MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017328	A	6	6	490240	490245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017328	CGG	2	6	490256	490261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_017328	TTC	2	6	490272	490277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_017328	TCT	2	6	490353	490358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542067
10005	NC_017328	TGA	2	6	490513	490518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542067
10006	NC_017328	GTT	2	6	490592	490597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542067
10007	NC_017328	TGG	2	6	490621	490626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542067
10008	NC_017328	CCG	2	6	490653	490658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542067
10009	NC_017328	GTT	2	6	490700	490705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542067
10010	NC_017328	AGT	2	6	490723	490728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542067
10011	NC_017328	TGA	2	6	490774	490779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542067
10012	NC_017328	AT	3	6	490861	490866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_017328	GTG	2	6	490870	490875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_017328	ATC	2	6	490899	490904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_017328	CG	3	6	490923	490928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_017328	TAT	2	6	490940	490945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_017328	CA	3	6	490962	490967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_017328	GT	3	6	491065	491070	0 %	50 %	50 %	0 %	384542068
10019	NC_017328	TTG	2	6	491117	491122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542068
10020	NC_017328	GC	3	6	491137	491142	0 %	0 %	50 %	50 %	384542068
10021	NC_017328	CGA	2	6	491196	491201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542068
10022	NC_017328	ATC	2	6	491206	491211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542068
10023	NC_017328	TGG	2	6	491249	491254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542068
10024	NC_017328	CG	4	8	491321	491328	0 %	0 %	50 %	50 %	384542068
10025	NC_017328	ATT	2	6	491347	491352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542068
10026	NC_017328	AAC	2	6	491363	491368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542068
10027	NC_017328	ACA	2	6	491399	491404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542068
10028	NC_017328	CCGA	2	8	491425	491432	25 %	0 %	25 %	50 %	384542068
10029	NC_017328	GC	4	8	491483	491490	0 %	0 %	50 %	50 %	384542068
10030	NC_017328	TGA	2	6	491502	491507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542068
10031	NC_017328	GTC	2	6	491588	491593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542068
10032	NC_017328	CTGG	2	8	491594	491601	0 %	25 %	50 %	25 %	384542068
10033	NC_017328	AGC	2	6	491630	491635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542068
10034	NC_017328	CGG	3	9	491658	491666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542068
10035	NC_017328	CAC	2	6	491686	491691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542068
10036	NC_017328	ATG	2	6	491723	491728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542068
10037	NC_017328	ACT	2	6	491741	491746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542068
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10040	NC_017328	TAC	2	6	491833	491838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542068
10041	NC_017328	CAGC	2	8	491883	491890	25 %	0 %	25 %	50 %	384542068
10042	NC_017328	GCG	2	6	491926	491931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542068
10043	NC_017328	CTGCG	2	10	491948	491957	0 %	20 %	40 %	40 %	384542068
10044	NC_017328	GC	3	6	492004	492009	0 %	0 %	50 %	50 %	384542068
10045	NC_017328	GAC	2	6	492025	492030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542068
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10047	NC_017328	AGA	2	6	492099	492104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542068
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10050	NC_017328	GCG	2	6	492197	492202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542068
10051	NC_017328	GCAG	2	8	492204	492211	25 %	0 %	50 %	25 %	384542068
10052	NC_017328	GCG	2	6	492283	492288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542068
10053	NC_017328	ACC	2	6	492352	492357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542068
10054	NC_017328	CGT	2	6	492361	492366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542068
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10058	NC_017328	CAGC	2	8	492657	492664	25 %	0 %	25 %	50 %	384542069
10059	NC_017328	CAGCC	2	10	492672	492681	20 %	0 %	20 %	60 %	384542069
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10065	NC_017328	CGG	2	6	492890	492895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542069
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10069	NC_017328	CGA	2	6	493075	493080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10071	NC_017328	ACGC	2	8	493267	493274	25 %	0 %	25 %	50 %	384542070
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10089	NC_017328	TTGC	2	8	493945	493952	0 %	50 %	25 %	25 %	384542070
10090	NC_017328	TAC	2	6	493976	493981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542070
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10097	NC_017328	GTTTC	2	10	494181	494190	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10100	NC_017328	AT	3	6	494407	494412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_017328	CT	3	6	494441	494446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_017328	T	6	6	494448	494453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_017328	TAC	2	6	494508	494513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_017328	TAAA	2	8	494525	494532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_017328	TA	3	6	494542	494547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017328	AT	4	8	494580	494587	50 %	50 %	0 %	0 %	384542071
10107	NC_017328	ATTT	2	8	494597	494604	25 %	75 %	0 %	0 %	384542071
10108	NC_017328	GCTG	2	8	494612	494619	0 %	25 %	50 %	25 %	384542071
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10123	NC_017328	GTT	2	6	495139	495144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017328	TA	3	6	495151	495156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_017328	TGG	2	6	495201	495206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_017328	TTA	2	6	495248	495253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_017328	ATG	2	6	495266	495271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10129	NC_017328	AAG	2	6	495278	495283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10232	NC_017328	ATTG	2	8	500892	500899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_017328	CCA	2	6	500961	500966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10234	NC_017328	GTT	2	6	500993	500998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_017328	GGC	3	9	501057	501065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10238	NC_017328	GTT	2	6	501191	501196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10243	NC_017328	CGT	2	6	501713	501718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_017328	CTT	2	6	501725	501730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_017328	CAA	2	6	501755	501760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10247	NC_017328	AAG	2	6	502023	502028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_017328	CTG	2	6	502071	502076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_017328	GCA	2	6	502136	502141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_017328	TTCC	2	8	502160	502167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_017328	GCA	2	6	502174	502179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_017328	TTC	2	6	502305	502310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_017328	GCC	2	6	502345	502350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_017328	TCA	2	6	502420	502425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_017328	TA	3	6	502494	502499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_017328	TCG	2	6	502525	502530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10258	NC_017328	CAG	2	6	502662	502667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10359	NC_017328	AGC	2	6	508339	508344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
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10362	NC_017328	CAG	2	6	508537	508542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
10363	NC_017328	ATTT	2	8	508699	508706	25 %	75 %	0 %	0 %	384542082
10364	NC_017328	GCA	2	6	508731	508736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
10365	NC_017328	GA	3	6	508754	508759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10367	NC_017328	CAT	3	9	508836	508844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542083
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10492	NC_017328	CAT	2	6	514885	514890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542091
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