MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017328	CTGG	2	8	563373	563380	0 %	25 %	50 %	25 %	384542129
11503	NC_017328	CGC	2	6	563415	563420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542129
11504	NC_017328	CAG	2	6	563461	563466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542129
11505	NC_017328	CAC	2	6	563596	563601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542129
11506	NC_017328	TCT	2	6	563615	563620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542129
11507	NC_017328	CAG	2	6	563698	563703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542130
11508	NC_017328	ATG	2	6	563735	563740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542130
11509	NC_017328	GTC	2	6	563769	563774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_017328	GGC	2	6	563827	563832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_017328	ATG	2	6	563848	563853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_017328	ACTG	2	8	563856	563863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_017328	TAA	2	6	563987	563992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542131
11514	NC_017328	ATCA	2	8	564001	564008	50 %	25 %	0 %	25 %	384542131
11515	NC_017328	GGC	2	6	564184	564189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542131
11516	NC_017328	CGG	2	6	564200	564205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542131
11517	NC_017328	CT	3	6	564251	564256	0 %	50 %	0 %	50 %	384542131
11518	NC_017328	CAGG	2	8	564349	564356	25 %	0 %	50 %	25 %	384542131
11519	NC_017328	GCG	2	6	564502	564507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542131
11520	NC_017328	TCA	2	6	564509	564514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542131
11521	NC_017328	GCA	2	6	564524	564529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542131
11522	NC_017328	TTG	2	6	564581	564586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542131
11523	NC_017328	TCGT	2	8	564616	564623	0 %	50 %	25 %	25 %	384542131
11524	NC_017328	AGA	2	6	564733	564738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542131
11525	NC_017328	CATA	2	8	564808	564815	50 %	25 %	0 %	25 %	384542131
11526	NC_017328	CTAT	2	8	564825	564832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11527	NC_017328	A	6	6	564841	564846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_017328	GGCG	2	8	564868	564875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_017328	TGA	2	6	564876	564881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_017328	GCCA	2	8	564929	564936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_017328	AAT	2	6	565023	565028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_017328	CAG	2	6	565086	565091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_017328	GTT	2	6	565100	565105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_017328	GCA	2	6	565151	565156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_017328	CAG	2	6	565422	565427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_017328	CT	3	6	565509	565514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11537	NC_017328	TCA	2	6	565544	565549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_017328	CTT	2	6	565566	565571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_017328	TG	4	8	565575	565582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017328	CAT	2	6	565776	565781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_017328	GCC	2	6	565794	565799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_017328	ACG	2	6	565803	565808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_017328	CG	3	6	565807	565812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_017328	CGG	2	6	565842	565847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_017328	CG	3	6	565885	565890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11546	NC_017328	CAG	2	6	565914	565919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_017328	GCGT	2	8	565955	565962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11548	NC_017328	CGA	2	6	565996	566001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_017328	AAAT	2	8	566033	566040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_017328	GTG	2	6	566062	566067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_017328	CCAG	2	8	566077	566084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_017328	ATGCC	2	10	566262	566271	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11553	NC_017328	GCG	2	6	566273	566278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_017328	CAC	2	6	566319	566324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_017328	AT	3	6	566345	566350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_017328	AAT	2	6	566415	566420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542132
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11558	NC_017328	CAG	2	6	566450	566455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542132
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11562	NC_017328	C	6	6	566592	566597	0 %	0 %	0 %	100 %	384542132
11563	NC_017328	CG	3	6	566605	566610	0 %	0 %	50 %	50 %	384542132
11564	NC_017328	CAG	2	6	566693	566698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542132
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11571	NC_017328	TGC	2	6	566953	566958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542132
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11573	NC_017328	TCAG	2	8	567204	567211	25 %	25 %	25 %	25 %	384542132
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11575	NC_017328	CAG	2	6	567227	567232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542132
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11593	NC_017328	ACC	2	6	568257	568262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542134
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11984	NC_017328	CTGAA	2	10	587962	587971	40 %	20 %	20 %	20 %	384542154
11985	NC_017328	CGT	2	6	587973	587978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542154
11986	NC_017328	CATGTA	2	12	588015	588026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384542154
11987	NC_017328	TGA	2	6	588049	588054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542154
11988	NC_017328	CACGAT	2	12	588081	588092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384542154
11989	NC_017328	TTG	2	6	588096	588101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542154
11990	NC_017328	CAC	2	6	588146	588151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542154
11991	NC_017328	TGAA	2	8	588196	588203	50 %	25 %	25 %	0 %	384542154
11992	NC_017328	CAT	2	6	588222	588227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542154
11993	NC_017328	GC	3	6	588244	588249	0 %	0 %	50 %	50 %	384542155
11994	NC_017328	GAT	2	6	588314	588319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542155
11995	NC_017328	ACG	2	6	588363	588368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542155
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11997	NC_017328	TCA	2	6	588421	588426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542155
11998	NC_017328	GATA	2	8	588440	588447	50 %	25 %	25 %	0 %	384542155
11999	NC_017328	CAT	2	6	588452	588457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542155
12000	NC_017328	TCA	2	6	588583	588588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542155

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