MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017328	GCAGCC	2	12	759225	759236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384542310
15502	NC_017328	GCA	2	6	759273	759278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542310
15503	NC_017328	TGC	2	6	759302	759307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542310
15504	NC_017328	GCA	3	9	759351	759359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542310
15505	NC_017328	CCTGG	2	10	759539	759548	0 %	20 %	40 %	40 %	384542310
15506	NC_017328	CAT	3	9	759596	759604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542310
15507	NC_017328	AC	3	6	759610	759615	50 %	0 %	0 %	50 %	384542310
15508	NC_017328	ACA	2	6	759663	759668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542310
15509	NC_017328	CGCTAC	2	12	759732	759743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384542310
15510	NC_017328	GACT	2	8	759757	759764	25 %	25 %	25 %	25 %	384542310
15511	NC_017328	AAAT	2	8	759771	759778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_017328	AGA	2	6	759787	759792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_017328	TAT	2	6	759793	759798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_017328	ATT	2	6	759860	759865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_017328	TCA	2	6	759900	759905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_017328	TA	3	6	759986	759991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_017328	CATT	2	8	760028	760035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15518	NC_017328	A	7	7	760140	760146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_017328	T	8	8	760192	760199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_017328	GAC	2	6	760200	760205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_017328	TGA	2	6	760238	760243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_017328	AG	3	6	760344	760349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_017328	AGG	2	6	760387	760392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_017328	GGT	2	6	760466	760471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_017328	CAG	2	6	760530	760535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_017328	GAA	2	6	760560	760565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_017328	GGC	2	6	760568	760573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_017328	GAT	2	6	760656	760661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_017328	AGA	2	6	760722	760727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_017328	GCC	2	6	760762	760767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15531	NC_017328	GGGC	2	8	760820	760827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15532	NC_017328	AGTC	2	8	760842	760849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15533	NC_017328	GTCA	2	8	760928	760935	25 %	25 %	25 %	25 %	384542311
15534	NC_017328	CTG	2	6	760949	760954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542311
15535	NC_017328	TCCGCA	2	12	760992	761003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384542311
15536	NC_017328	ATTC	2	8	761164	761171	25 %	50 %	0 %	25 %	384542311
15537	NC_017328	TCC	2	6	761361	761366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542311
15538	NC_017328	AGG	2	6	761454	761459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542311
15539	NC_017328	CAG	2	6	761518	761523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542311
15540	NC_017328	CTG	2	6	761537	761542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542311
15541	NC_017328	TTGT	2	8	761711	761718	0 %	75 %	25 %	0 %	384542311
15542	NC_017328	TGT	2	6	761772	761777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542311
15543	NC_017328	AT	3	6	761949	761954	50 %	50 %	0 %	0 %	384542311
15544	NC_017328	GTT	2	6	762119	762124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542311
15545	NC_017328	GGAG	2	8	762333	762340	25 %	0 %	75 %	0 %	384542311
15546	NC_017328	AG	3	6	762348	762353	50 %	0 %	50 %	0 %	384542311
15547	NC_017328	GA	3	6	762407	762412	50 %	0 %	50 %	0 %	384542311
15548	NC_017328	GGCT	2	8	762440	762447	0 %	25 %	50 %	25 %	384542311
15549	NC_017328	TCT	2	6	762495	762500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542311
15550	NC_017328	GCA	2	6	762504	762509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542311
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15552	NC_017328	A	6	6	762609	762614	100 %	0 %	0 %	0 %	384542311
15553	NC_017328	TAT	2	6	762639	762644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_017328	TA	3	6	762659	762664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_017328	AT	3	6	762668	762673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_017328	A	7	7	762700	762706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_017328	GAA	2	6	762732	762737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_017328	TGGC	2	8	762750	762757	0 %	25 %	50 %	25 %	384542312
15559	NC_017328	CTGA	2	8	762792	762799	25 %	25 %	25 %	25 %	384542312
15560	NC_017328	A	6	6	762804	762809	100 %	0 %	0 %	0 %	384542312
15561	NC_017328	TCA	2	6	762832	762837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542312
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15565	NC_017328	A	6	6	762928	762933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_017328	A	6	6	762949	762954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_017328	TGT	2	6	763025	763030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_017328	TAT	2	6	763040	763045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15570	NC_017328	TAT	2	6	763070	763075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_017328	T	6	6	763117	763122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_017328	GTT	2	6	763163	763168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_017328	AG	3	6	763254	763259	50 %	0 %	50 %	0 %	384542313
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15583	NC_017328	A	7	7	763763	763769	100 %	0 %	0 %	0 %	384542314
15584	NC_017328	CG	3	6	763785	763790	0 %	0 %	50 %	50 %	384542314
15585	NC_017328	AAT	2	6	763830	763835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542314
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15589	NC_017328	CTG	3	9	764040	764048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542314
15590	NC_017328	TGC	2	6	764085	764090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542314
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15593	NC_017328	GCC	2	6	764208	764213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
15594	NC_017328	TCG	2	6	764308	764313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542314
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15597	NC_017328	CCAT	2	8	764494	764501	25 %	25 %	0 %	50 %	384542314
15598	NC_017328	GCGGG	2	10	764510	764519	0 %	0 %	80 %	20 %	384542314
15599	NC_017328	GC	3	6	764643	764648	0 %	0 %	50 %	50 %	384542314
15600	NC_017328	GCG	2	6	764744	764749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542314
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15603	NC_017328	CGC	2	6	764844	764849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
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15608	NC_017328	A	6	6	765106	765111	100 %	0 %	0 %	0 %	384542314
15609	NC_017328	ATT	2	6	765172	765177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542315
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15612	NC_017328	GC	3	6	765383	765388	0 %	0 %	50 %	50 %	384542315
15613	NC_017328	AAAGCG	2	12	765389	765400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384542315
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15624	NC_017328	GAA	2	6	766019	766024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542315
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15987	NC_017328	CGC	2	6	782510	782515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542333
15988	NC_017328	TCC	2	6	782574	782579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542333
15989	NC_017328	CGGTG	2	10	782675	782684	0 %	20 %	60 %	20 %	384542333
15990	NC_017328	GC	3	6	782691	782696	0 %	0 %	50 %	50 %	384542333
15991	NC_017328	ACC	2	6	782727	782732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542333
15992	NC_017328	TGG	2	6	782791	782796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542333
15993	NC_017328	CAG	2	6	782921	782926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542333
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15995	NC_017328	TGG	2	6	783092	783097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542334
15996	NC_017328	GTGG	2	8	783216	783223	0 %	25 %	75 %	0 %	384542334
15997	NC_017328	CGG	2	6	783280	783285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542334
15998	NC_017328	TCG	2	6	783313	783318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542334
15999	NC_017328	GCCAGC	2	12	783355	783366	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384542334
16000	NC_017328	T	6	6	783449	783454	0 %	100 %	0 %	0 %	384542334

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