18036	NC_017328	CCG	2	6	883349	883354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542422
18037	NC_017328	CT	3	6	883422	883427	0 %	50 %	0 %	50 %	384542422
18038	NC_017328	CAC	2	6	883497	883502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542422
18039	NC_017328	AGCA	2	8	883532	883539	50 %	0 %	25 %	25 %	384542422
18040	NC_017328	ACG	2	6	883715	883720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542422
18041	NC_017328	TGC	2	6	883766	883771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542422
18042	NC_017328	TTG	2	6	883885	883890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542422
18043	NC_017328	GTG	2	6	883984	883989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542422
18044	NC_017328	TCG	2	6	884048	884053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
18045	NC_017328	TGA	2	6	884069	884074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542423
18046	NC_017328	TTG	2	6	884134	884139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542423
18047	NC_017328	TGA	2	6	884167	884172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542423
18048	NC_017328	CCA	2	6	884197	884202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542423
18049	NC_017328	CCG	2	6	884347	884352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542423
18050	NC_017328	TGC	2	6	884401	884406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
18051	NC_017328	GGCTGG	2	12	884410	884421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384542423
18052	NC_017328	TAT	2	6	884436	884441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542423
18053	NC_017328	GGT	2	6	884457	884462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
18054	NC_017328	CG	3	6	884483	884488	0 %	0 %	50 %	50 %	384542423
18055	NC_017328	TGA	2	6	884494	884499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542423
18056	NC_017328	CGG	2	6	884501	884506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542423
18057	NC_017328	ACCG	2	8	884528	884535	25 %	0 %	25 %	50 %	384542423
18058	NC_017328	GCT	2	6	884637	884642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
18059	NC_017328	TCC	2	6	884690	884695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542423
18060	NC_017328	TGT	2	6	884735	884740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542423
18061	NC_017328	CTGG	2	8	884752	884759	0 %	25 %	50 %	25 %	384542423
18062	NC_017328	ATGGC	2	10	884796	884805	20 %	20 %	40 %	20 %	384542423
18063	NC_017328	ATT	2	6	884853	884858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542423
18064	NC_017328	GGT	2	6	884873	884878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
18065	NC_017328	GTG	2	6	884889	884894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
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18067	NC_017328	CAAA	2	8	884906	884913	75 %	0 %	0 %	25 %	384542423
18068	NC_017328	CAG	2	6	885000	885005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542423
18069	NC_017328	ACG	2	6	885016	885021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542423
18070	NC_017328	AAC	2	6	885040	885045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542423
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18072	NC_017328	ATGTTG	2	12	885103	885114	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384542423
18073	NC_017328	GCG	2	6	885136	885141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542423
18074	NC_017328	ATT	2	6	885142	885147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542423
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18078	NC_017328	TGC	2	6	885364	885369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
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18080	NC_017328	AAG	2	6	885513	885518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542423
18081	NC_017328	TGG	2	6	885598	885603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
18082	NC_017328	TGG	3	9	885616	885624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
18083	NC_017328	GCT	3	9	885857	885865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
18084	NC_017328	AGA	2	6	886031	886036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_017328	TGG	2	6	886102	886107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542424
18086	NC_017328	CCAT	2	8	886150	886157	25 %	25 %	0 %	50 %	384542424
18087	NC_017328	TGG	2	6	886163	886168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542424
18088	NC_017328	AAT	2	6	886169	886174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542424
18089	NC_017328	CGC	3	9	886190	886198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542424
18090	NC_017328	AAACC	2	10	886213	886222	60 %	0 %	0 %	40 %	384542424
18091	NC_017328	TTG	2	6	886231	886236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542424
18092	NC_017328	AG	3	6	886316	886321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_017328	GAT	2	6	886482	886487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_017328	TATC	2	8	886491	886498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18095	NC_017328	TAACCG	2	12	886557	886568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18096	NC_017328	GAT	2	6	886571	886576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_017328	ACGA	2	8	886594	886601	50 %	0 %	25 %	25 %	384542425
18098	NC_017328	CTGG	2	8	886602	886609	0 %	25 %	50 %	25 %	384542425
18099	NC_017328	GAA	2	6	886627	886632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542425
18100	NC_017328	ATG	2	6	886685	886690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542425
18101	NC_017328	TTCTT	2	10	886732	886741	0 %	80 %	0 %	20 %	384542425
18102	NC_017328	ATG	2	6	886742	886747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542425
18103	NC_017328	CCG	2	6	886814	886819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542425
18104	NC_017328	TCAA	2	8	886940	886947	50 %	25 %	0 %	25 %	384542426
18105	NC_017328	GC	3	6	886984	886989	0 %	0 %	50 %	50 %	384542426
18106	NC_017328	GCT	2	6	887034	887039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542426
18107	NC_017328	CTGC	2	8	887140	887147	0 %	25 %	25 %	50 %	384542426
18108	NC_017328	AC	3	6	887165	887170	50 %	0 %	0 %	50 %	384542426
18109	NC_017328	TCC	2	6	887224	887229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542426
18110	NC_017328	GGC	2	6	887292	887297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542426
18111	NC_017328	TC	3	6	887348	887353	0 %	50 %	0 %	50 %	384542426
18112	NC_017328	TCT	2	6	887383	887388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542426
18113	NC_017328	CAGC	2	8	887397	887404	25 %	0 %	25 %	50 %	384542426
18114	NC_017328	GAA	2	6	887413	887418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542426
18115	NC_017328	TGG	2	6	887424	887429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542426
18116	NC_017328	GGA	2	6	887430	887435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542426
18117	NC_017328	ACG	2	6	887452	887457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542426
18118	NC_017328	GCT	2	6	887565	887570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542426
18119	NC_017328	CT	3	6	887673	887678	0 %	50 %	0 %	50 %	384542426
18120	NC_017328	AGC	2	6	887750	887755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542426
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18423	NC_017328	A	6	6	901140	901145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18424	NC_017328	TAG	2	6	901177	901182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18484	NC_017328	GCA	2	6	904316	904321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542436
18485	NC_017328	TCTGG	2	10	904363	904372	0 %	40 %	40 %	20 %	384542436
18486	NC_017328	CAG	2	6	904411	904416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542436
18487	NC_017328	AT	3	6	904473	904478	50 %	50 %	0 %	0 %	384542436
18488	NC_017328	T	7	7	904526	904532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18489	NC_017328	AAT	2	6	904553	904558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18490	NC_017328	CTC	2	6	904561	904566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18491	NC_017328	TAC	2	6	904579	904584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18492	NC_017328	ATT	2	6	904622	904627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_017328	TA	3	6	904643	904648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18494	NC_017328	GCT	2	6	904653	904658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18495	NC_017328	AAT	2	6	904664	904669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_017328	AATC	2	8	904693	904700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18497	NC_017328	TGAG	2	8	904712	904719	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18498	NC_017328	GCT	2	6	904755	904760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18499	NC_017328	GAG	2	6	904761	904766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18500	NC_017328	CGG	2	6	904799	904804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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