MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017328	GC	3	6	783567	783572	0 %	0 %	50 %	50 %	384542334
16003	NC_017328	CT	3	6	783583	783588	0 %	50 %	0 %	50 %	384542334
16004	NC_017328	ATCC	2	8	783594	783601	25 %	25 %	0 %	50 %	384542334
16005	NC_017328	CAT	2	6	783645	783650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542334
16006	NC_017328	GGT	2	6	783657	783662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542334
16007	NC_017328	GGC	2	6	783738	783743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542334
16008	NC_017328	GCG	2	6	783830	783835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542334
16009	NC_017328	GTTGAT	2	12	783900	783911	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384542334
16010	NC_017328	T	6	6	783957	783962	0 %	100 %	0 %	0 %	384542334
16011	NC_017328	TCA	2	6	784064	784069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542334
16012	NC_017328	TCA	2	6	784139	784144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542334
16013	NC_017328	TCG	2	6	784171	784176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542334
16014	NC_017328	CGCC	2	8	784211	784218	0 %	0 %	25 %	75 %	384542334
16015	NC_017328	ACGCCG	2	12	784264	784275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384542334
16016	NC_017328	AGC	2	6	784285	784290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542334
16017	NC_017328	CCA	2	6	784307	784312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542334
16018	NC_017328	CAGGC	2	10	784318	784327	20 %	0 %	40 %	40 %	384542334
16019	NC_017328	CAG	2	6	784401	784406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542334
16020	NC_017328	GC	3	6	784538	784543	0 %	0 %	50 %	50 %	384542334
16021	NC_017328	CGT	2	6	784544	784549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542334
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16023	NC_017328	GCG	2	6	784694	784699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542334
16024	NC_017328	CGG	2	6	784703	784708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542334
16025	NC_017328	CAT	2	6	784760	784765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542334
16026	NC_017328	CAT	2	6	784821	784826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_017328	CAC	2	6	784837	784842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16028	NC_017328	CAG	2	6	784908	784913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_017328	CGAAA	2	10	784918	784927	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16030	NC_017328	AGC	2	6	784974	784979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_017328	TCA	2	6	785016	785021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_017328	GC	3	6	785028	785033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16033	NC_017328	CG	4	8	785105	785112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16034	NC_017328	TGCGCC	2	12	785181	785192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16035	NC_017328	GGCT	2	8	785200	785207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16036	NC_017328	TGCCTG	2	12	785282	785293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_017328	CG	3	6	785296	785301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_017328	GGC	2	6	785393	785398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_017328	GCG	2	6	785418	785423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_017328	TTC	2	6	785435	785440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_017328	C	6	6	785603	785608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16042	NC_017328	GGC	2	6	785674	785679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_017328	ACC	2	6	785686	785691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_017328	CGG	2	6	785710	785715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_017328	T	6	6	785750	785755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_017328	TTC	2	6	785839	785844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542335
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16049	NC_017328	GA	3	6	786048	786053	50 %	0 %	50 %	0 %	384542335
16050	NC_017328	GCT	2	6	786054	786059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542335
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16052	NC_017328	CGGA	2	8	786205	786212	25 %	0 %	50 %	25 %	384542335
16053	NC_017328	TCT	2	6	786263	786268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542335
16054	NC_017328	AGT	2	6	786279	786284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542335
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16057	NC_017328	GCA	2	6	786374	786379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542335
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16059	NC_017328	ATT	2	6	786424	786429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542335
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16061	NC_017328	AGT	2	6	786654	786659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_017328	GC	3	6	786699	786704	0 %	0 %	50 %	50 %	384542336
16063	NC_017328	ACCC	2	8	786729	786736	25 %	0 %	0 %	75 %	384542336
16064	NC_017328	CAG	3	9	786742	786750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542336
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16069	NC_017328	TTCG	2	8	786971	786978	0 %	50 %	25 %	25 %	384542336
16070	NC_017328	TGG	2	6	786980	786985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542336
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16089	NC_017328	A	6	6	787753	787758	100 %	0 %	0 %	0 %	384542336
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16092	NC_017328	TGA	2	6	787856	787861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542336
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16095	NC_017328	CAA	2	6	787980	787985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_017328	A	6	6	788014	788019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_017328	TTACCA	2	12	788119	788130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542337
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16109	NC_017328	GGC	2	6	788796	788801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542338
16110	NC_017328	A	6	6	788883	788888	100 %	0 %	0 %	0 %	384542338
16111	NC_017328	TGG	2	6	788892	788897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542338
16112	NC_017328	GCT	2	6	788950	788955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542338
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16117	NC_017328	CGT	2	6	789209	789214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542338
16118	NC_017328	TAC	2	6	789254	789259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542338
16119	NC_017328	T	6	6	789275	789280	0 %	100 %	0 %	0 %	384542338
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16121	NC_017328	GTG	3	9	789311	789319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542338
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16123	NC_017328	CTG	3	9	789383	789391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542338
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16233	NC_017328	TTG	2	6	794903	794908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16234	NC_017328	ATC	2	6	795097	795102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16238	NC_017328	GTT	2	6	795487	795492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16239	NC_017328	GCC	2	6	795493	795498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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