MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017328	TGTT	2	8	660726	660733	0 %	75 %	25 %	0 %	384542214
13502	NC_017328	ATCGT	2	10	660771	660780	20 %	40 %	20 %	20 %	384542214
13503	NC_017328	GCA	2	6	660864	660869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13504	NC_017328	GTTG	2	8	660875	660882	0 %	50 %	50 %	0 %	384542214
13505	NC_017328	CTT	2	6	660898	660903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542214
13506	NC_017328	CTT	2	6	660919	660924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542214
13507	NC_017328	TCT	2	6	660939	660944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542214
13508	NC_017328	GAA	2	6	661016	661021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542214
13509	NC_017328	CAG	2	6	661037	661042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13510	NC_017328	CTGG	2	8	661055	661062	0 %	25 %	50 %	25 %	384542214
13511	NC_017328	GGCA	2	8	661064	661071	25 %	0 %	50 %	25 %	384542214
13512	NC_017328	AGAGAA	2	12	661106	661117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542214
13513	NC_017328	CAG	2	6	661133	661138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13514	NC_017328	CAG	2	6	661166	661171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13515	NC_017328	AGG	2	6	661179	661184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542214
13516	NC_017328	CAG	2	6	661187	661192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13517	NC_017328	AGC	2	6	661266	661271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13518	NC_017328	GAC	2	6	661288	661293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13519	NC_017328	TGC	2	6	661304	661309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13520	NC_017328	CAT	2	6	661346	661351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542214
13521	NC_017328	GAA	2	6	661358	661363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542214
13522	NC_017328	CGC	2	6	661436	661441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542214
13523	NC_017328	CAG	2	6	661508	661513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13524	NC_017328	TGA	2	6	661519	661524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542214
13525	NC_017328	GC	3	6	661546	661551	0 %	0 %	50 %	50 %	384542214
13526	NC_017328	CGC	2	6	661570	661575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542214
13527	NC_017328	CGG	2	6	661598	661603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542214
13528	NC_017328	GCC	2	6	661623	661628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542214
13529	NC_017328	CAGA	2	8	661634	661641	50 %	0 %	25 %	25 %	384542214
13530	NC_017328	GCC	2	6	661673	661678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542214
13531	NC_017328	GAA	2	6	661679	661684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542214
13532	NC_017328	CCA	2	6	661734	661739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542214
13533	NC_017328	GCC	2	6	661842	661847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542214
13534	NC_017328	CCGC	2	8	661923	661930	0 %	0 %	25 %	75 %	384542214
13535	NC_017328	GCA	2	6	661975	661980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13536	NC_017328	GCC	2	6	661986	661991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542214
13537	NC_017328	GCA	2	6	661996	662001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542214
13538	NC_017328	A	6	6	662040	662045	100 %	0 %	0 %	0 %	384542214
13539	NC_017328	TATTTT	2	12	662103	662114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_017328	ATC	2	6	662157	662162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_017328	GT	3	6	662172	662177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_017328	TCGCA	2	10	662189	662198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13543	NC_017328	ATC	2	6	662243	662248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_017328	A	6	6	662292	662297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_017328	AAT	2	6	662388	662393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542215
13546	NC_017328	GCT	2	6	662437	662442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542215
13547	NC_017328	GGC	2	6	662515	662520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542215
13548	NC_017328	ACC	2	6	662530	662535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542215
13549	NC_017328	CTA	2	6	662643	662648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542215
13550	NC_017328	TTC	2	6	662668	662673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542215
13551	NC_017328	CAG	2	6	662690	662695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542215
13552	NC_017328	GCC	2	6	662744	662749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542215
13553	NC_017328	GAA	2	6	662755	662760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542215
13554	NC_017328	A	6	6	662759	662764	100 %	0 %	0 %	0 %	384542215
13555	NC_017328	ACG	2	6	662810	662815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542215
13556	NC_017328	TCT	2	6	662842	662847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542215
13557	NC_017328	TCGCG	2	10	662889	662898	0 %	20 %	40 %	40 %	384542215
13558	NC_017328	CTG	2	6	662968	662973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542215
13559	NC_017328	GAA	2	6	662980	662985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542215
13560	NC_017328	TGA	2	6	662987	662992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542215
13561	NC_017328	GCC	2	6	663031	663036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542215
13562	NC_017328	CCA	2	6	663119	663124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542215
13563	NC_017328	CCCTG	2	10	663200	663209	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13564	NC_017328	T	6	6	663230	663235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_017328	G	6	6	663242	663247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_017328	TGA	2	6	663299	663304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542216
13567	NC_017328	GTT	2	6	663312	663317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542216
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13571	NC_017328	GCG	3	9	663439	663447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542216
13572	NC_017328	ACTA	2	8	663528	663535	50 %	25 %	0 %	25 %	384542216
13573	NC_017328	CAC	2	6	663551	663556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542216
13574	NC_017328	TGA	2	6	663568	663573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542216
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13576	NC_017328	TG	3	6	663727	663732	0 %	50 %	50 %	0 %	384542216
13577	NC_017328	TCA	2	6	663790	663795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542216
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13579	NC_017328	CG	3	6	663873	663878	0 %	0 %	50 %	50 %	384542216
13580	NC_017328	GGCG	2	8	663944	663951	0 %	0 %	75 %	25 %	384542216
13581	NC_017328	CGA	2	6	663959	663964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542216
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13586	NC_017328	GCGT	2	8	664198	664205	0 %	25 %	50 %	25 %	384542216
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13588	NC_017328	CGC	2	6	664307	664312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542216
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13590	NC_017328	AAG	2	6	664596	664601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542217
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13593	NC_017328	GTC	2	6	664689	664694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542217
13594	NC_017328	CCA	2	6	664701	664706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542217
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13601	NC_017328	CTGGCG	2	12	665003	665014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384542217
13602	NC_017328	ACT	2	6	665019	665024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542217
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13604	NC_017328	AAC	2	6	665232	665237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542217
13605	NC_017328	GAC	2	6	665285	665290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542217
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13607	NC_017328	A	6	6	665415	665420	100 %	0 %	0 %	0 %	384542217
13608	NC_017328	TGC	2	6	665457	665462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542217
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13610	NC_017328	TTG	2	6	665652	665657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_017328	CCG	2	6	665900	665905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13612	NC_017328	TGG	2	6	665942	665947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_017328	TTG	2	6	666020	666025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_017328	AGC	2	6	666063	666068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_017328	TCG	2	6	666074	666079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_017328	CCA	2	6	666101	666106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13617	NC_017328	TG	3	6	666152	666157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_017328	AGCCC	2	10	666203	666212	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13619	NC_017328	ATC	2	6	666217	666222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13621	NC_017328	GAA	2	6	666256	666261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13989	NC_017328	CAA	3	9	683719	683727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542230
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