MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017328	GC	3	6	515418	515423	0 %	0 %	50 %	50 %	384542091
10502	NC_017328	GCGG	2	8	515444	515451	0 %	0 %	75 %	25 %	384542091
10503	NC_017328	AT	3	6	515479	515484	50 %	50 %	0 %	0 %	384542091
10504	NC_017328	GC	3	6	515488	515493	0 %	0 %	50 %	50 %	384542091
10505	NC_017328	CGA	2	6	515515	515520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10506	NC_017328	GGCGAA	2	12	515633	515644	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384542091
10507	NC_017328	GGCG	2	8	515647	515654	0 %	0 %	75 %	25 %	384542091
10508	NC_017328	GTG	2	6	515657	515662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542091
10509	NC_017328	CGC	2	6	515698	515703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542091
10510	NC_017328	AGT	2	6	515732	515737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542091
10511	NC_017328	ACA	2	6	515762	515767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542091
10512	NC_017328	CAGC	2	8	515776	515783	25 %	0 %	25 %	50 %	384542091
10513	NC_017328	TGG	2	6	515838	515843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542091
10514	NC_017328	GC	3	6	515853	515858	0 %	0 %	50 %	50 %	384542091
10515	NC_017328	TGG	2	6	515886	515891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542091
10516	NC_017328	ATT	2	6	515894	515899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542091
10517	NC_017328	GCA	2	6	516058	516063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10518	NC_017328	ATA	2	6	516087	516092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542091
10519	NC_017328	CTG	2	6	516155	516160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10520	NC_017328	GCG	2	6	516260	516265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542091
10521	NC_017328	CTG	2	6	516266	516271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10522	NC_017328	CCG	2	6	516323	516328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542091
10523	NC_017328	ATC	2	6	516369	516374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542091
10524	NC_017328	GCT	2	6	516412	516417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10525	NC_017328	GGC	2	6	516421	516426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542091
10526	NC_017328	TTG	2	6	516503	516508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542091
10527	NC_017328	GCA	2	6	516539	516544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10528	NC_017328	GGC	2	6	516547	516552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542091
10529	NC_017328	TGC	2	6	516558	516563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10530	NC_017328	A	6	6	516564	516569	100 %	0 %	0 %	0 %	384542091
10531	NC_017328	GGC	2	6	516702	516707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542091
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10534	NC_017328	GTT	2	6	517027	517032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542091
10535	NC_017328	GGGCG	2	10	517048	517057	0 %	0 %	80 %	20 %	384542091
10536	NC_017328	AGC	2	6	517173	517178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542091
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10538	NC_017328	CGA	2	6	517254	517259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10539	NC_017328	GGT	2	6	517300	517305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542091
10540	NC_017328	GC	3	6	517393	517398	0 %	0 %	50 %	50 %	384542091
10541	NC_017328	TGA	2	6	517434	517439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542091
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10546	NC_017328	CGC	2	6	517603	517608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542091
10547	NC_017328	GTG	2	6	517619	517624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542091
10548	NC_017328	CGT	2	6	517662	517667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542091
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10550	NC_017328	CTG	2	6	517778	517783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542091
10551	NC_017328	TGA	2	6	517818	517823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542091
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10554	NC_017328	TAT	2	6	517882	517887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542091
10555	NC_017328	CGG	2	6	517890	517895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542091
10556	NC_017328	CGA	2	6	517978	517983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_017328	CAA	2	6	518012	518017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_017328	A	6	6	518016	518021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_017328	AC	3	6	518023	518028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_017328	ATC	2	6	518232	518237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542092
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10563	NC_017328	ACT	2	6	518356	518361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542092
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10574	NC_017328	A	6	6	518755	518760	100 %	0 %	0 %	0 %	384542092
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10579	NC_017328	TGA	2	6	518881	518886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542092
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10585	NC_017328	GCT	2	6	519260	519265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542092
10586	NC_017328	TGC	2	6	519313	519318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542092
10587	NC_017328	GATG	2	8	519329	519336	25 %	25 %	50 %	0 %	384542092
10588	NC_017328	CTG	2	6	519357	519362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542092
10589	NC_017328	T	7	7	519475	519481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_017328	AG	3	6	519506	519511	50 %	0 %	50 %	0 %	384542093
10591	NC_017328	TGA	2	6	519536	519541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542093
10592	NC_017328	AT	3	6	519585	519590	50 %	50 %	0 %	0 %	384542093
10593	NC_017328	CAC	2	6	519619	519624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542093
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10598	NC_017328	GGT	2	6	520054	520059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542093
10599	NC_017328	CCAG	2	8	520107	520114	25 %	0 %	25 %	50 %	384542093
10600	NC_017328	CCA	2	6	520158	520163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542093
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10602	NC_017328	ATC	2	6	520262	520267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542093
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10605	NC_017328	CAT	2	6	520405	520410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542093
10606	NC_017328	GC	3	6	520422	520427	0 %	0 %	50 %	50 %	384542093
10607	NC_017328	ACC	2	6	520601	520606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542093
10608	NC_017328	ATA	2	6	520616	520621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542093
10609	NC_017328	CAC	2	6	520624	520629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542093
10610	NC_017328	CGG	2	6	520632	520637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542093
10611	NC_017328	ATA	2	6	520646	520651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542093
10612	NC_017328	ATC	2	6	520658	520663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542093
10613	NC_017328	GGT	2	6	520672	520677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542093
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10615	NC_017328	ACA	2	6	520746	520751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_017328	ATG	2	6	520759	520764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_017328	AG	3	6	520831	520836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_017328	GGT	2	6	520854	520859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542094
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10620	NC_017328	TGA	2	6	520912	520917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542094
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10740	NC_017328	TTG	2	6	527567	527572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542102
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10744	NC_017328	GTCA	2	8	527830	527837	25 %	25 %	25 %	25 %	384542102
10745	NC_017328	TGT	2	6	527844	527849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542102
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