MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_017328	GTGGGT	2	12	807789	807800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542354
16503	NC_017328	TCT	2	6	808126	808131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_017328	TGC	2	6	808151	808156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_017328	ATG	2	6	808176	808181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_017328	CCT	2	6	808226	808231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16507	NC_017328	GTG	2	6	808249	808254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_017328	CCG	2	6	808271	808276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16509	NC_017328	CCGC	2	8	808406	808413	0 %	0 %	25 %	75 %	384542355
16510	NC_017328	A	6	6	808452	808457	100 %	0 %	0 %	0 %	384542355
16511	NC_017328	GCTG	2	8	808564	808571	0 %	25 %	50 %	25 %	384542355
16512	NC_017328	GTT	2	6	808602	808607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542355
16513	NC_017328	CTG	2	6	808659	808664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542355
16514	NC_017328	GTG	2	6	808677	808682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542355
16515	NC_017328	TGGC	2	8	808697	808704	0 %	25 %	50 %	25 %	384542355
16516	NC_017328	GCA	2	6	808793	808798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542355
16517	NC_017328	ATTT	2	8	808930	808937	25 %	75 %	0 %	0 %	384542356
16518	NC_017328	AAG	2	6	808976	808981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542356
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16520	NC_017328	CGC	2	6	809025	809030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542356
16521	NC_017328	ATC	2	6	809074	809079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542356
16522	NC_017328	AG	3	6	809147	809152	50 %	0 %	50 %	0 %	384542356
16523	NC_017328	GCT	2	6	809155	809160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542356
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16526	NC_017328	CTT	2	6	809415	809420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542356
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16529	NC_017328	GCA	2	6	809621	809626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542356
16530	NC_017328	GCT	2	6	809656	809661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542356
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16537	NC_017328	T	7	7	810004	810010	0 %	100 %	0 %	0 %	384542356
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16543	NC_017328	TTAA	2	8	810305	810312	50 %	50 %	0 %	0 %	384542356
16544	NC_017328	AAG	2	6	810516	810521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_017328	GCC	2	6	810531	810536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16546	NC_017328	ACT	2	6	810547	810552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16547	NC_017328	T	7	7	810601	810607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_017328	GCG	2	6	810649	810654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16549	NC_017328	CGC	2	6	810663	810668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16550	NC_017328	TGC	2	6	810690	810695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16551	NC_017328	TGT	2	6	810700	810705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16552	NC_017328	AG	3	6	810725	810730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16555	NC_017328	GAT	2	6	810835	810840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16557	NC_017328	TATAT	2	10	810868	810877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_017328	T	6	6	810898	810903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_017328	TATG	2	8	810951	810958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_017328	GTC	2	6	810986	810991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542357
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16563	NC_017328	TGA	2	6	811095	811100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542357
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16572	NC_017328	T	7	7	811484	811490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16575	NC_017328	CTG	2	6	811555	811560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542358
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16602	NC_017328	A	6	6	812577	812582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16608	NC_017328	ACCG	2	8	812859	812866	25 %	0 %	25 %	50 %	384542359
16609	NC_017328	CA	3	6	812910	812915	50 %	0 %	0 %	50 %	384542359
16610	NC_017328	TGG	2	6	813122	813127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542359
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16613	NC_017328	CAGTA	2	10	813288	813297	40 %	20 %	20 %	20 %	384542359
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16620	NC_017328	TCT	2	6	813701	813706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16624	NC_017328	GAA	2	6	814088	814093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542360
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16739	NC_017328	ATC	2	6	820102	820107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542363
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16741	NC_017328	GC	3	6	820245	820250	0 %	0 %	50 %	50 %	384542363
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16744	NC_017328	GC	4	8	820305	820312	0 %	0 %	50 %	50 %	384542363
16745	NC_017328	GGC	2	6	820325	820330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542363
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16860	NC_017328	TGC	2	6	826529	826534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542369
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