MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017328	TCA	2	6	684404	684409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542230
14002	NC_017328	CGT	2	6	684550	684555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542230
14003	NC_017328	CG	3	6	684857	684862	0 %	0 %	50 %	50 %	384542231
14004	NC_017328	CT	3	6	684877	684882	0 %	50 %	0 %	50 %	384542231
14005	NC_017328	GTT	2	6	684897	684902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542231
14006	NC_017328	CT	3	6	685013	685018	0 %	50 %	0 %	50 %	384542231
14007	NC_017328	CCA	2	6	685024	685029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542231
14008	NC_017328	CAT	2	6	685106	685111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542231
14009	NC_017328	ATC	2	6	685140	685145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542231
14010	NC_017328	ATT	2	6	685149	685154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542231
14011	NC_017328	GAT	2	6	685165	685170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542231
14012	NC_017328	GA	3	6	685171	685176	50 %	0 %	50 %	0 %	384542231
14013	NC_017328	AGA	2	6	685270	685275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542231
14014	NC_017328	TTC	2	6	685281	685286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542231
14015	NC_017328	T	6	6	685295	685300	0 %	100 %	0 %	0 %	384542231
14016	NC_017328	AAT	2	6	685301	685306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_017328	ACT	2	6	685326	685331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_017328	T	6	6	685331	685336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_017328	ATT	2	6	685337	685342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_017328	CA	3	6	685392	685397	50 %	0 %	0 %	50 %	384542232
14021	NC_017328	A	6	6	685403	685408	100 %	0 %	0 %	0 %	384542232
14022	NC_017328	TA	3	6	685415	685420	50 %	50 %	0 %	0 %	384542232
14023	NC_017328	GCA	2	6	685439	685444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542232
14024	NC_017328	ATT	2	6	685512	685517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542232
14025	NC_017328	CAG	2	6	685677	685682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542232
14026	NC_017328	CG	3	6	685695	685700	0 %	0 %	50 %	50 %	384542232
14027	NC_017328	AGC	2	6	685783	685788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542232
14028	NC_017328	ATGCTC	2	12	685800	685811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384542232
14029	NC_017328	GCC	2	6	685892	685897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542232
14030	NC_017328	ACA	2	6	685900	685905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542232
14031	NC_017328	TGA	2	6	686026	686031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542233
14032	NC_017328	CAGCC	2	10	686040	686049	20 %	0 %	20 %	60 %	384542233
14033	NC_017328	CAT	2	6	686053	686058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542233
14034	NC_017328	CGGCTC	2	12	686081	686092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384542233
14035	NC_017328	CGC	2	6	686117	686122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542233
14036	NC_017328	TAA	2	6	686129	686134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542233
14037	NC_017328	CGA	2	6	686136	686141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542233
14038	NC_017328	TAAT	2	8	686143	686150	50 %	50 %	0 %	0 %	384542233
14039	NC_017328	TCT	2	6	686169	686174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542233
14040	NC_017328	GGC	2	6	686182	686187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542233
14041	NC_017328	TTC	2	6	686207	686212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542233
14042	NC_017328	TGGC	2	8	686220	686227	0 %	25 %	50 %	25 %	384542233
14043	NC_017328	GTGA	2	8	686286	686293	25 %	25 %	50 %	0 %	384542233
14044	NC_017328	AG	3	6	686351	686356	50 %	0 %	50 %	0 %	384542233
14045	NC_017328	ATC	3	9	686463	686471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542233
14046	NC_017328	TAA	2	6	686484	686489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542233
14047	NC_017328	AGT	2	6	686557	686562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542233
14048	NC_017328	CAG	2	6	686576	686581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542233
14049	NC_017328	ATA	2	6	686621	686626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542233
14050	NC_017328	GGC	2	6	686698	686703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542233
14051	NC_017328	CAT	2	6	686743	686748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542233
14052	NC_017328	TTC	3	9	686933	686941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542233
14053	NC_017328	TCC	2	6	686961	686966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542233
14054	NC_017328	ACC	2	6	686971	686976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542233
14055	NC_017328	TAA	2	6	686990	686995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542233
14056	NC_017328	CAC	2	6	686996	687001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542233
14057	NC_017328	TCA	2	6	687060	687065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542233
14058	NC_017328	AAT	2	6	687082	687087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542233
14059	NC_017328	TGAA	2	8	687096	687103	50 %	25 %	25 %	0 %	384542233
14060	NC_017328	CG	3	6	687152	687157	0 %	0 %	50 %	50 %	384542233
14061	NC_017328	TTC	2	6	687194	687199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542233
14062	NC_017328	CCT	2	6	687244	687249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542233
14063	NC_017328	GTT	2	6	687265	687270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542233
14064	NC_017328	GCG	2	6	687326	687331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542233
14065	NC_017328	ATA	2	6	687333	687338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542233
14066	NC_017328	CAT	2	6	687468	687473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542234
14067	NC_017328	AAT	2	6	687482	687487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542234
14068	NC_017328	TCG	2	6	687512	687517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542234
14069	NC_017328	TAA	2	6	687544	687549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542234
14070	NC_017328	GAT	2	6	687555	687560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542234
14071	NC_017328	GCC	2	6	687615	687620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542234
14072	NC_017328	TAA	2	6	687629	687634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542234
14073	NC_017328	TCT	2	6	687677	687682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542234
14074	NC_017328	TTA	2	6	687695	687700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542234
14075	NC_017328	A	6	6	687719	687724	100 %	0 %	0 %	0 %	384542234
14076	NC_017328	TCC	2	6	687754	687759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542234
14077	NC_017328	CAC	2	6	687762	687767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542234
14078	NC_017328	GCA	2	6	687930	687935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542234
14079	NC_017328	TCA	2	6	687938	687943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542234
14080	NC_017328	TCA	2	6	687947	687952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542234
14081	NC_017328	GAA	2	6	687965	687970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542234
14082	NC_017328	A	6	6	687976	687981	100 %	0 %	0 %	0 %	384542234
14083	NC_017328	CATT	2	8	688028	688035	25 %	50 %	0 %	25 %	384542234
14084	NC_017328	T	6	6	688071	688076	0 %	100 %	0 %	0 %	384542234
14085	NC_017328	CATT	2	8	688109	688116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14086	NC_017328	AATG	2	8	688118	688125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_017328	TTAT	2	8	688148	688155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_017328	ATA	2	6	688172	688177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_017328	ATATA	2	10	688218	688227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_017328	AATGAT	2	12	688249	688260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384542235
14091	NC_017328	TGC	2	6	688274	688279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542235
14092	NC_017328	AT	3	6	688339	688344	50 %	50 %	0 %	0 %	384542235
14093	NC_017328	TAT	2	6	688355	688360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542235
14094	NC_017328	GAC	2	6	688388	688393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542235
14095	NC_017328	TCT	2	6	688512	688517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542235
14096	NC_017328	A	6	6	688523	688528	100 %	0 %	0 %	0 %	384542235
14097	NC_017328	AAG	2	6	688605	688610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542235
14098	NC_017328	TGGA	2	8	688669	688676	25 %	25 %	50 %	0 %	384542235
14099	NC_017328	ACAA	2	8	688731	688738	75 %	0 %	0 %	25 %	384542235
14100	NC_017328	CGC	2	6	688825	688830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542235
14101	NC_017328	CAG	2	6	688853	688858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542235
14102	NC_017328	AAGC	2	8	688928	688935	50 %	0 %	25 %	25 %	384542235
14103	NC_017328	GAAG	2	8	689123	689130	50 %	0 %	50 %	0 %	384542235
14104	NC_017328	GTCA	2	8	689195	689202	25 %	25 %	25 %	25 %	384542235
14105	NC_017328	GT	3	6	689371	689376	0 %	50 %	50 %	0 %	384542236
14106	NC_017328	ATG	2	6	689453	689458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542236
14107	NC_017328	CTTT	2	8	689532	689539	0 %	75 %	0 %	25 %	384542236
14108	NC_017328	TTC	2	6	689567	689572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542236
14109	NC_017328	CT	3	6	689580	689585	0 %	50 %	0 %	50 %	384542236
14110	NC_017328	TTA	2	6	689671	689676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542236
14111	NC_017328	CG	3	6	689683	689688	0 %	0 %	50 %	50 %	384542236
14112	NC_017328	CCA	2	6	689695	689700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542236
14113	NC_017328	CGTT	2	8	689733	689740	0 %	50 %	25 %	25 %	384542236
14114	NC_017328	TAA	2	6	689816	689821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_017328	TTGCT	2	10	689839	689848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14116	NC_017328	AAT	2	6	689882	689887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_017328	CAT	2	6	689893	689898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_017328	GCTAT	2	10	689944	689953	20 %	40 %	20 %	20 %	384542237
14119	NC_017328	ACC	2	6	689967	689972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542237
14120	NC_017328	ACGT	2	8	690174	690181	25 %	25 %	25 %	25 %	384542237
14121	NC_017328	CTGC	2	8	690269	690276	0 %	25 %	25 %	50 %	384542237
14122	NC_017328	GCG	2	6	690284	690289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542237
14123	NC_017328	ACA	2	6	690297	690302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542237
14124	NC_017328	ACA	2	6	690327	690332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542237
14125	NC_017328	TAC	2	6	690413	690418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542237
14126	NC_017328	TTC	2	6	690434	690439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542237
14127	NC_017328	A	6	6	690452	690457	100 %	0 %	0 %	0 %	384542237
14128	NC_017328	TA	3	6	690465	690470	50 %	50 %	0 %	0 %	384542237
14129	NC_017328	CGAA	2	8	690519	690526	50 %	0 %	25 %	25 %	384542237
14130	NC_017328	GCT	3	9	690540	690548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542237
14131	NC_017328	GCT	2	6	690622	690627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542237
14132	NC_017328	ACA	2	6	690738	690743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542237
14133	NC_017328	CCCG	2	8	690762	690769	0 %	0 %	25 %	75 %	384542237
14134	NC_017328	TACC	2	8	690787	690794	25 %	25 %	0 %	50 %	384542237
14135	NC_017328	GCG	2	6	690830	690835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542237
14136	NC_017328	AAT	2	6	690839	690844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542237
14137	NC_017328	GGC	2	6	690853	690858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542237
14138	NC_017328	CGA	2	6	690906	690911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542237
14139	NC_017328	A	6	6	690917	690922	100 %	0 %	0 %	0 %	384542237
14140	NC_017328	GAA	2	6	690965	690970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542237
14141	NC_017328	GCA	2	6	690983	690988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542237
14142	NC_017328	GGC	2	6	691102	691107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542237
14143	NC_017328	CTGA	2	8	691142	691149	25 %	25 %	25 %	25 %	384542237
14144	NC_017328	ACTG	2	8	691225	691232	25 %	25 %	25 %	25 %	384542237
14145	NC_017328	GC	3	6	691305	691310	0 %	0 %	50 %	50 %	384542237
14146	NC_017328	GAC	2	6	691358	691363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542237
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14148	NC_017328	GC	3	6	691520	691525	0 %	0 %	50 %	50 %	384542237
14149	NC_017328	AAG	2	6	691545	691550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542237
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14152	NC_017328	CTT	2	6	691645	691650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542237
14153	NC_017328	CTA	2	6	691741	691746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542237
14154	NC_017328	GAA	2	6	691888	691893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542237
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14157	NC_017328	CTGA	2	8	692099	692106	25 %	25 %	25 %	25 %	384542237
14158	NC_017328	GAT	2	6	692159	692164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542237
14159	NC_017328	CGT	2	6	692171	692176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542237
14160	NC_017328	GCG	2	6	692198	692203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542237
14161	NC_017328	TGA	2	6	692214	692219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542237
14162	NC_017328	ACCG	2	8	692236	692243	25 %	0 %	25 %	50 %	384542237
14163	NC_017328	AGGCGA	2	12	692350	692361	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384542237
14164	NC_017328	TGG	2	6	692403	692408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542237
14165	NC_017328	GTG	2	6	692426	692431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542237
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14168	NC_017328	GGA	2	6	692608	692613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14169	NC_017328	TGT	2	6	692636	692641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542238
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14172	NC_017328	TTCC	2	8	692702	692709	0 %	50 %	0 %	50 %	384542238
14173	NC_017328	GTGCG	2	10	692762	692771	0 %	20 %	60 %	20 %	384542238
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14201	NC_017328	TTC	2	6	693892	693897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542239
14202	NC_017328	TTG	2	6	693933	693938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542239
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14212	NC_017328	TCC	2	6	694356	694361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542240
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14217	NC_017328	TACGAA	2	12	694582	694593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384542240
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14220	NC_017328	ATG	2	6	694893	694898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542241
14221	NC_017328	GAT	2	6	695022	695027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542241
14222	NC_017328	CG	3	6	695078	695083	0 %	0 %	50 %	50 %	384542241
14223	NC_017328	ATC	2	6	695118	695123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542241
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14225	NC_017328	CAT	2	6	695166	695171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542241
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14229	NC_017328	TGCC	2	8	695383	695390	0 %	25 %	25 %	50 %	384542241
14230	NC_017328	T	7	7	695516	695522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14231	NC_017328	GCG	2	6	695641	695646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14232	NC_017328	GAT	2	6	695655	695660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_017328	TGA	2	6	695808	695813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542242
14234	NC_017328	CAT	2	6	695829	695834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542242
14235	NC_017328	ATC	2	6	695878	695883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542242
14236	NC_017328	AG	3	6	696042	696047	50 %	0 %	50 %	0 %	384542242
14237	NC_017328	CGT	2	6	696160	696165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542243
14238	NC_017328	CCGG	2	8	696202	696209	0 %	0 %	50 %	50 %	384542243
14239	NC_017328	GGC	2	6	696270	696275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542243
14240	NC_017328	CGC	2	6	696329	696334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542243
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14242	NC_017328	GCG	2	6	696427	696432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542243
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14359	NC_017328	TGGTT	2	10	702040	702049	0 %	60 %	40 %	0 %	384542247
14360	NC_017328	A	7	7	702103	702109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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