MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017328	CGGTGC	2	12	539822	539833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384542111
11002	NC_017328	GAT	2	6	539841	539846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542111
11003	NC_017328	CGG	2	6	539889	539894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542111
11004	NC_017328	TGTT	2	8	539900	539907	0 %	75 %	25 %	0 %	384542111
11005	NC_017328	A	6	6	539950	539955	100 %	0 %	0 %	0 %	384542111
11006	NC_017328	GC	3	6	539968	539973	0 %	0 %	50 %	50 %	384542111
11007	NC_017328	CTG	2	6	540016	540021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542111
11008	NC_017328	T	6	6	540069	540074	0 %	100 %	0 %	0 %	384542111
11009	NC_017328	GGC	2	6	540102	540107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542111
11010	NC_017328	CGG	2	6	540222	540227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542111
11011	NC_017328	GGC	3	9	540249	540257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542111
11012	NC_017328	TTA	2	6	540266	540271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542111
11013	NC_017328	TTA	2	6	540283	540288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542111
11014	NC_017328	GCCACC	2	12	540303	540314	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384542111
11015	NC_017328	GCT	2	6	540378	540383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542111
11016	NC_017328	GGT	2	6	540385	540390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542111
11017	NC_017328	GCTG	2	8	540432	540439	0 %	25 %	50 %	25 %	384542111
11018	NC_017328	TGC	2	6	540560	540565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542111
11019	NC_017328	GGCT	2	8	540652	540659	0 %	25 %	50 %	25 %	384542111
11020	NC_017328	TGC	2	6	540677	540682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542111
11021	NC_017328	TGC	2	6	540692	540697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542111
11022	NC_017328	GGCGC	2	10	540775	540784	0 %	0 %	60 %	40 %	384542111
11023	NC_017328	GGT	2	6	540790	540795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542111
11024	NC_017328	GAT	2	6	540804	540809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542111
11025	NC_017328	TTG	2	6	540847	540852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542111
11026	NC_017328	GTT	2	6	540864	540869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542111
11027	NC_017328	TGCTGG	2	12	540872	540883	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384542111
11028	NC_017328	CGC	3	9	540908	540916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542111
11029	NC_017328	GTA	2	6	540985	540990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542112
11030	NC_017328	GCAG	2	8	541043	541050	25 %	0 %	50 %	25 %	384542112
11031	NC_017328	CCA	2	6	541151	541156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542112
11032	NC_017328	ATG	2	6	541163	541168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542112
11033	NC_017328	TGGC	2	8	541190	541197	0 %	25 %	50 %	25 %	384542112
11034	NC_017328	GTT	2	6	541236	541241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542112
11035	NC_017328	TG	3	6	541287	541292	0 %	50 %	50 %	0 %	384542112
11036	NC_017328	GCG	2	6	541295	541300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542112
11037	NC_017328	GCG	2	6	541326	541331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542112
11038	NC_017328	ATTTG	2	10	541335	541344	20 %	60 %	20 %	0 %	384542112
11039	NC_017328	CGC	2	6	541351	541356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542112
11040	NC_017328	GTC	2	6	541453	541458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542112
11041	NC_017328	TGA	2	6	541464	541469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542112
11042	NC_017328	TGG	2	6	541485	541490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542112
11043	NC_017328	CAGCGC	2	12	541504	541515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384542112
11044	NC_017328	CCG	2	6	541523	541528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542112
11045	NC_017328	CGC	2	6	541686	541691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542112
11046	NC_017328	CAG	2	6	541717	541722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542112
11047	NC_017328	TGG	2	6	541743	541748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542112
11048	NC_017328	GGCT	2	8	541763	541770	0 %	25 %	50 %	25 %	384542112
11049	NC_017328	CGG	2	6	541818	541823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542112
11050	NC_017328	TTA	2	6	541914	541919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017328	TCA	2	6	542023	542028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_017328	ATT	2	6	542156	542161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017328	GGA	2	6	542181	542186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_017328	CAG	2	6	542218	542223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_017328	ACG	2	6	542281	542286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_017328	CGC	2	6	542361	542366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_017328	TCG	2	6	542446	542451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_017328	GTG	2	6	542539	542544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_017328	CGC	3	9	542595	542603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_017328	CGC	2	6	542615	542620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_017328	GTG	2	6	542632	542637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_017328	GATT	2	8	542645	542652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_017328	CAC	2	6	542658	542663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_017328	CGC	2	6	542667	542672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_017328	GTTA	2	8	542719	542726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_017328	GCTG	2	8	542742	542749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11067	NC_017328	TGG	2	6	542751	542756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_017328	CTG	2	6	542761	542766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_017328	CTG	2	6	542782	542787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_017328	CG	3	6	542835	542840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11071	NC_017328	CTG	2	6	542884	542889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_017328	CATGAA	2	12	542908	542919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11073	NC_017328	AGT	2	6	542959	542964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_017328	CTC	2	6	542979	542984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11075	NC_017328	CTG	2	6	543079	543084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_017328	GGC	2	6	543172	543177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_017328	GTG	2	6	543217	543222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_017328	CGT	2	6	543290	543295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_017328	CATTC	2	10	543381	543390	20 %	40 %	0 %	40 %	384542113
11080	NC_017328	GGC	2	6	543543	543548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11081	NC_017328	GCT	2	6	543651	543656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11082	NC_017328	TGAAC	2	10	543705	543714	40 %	20 %	20 %	20 %	384542113
11083	NC_017328	GCCA	2	8	543721	543728	25 %	0 %	25 %	50 %	384542113
11084	NC_017328	GAT	2	6	543781	543786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542113
11085	NC_017328	TTG	2	6	543800	543805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542113
11086	NC_017328	TTC	2	6	543813	543818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542113
11087	NC_017328	GTG	2	6	543826	543831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542113
11088	NC_017328	CTG	2	6	543914	543919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11089	NC_017328	CGG	2	6	543945	543950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11090	NC_017328	CAC	2	6	543951	543956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542113
11091	NC_017328	TAC	2	6	543997	544002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542113
11092	NC_017328	GCGT	2	8	544004	544011	0 %	25 %	50 %	25 %	384542113
11093	NC_017328	CA	3	6	544035	544040	50 %	0 %	0 %	50 %	384542113
11094	NC_017328	CGG	2	6	544067	544072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11095	NC_017328	TCTT	2	8	544112	544119	0 %	75 %	0 %	25 %	384542113
11096	NC_017328	GGA	2	6	544123	544128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542113
11097	NC_017328	GTT	2	6	544132	544137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542113
11098	NC_017328	GGC	2	6	544140	544145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11099	NC_017328	GCC	2	6	544212	544217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542113
11100	NC_017328	GCTG	2	8	544242	544249	0 %	25 %	50 %	25 %	384542113
11101	NC_017328	CGG	2	6	544296	544301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11102	NC_017328	GCA	2	6	544359	544364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11103	NC_017328	TGA	2	6	544407	544412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542113
11104	NC_017328	TGCCGA	2	12	544476	544487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11105	NC_017328	TGA	2	6	544523	544528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542113
11106	NC_017328	CG	3	6	544529	544534	0 %	0 %	50 %	50 %	384542113
11107	NC_017328	GCA	2	6	544569	544574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11108	NC_017328	GATCT	2	10	544618	544627	20 %	40 %	20 %	20 %	384542113
11109	NC_017328	AGATC	2	10	544671	544680	40 %	20 %	20 %	20 %	384542113
11110	NC_017328	GGC	2	6	544687	544692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11111	NC_017328	CTG	3	9	544723	544731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11112	NC_017328	A	6	6	544790	544795	100 %	0 %	0 %	0 %	384542113
11113	NC_017328	TGG	2	6	544808	544813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542113
11114	NC_017328	GC	3	6	544827	544832	0 %	0 %	50 %	50 %	384542113
11115	NC_017328	CGT	2	6	544843	544848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542113
11116	NC_017328	GT	3	6	544899	544904	0 %	50 %	50 %	0 %	384542113
11117	NC_017328	CGG	2	6	544922	544927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542113
11118	NC_017328	A	6	6	544942	544947	100 %	0 %	0 %	0 %	384542113
11119	NC_017328	TGGC	2	8	544960	544967	0 %	25 %	50 %	25 %	384542113
11120	NC_017328	GA	3	6	544989	544994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_017328	GTT	2	6	545095	545100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542114
11122	NC_017328	GAT	2	6	545152	545157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542114
11123	NC_017328	TGC	2	6	545179	545184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542114
11124	NC_017328	ACT	2	6	545193	545198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542114
11125	NC_017328	TTA	2	6	545221	545226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542114
11126	NC_017328	AGAGC	2	10	545242	545251	40 %	0 %	40 %	20 %	384542114
11127	NC_017328	GGGCC	2	10	545285	545294	0 %	0 %	60 %	40 %	384542114
11128	NC_017328	GGT	2	6	545320	545325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542114
11129	NC_017328	CGA	2	6	545347	545352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542114
11130	NC_017328	AG	3	6	545416	545421	50 %	0 %	50 %	0 %	384542114
11131	NC_017328	ATT	2	6	545438	545443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542114
11132	NC_017328	ACC	2	6	545474	545479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542114
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11134	NC_017328	GCTG	2	8	545530	545537	0 %	25 %	50 %	25 %	384542114
11135	NC_017328	GTG	2	6	545597	545602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542114
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11141	NC_017328	GC	3	6	545756	545761	0 %	0 %	50 %	50 %	384542114
11142	NC_017328	TGG	2	6	545825	545830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542114
11143	NC_017328	AAT	2	6	545853	545858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542114
11144	NC_017328	TTG	2	6	545930	545935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542115
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11146	NC_017328	GCA	2	6	546144	546149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542115
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11148	NC_017328	GCGGG	2	10	546219	546228	0 %	0 %	80 %	20 %	384542115
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11151	NC_017328	GCG	2	6	546301	546306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542115
11152	NC_017328	GCG	2	6	546350	546355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542115
11153	NC_017328	CACCGA	2	12	546384	546395	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384542115
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11161	NC_017328	GAT	2	6	546702	546707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542116
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11166	NC_017328	GCTG	2	8	546785	546792	0 %	25 %	50 %	25 %	384542116
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11172	NC_017328	TGC	2	6	546981	546986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542116
11173	NC_017328	GTTAA	2	10	547082	547091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11174	NC_017328	GTT	2	6	547127	547132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11176	NC_017328	CT	3	6	547236	547241	0 %	50 %	0 %	50 %	384542117
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11210	NC_017328	CTG	2	6	548754	548759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542117
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11220	NC_017328	GC	3	6	549295	549300	0 %	0 %	50 %	50 %	384542117
11221	NC_017328	G	6	6	549317	549322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_017328	CGC	2	6	549441	549446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11223	NC_017328	GGC	2	6	549528	549533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542118
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11226	NC_017328	GAG	2	6	549619	549624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542118
11227	NC_017328	CG	3	6	549645	549650	0 %	0 %	50 %	50 %	384542118
11228	NC_017328	GGC	2	6	549664	549669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542118
11229	NC_017328	GC	4	8	549668	549675	0 %	0 %	50 %	50 %	384542118
11230	NC_017328	TGC	2	6	549676	549681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542118
11231	NC_017328	AATG	2	8	549765	549772	50 %	25 %	25 %	0 %	384542119
11232	NC_017328	ATT	2	6	549823	549828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542119
11233	NC_017328	CAT	2	6	549903	549908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542119
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11235	NC_017328	GCC	3	9	550016	550024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542119
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11239	NC_017328	CCA	2	6	550083	550088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542119
11240	NC_017328	CTG	2	6	550111	550116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542119
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