MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017328	CAT	2	6	637796	637801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542198
13002	NC_017328	GCA	2	6	637821	637826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542198
13003	NC_017328	AACAT	2	10	637834	637843	60 %	20 %	0 %	20 %	384542198
13004	NC_017328	AATT	2	8	637867	637874	50 %	50 %	0 %	0 %	384542198
13005	NC_017328	AT	3	6	637882	637887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_017328	TA	3	6	637896	637901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_017328	CT	3	6	637905	637910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_017328	TAA	2	6	637942	637947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_017328	ATTT	2	8	637959	637966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_017328	GT	3	6	638028	638033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_017328	TGA	2	6	638064	638069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_017328	TGA	2	6	638155	638160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017328	AAT	2	6	638165	638170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017328	GGCT	2	8	638247	638254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13015	NC_017328	GC	3	6	638258	638263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_017328	ATCC	2	8	638303	638310	25 %	25 %	0 %	50 %	384542199
13017	NC_017328	TGA	2	6	638538	638543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_017328	TAC	2	6	638570	638575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_017328	TTTA	2	8	638608	638615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_017328	AATTA	2	10	638628	638637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017328	T	7	7	638697	638703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_017328	TTA	2	6	638828	638833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_017328	T	6	6	639109	639114	0 %	100 %	0 %	0 %	384542200
13024	NC_017328	CAG	2	6	639151	639156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542200
13025	NC_017328	CCG	2	6	639191	639196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542200
13026	NC_017328	CTTT	2	8	639288	639295	0 %	75 %	0 %	25 %	384542200
13027	NC_017328	GCC	2	6	639298	639303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542200
13028	NC_017328	GTT	2	6	639423	639428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542200
13029	NC_017328	T	6	6	639439	639444	0 %	100 %	0 %	0 %	384542200
13030	NC_017328	CAA	2	6	639448	639453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542200
13031	NC_017328	GCA	2	6	639459	639464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542200
13032	NC_017328	CGG	2	6	639570	639575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542200
13033	NC_017328	CTT	2	6	639579	639584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542200
13034	NC_017328	TCG	2	6	639595	639600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542200
13035	NC_017328	TCT	2	6	639653	639658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542200
13036	NC_017328	CGC	2	6	639706	639711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542200
13037	NC_017328	CTG	2	6	639802	639807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542200
13038	NC_017328	CAG	2	6	639822	639827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542200
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13040	NC_017328	CGG	2	6	639896	639901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542200
13041	NC_017328	CGG	2	6	639948	639953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542200
13042	NC_017328	GTG	2	6	639988	639993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542200
13043	NC_017328	CGG	2	6	639996	640001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542200
13044	NC_017328	ATG	2	6	640024	640029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542200
13045	NC_017328	CTG	2	6	640039	640044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542200
13046	NC_017328	TGA	2	6	640064	640069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542200
13047	NC_017328	A	7	7	640096	640102	100 %	0 %	0 %	0 %	384542200
13048	NC_017328	ACTG	2	8	640122	640129	25 %	25 %	25 %	25 %	384542200
13049	NC_017328	GCG	2	6	640171	640176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542200
13050	NC_017328	GAT	2	6	640182	640187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542200
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13052	NC_017328	CGC	2	6	640263	640268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542200
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13054	NC_017328	GTCG	2	8	640348	640355	0 %	25 %	50 %	25 %	384542200
13055	NC_017328	TGTT	2	8	640454	640461	0 %	75 %	25 %	0 %	384542200
13056	NC_017328	CCCTG	2	10	640509	640518	0 %	20 %	20 %	60 %	384542200
13057	NC_017328	TC	3	6	640542	640547	0 %	50 %	0 %	50 %	384542200
13058	NC_017328	TGA	2	6	640549	640554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542200
13059	NC_017328	TGAG	2	8	640558	640565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_017328	AAC	2	6	640584	640589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_017328	AAG	2	6	640629	640634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_017328	A	6	6	640640	640645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_017328	CTG	2	6	640703	640708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_017328	ACC	2	6	640709	640714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_017328	GGCT	2	8	640781	640788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13066	NC_017328	A	7	7	640874	640880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_017328	GCG	2	6	640922	640927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_017328	GGC	2	6	641018	641023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_017328	CGG	2	6	641080	641085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_017328	CGG	2	6	641104	641109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_017328	TTCT	2	8	641118	641125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13072	NC_017328	CTGG	2	8	641128	641135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13073	NC_017328	GAT	2	6	641179	641184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_017328	TGG	2	6	641190	641195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_017328	CTG	2	6	641243	641248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_017328	TGG	2	6	641337	641342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_017328	GCT	2	6	641344	641349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_017328	GTCT	2	8	641351	641358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13079	NC_017328	TGG	2	6	641374	641379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_017328	TGT	2	6	641382	641387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_017328	CCA	2	6	641439	641444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_017328	TGACGT	2	12	641470	641481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13083	NC_017328	A	6	6	641562	641567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_017328	GCTG	2	8	641569	641576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_017328	CGC	2	6	641578	641583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13086	NC_017328	GCTG	2	8	641596	641603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13087	NC_017328	GCGCGA	2	12	641659	641670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_017328	CGC	2	6	641777	641782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13089	NC_017328	CGG	2	6	641797	641802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_017328	GCT	2	6	641860	641865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_017328	GGT	3	9	641866	641874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_017328	TGA	2	6	641975	641980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_017328	GCC	2	6	642004	642009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_017328	GAT	2	6	642034	642039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_017328	GCAG	2	8	642153	642160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13096	NC_017328	GGC	2	6	642192	642197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_017328	TGG	2	6	642215	642220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017328	GGT	2	6	642252	642257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_017328	TGA	2	6	642278	642283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_017328	ACC	2	6	642298	642303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_017328	ATT	2	6	642340	642345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017328	CGG	2	6	642347	642352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_017328	CAT	2	6	642390	642395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_017328	TGGG	2	8	642548	642555	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_017328	CTG	2	6	642556	642561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_017328	GGC	2	6	642684	642689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542201
13107	NC_017328	GCT	2	6	642698	642703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542201
13108	NC_017328	ACC	2	6	642705	642710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542201
13109	NC_017328	TGG	2	6	642723	642728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542201
13110	NC_017328	CAG	2	6	642844	642849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542201
13111	NC_017328	CAGT	2	8	642892	642899	25 %	25 %	25 %	25 %	384542201
13112	NC_017328	GCG	2	6	643035	643040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542201
13113	NC_017328	CAA	2	6	643119	643124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542201
13114	NC_017328	AT	3	6	643136	643141	50 %	50 %	0 %	0 %	384542201
13115	NC_017328	GTC	2	6	643152	643157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542201
13116	NC_017328	TGA	2	6	643193	643198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542201
13117	NC_017328	CCCGAC	2	12	643216	643227	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_017328	CTG	2	6	643231	643236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_017328	GCCGC	2	10	643246	643255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13120	NC_017328	TTC	2	6	643276	643281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_017328	TGGT	2	8	643361	643368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_017328	CCG	2	6	643397	643402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_017328	GCTG	2	8	643416	643423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13124	NC_017328	GGC	2	6	643454	643459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_017328	GCC	2	6	643483	643488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13127	NC_017328	GAA	2	6	643579	643584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13259	NC_017328	CTG	2	6	649313	649318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13260	NC_017328	GAA	2	6	649355	649360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_017328	ATG	2	6	649362	649367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13263	NC_017328	CGT	2	6	649470	649475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542203
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13352	NC_017328	A	7	7	653195	653201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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