MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_017328	GAAA	2	8	588763	588770	75 %	0 %	25 %	0 %	384542155
12003	NC_017328	AGT	2	6	588808	588813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542155
12004	NC_017328	TCT	2	6	588820	588825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542155
12005	NC_017328	GA	3	6	588885	588890	50 %	0 %	50 %	0 %	384542155
12006	NC_017328	CCGC	2	8	588897	588904	0 %	0 %	25 %	75 %	384542155
12007	NC_017328	A	7	7	588941	588947	100 %	0 %	0 %	0 %	384542155
12008	NC_017328	TTA	2	6	588980	588985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_017328	CT	3	6	589045	589050	0 %	50 %	0 %	50 %	384542156
12010	NC_017328	CTTC	2	8	589084	589091	0 %	50 %	0 %	50 %	384542156
12011	NC_017328	TCAT	2	8	589123	589130	25 %	50 %	0 %	25 %	384542156
12012	NC_017328	GC	3	6	589148	589153	0 %	0 %	50 %	50 %	384542156
12013	NC_017328	CTG	2	6	589218	589223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542156
12014	NC_017328	TGA	2	6	589267	589272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542156
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12017	NC_017328	ACCG	2	8	589311	589318	25 %	0 %	25 %	50 %	384542156
12018	NC_017328	GCA	2	6	589369	589374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542156
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12023	NC_017328	GAT	2	6	589538	589543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542156
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12041	NC_017328	T	6	6	590272	590277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_017328	TGG	2	6	590282	590287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_017328	GTG	2	6	590360	590365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12046	NC_017328	CCT	2	6	590394	590399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12050	NC_017328	GGT	2	6	590564	590569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_017328	TGA	2	6	590573	590578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12054	NC_017328	TAC	2	6	590656	590661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12055	NC_017328	AACT	2	8	590662	590669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12058	NC_017328	GTTT	2	8	590871	590878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_017328	CGG	2	6	590894	590899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12064	NC_017328	GT	3	6	591005	591010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_017328	CTG	2	6	591083	591088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542157
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12105	NC_017328	TGC	2	6	592898	592903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542159
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12109	NC_017328	AGTAC	2	10	593281	593290	40 %	20 %	20 %	20 %	384542159
12110	NC_017328	GCC	2	6	593298	593303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542159
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12112	NC_017328	GCT	2	6	593429	593434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542159
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12114	NC_017328	GCC	2	6	593499	593504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542159
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12119	NC_017328	GCT	2	6	593881	593886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542160
12120	NC_017328	ACTT	2	8	594011	594018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12122	NC_017328	ATC	2	6	594177	594182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12367	NC_017328	TGA	2	6	605761	605766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12369	NC_017328	TTC	2	6	605838	605843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12370	NC_017328	GCAA	2	8	605904	605911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12371	NC_017328	GAA	2	6	605927	605932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12372	NC_017328	GTT	2	6	605950	605955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12487	NC_017328	T	6	6	611895	611900	0 %	100 %	0 %	0 %	384542174
12488	NC_017328	CG	3	6	611919	611924	0 %	0 %	50 %	50 %	384542174
12489	NC_017328	TTC	2	6	611958	611963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542174
12490	NC_017328	TGC	2	6	612148	612153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542174
12491	NC_017328	GGC	2	6	612293	612298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542174
12492	NC_017328	CTG	2	6	612357	612362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542174
12493	NC_017328	AAG	2	6	612406	612411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542174
12494	NC_017328	AG	3	6	612450	612455	50 %	0 %	50 %	0 %	384542174
12495	NC_017328	AAG	2	6	612458	612463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542174
12496	NC_017328	T	6	6	612516	612521	0 %	100 %	0 %	0 %	384542175
12497	NC_017328	TAC	2	6	612541	612546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542175
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12499	NC_017328	CGC	2	6	612739	612744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542175
12500	NC_017328	CAA	2	6	612813	612818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542176

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