MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017328	GTGG	2	8	23837	23844	0 %	25 %	75 %	0 %	384541603
502	NC_017328	GGC	2	6	23887	23892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541603
503	NC_017328	ACG	2	6	23964	23969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541603
504	NC_017328	CTG	2	6	23973	23978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541603
505	NC_017328	CAG	2	6	23984	23989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541603
506	NC_017328	GCT	2	6	24051	24056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541603
507	NC_017328	CGGTGA	2	12	24130	24141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384541603
508	NC_017328	TGA	2	6	24158	24163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541603
509	NC_017328	GCTG	2	8	24191	24198	0 %	25 %	50 %	25 %	384541604
510	NC_017328	TGG	2	6	24203	24208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541604
511	NC_017328	GCA	2	6	24233	24238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541604
512	NC_017328	TCC	2	6	24248	24253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541604
513	NC_017328	GCG	2	6	24325	24330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541604
514	NC_017328	GCG	2	6	24350	24355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541604
515	NC_017328	TGA	2	6	24413	24418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541604
516	NC_017328	ATT	2	6	24469	24474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541604
517	NC_017328	GGC	2	6	24475	24480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541604
518	NC_017328	GC	3	6	24479	24484	0 %	0 %	50 %	50 %	384541604
519	NC_017328	A	6	6	24643	24648	100 %	0 %	0 %	0 %	384541604
520	NC_017328	AAT	2	6	24650	24655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541604
521	NC_017328	CGA	2	6	24797	24802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541605
522	NC_017328	CAC	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541605
523	NC_017328	CAA	2	6	24827	24832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541605
524	NC_017328	CTG	2	6	24894	24899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541605
525	NC_017328	ACC	2	6	24921	24926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541605
526	NC_017328	GCG	2	6	24945	24950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541605
527	NC_017328	CCG	2	6	24989	24994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541605
528	NC_017328	ATGG	2	8	25050	25057	25 %	25 %	50 %	0 %	384541605
529	NC_017328	TTG	2	6	25253	25258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541606
530	NC_017328	AT	3	6	25288	25293	50 %	50 %	0 %	0 %	384541606
531	NC_017328	GTG	2	6	25306	25311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541606
532	NC_017328	GAA	2	6	25531	25536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541606
533	NC_017328	TG	3	6	25638	25643	0 %	50 %	50 %	0 %	384541606
534	NC_017328	TGG	2	6	25844	25849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541606
535	NC_017328	CTC	2	6	25863	25868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541606
536	NC_017328	TTGA	2	8	25921	25928	25 %	50 %	25 %	0 %	384541606
537	NC_017328	TGG	2	6	26024	26029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541606
538	NC_017328	GCA	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541606
539	NC_017328	GTG	3	9	26048	26056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541606
540	NC_017328	GAA	2	6	26080	26085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541606
541	NC_017328	AGC	2	6	26149	26154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017328	T	6	6	26191	26196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017328	GAA	2	6	26199	26204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017328	GCC	2	6	26265	26270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541607
545	NC_017328	TGA	2	6	26302	26307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541607
546	NC_017328	CTG	2	6	26361	26366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541607
547	NC_017328	GCA	2	6	26436	26441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541607
548	NC_017328	TGGC	2	8	26464	26471	0 %	25 %	50 %	25 %	384541607
549	NC_017328	TTG	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541607
550	NC_017328	TGG	2	6	26566	26571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541607
551	NC_017328	TCG	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541607
552	NC_017328	CTG	2	6	26662	26667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541607
553	NC_017328	CTGG	2	8	26924	26931	0 %	25 %	50 %	25 %	384541607
554	NC_017328	ACG	2	6	27003	27008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541607
555	NC_017328	GTGG	2	8	27089	27096	0 %	25 %	75 %	0 %	384541607
556	NC_017328	TCAT	2	8	27148	27155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_017328	TCCC	2	8	27178	27185	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
558	NC_017328	TGGC	2	8	27219	27226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_017328	ATG	2	6	27293	27298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541608
560	NC_017328	G	6	6	27328	27333	0 %	0 %	100 %	0 %	384541608
561	NC_017328	GCC	2	6	27341	27346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541608
562	NC_017328	GGC	2	6	27357	27362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541608
563	NC_017328	GCG	2	6	27391	27396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541608
564	NC_017328	TCT	2	6	27412	27417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541608
565	NC_017328	GCTG	2	8	27441	27448	0 %	25 %	50 %	25 %	384541608
566	NC_017328	GAT	2	6	27499	27504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541608
567	NC_017328	GCA	2	6	27567	27572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541608
568	NC_017328	CGC	3	9	27636	27644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541608
569	NC_017328	GCC	2	6	27664	27669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541608
570	NC_017328	GCT	2	6	27702	27707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541608
571	NC_017328	AGC	2	6	27714	27719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541608
572	NC_017328	ATT	2	6	27751	27756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541608
573	NC_017328	CAT	2	6	27763	27768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541608
574	NC_017328	CGTG	2	8	27918	27925	0 %	25 %	50 %	25 %	384541608
575	NC_017328	AAT	2	6	28099	28104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541608
576	NC_017328	TAT	2	6	28123	28128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017328	ATTTA	2	10	28145	28154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017328	TCT	2	6	28244	28249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017328	TGT	2	6	28255	28260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017328	TCT	2	6	28320	28325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017328	TGC	2	6	28326	28331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017328	GAT	2	6	28356	28361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017328	CATG	2	8	28388	28395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_017328	ATA	2	6	28405	28410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017328	A	6	6	28412	28417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017328	GCC	2	6	28460	28465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_017328	TCG	2	6	28479	28484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017328	TCA	2	6	28510	28515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017328	AGTG	2	8	28538	28545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017328	CGG	2	6	28639	28644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541609
591	NC_017328	TCCT	2	8	28700	28707	0 %	50 %	0 %	50 %	384541609
592	NC_017328	CTTA	2	8	28728	28735	25 %	50 %	0 %	25 %	384541609
593	NC_017328	GAA	2	6	28773	28778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541609
594	NC_017328	TCT	2	6	28779	28784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541609
595	NC_017328	CT	3	6	28857	28862	0 %	50 %	0 %	50 %	384541609
596	NC_017328	GCG	2	6	28983	28988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541609
597	NC_017328	CG	3	6	29007	29012	0 %	0 %	50 %	50 %	384541609
598	NC_017328	ACC	2	6	29052	29057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541609
599	NC_017328	CGG	2	6	29099	29104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541609
600	NC_017328	A	6	6	29118	29123	100 %	0 %	0 %	0 %	384541609
601	NC_017328	CGT	2	6	29144	29149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541609
602	NC_017328	TGG	2	6	29191	29196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541609
603	NC_017328	TCA	2	6	29378	29383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541609
604	NC_017328	GCT	2	6	29384	29389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541609
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607	NC_017328	GTG	2	6	29475	29480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541609
608	NC_017328	CATCG	2	10	29586	29595	20 %	20 %	20 %	40 %	384541609
609	NC_017328	AGCC	2	8	29630	29637	25 %	0 %	25 %	50 %	384541609
610	NC_017328	ACG	2	6	29647	29652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541609
611	NC_017328	GTT	2	6	29660	29665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541609
612	NC_017328	ACT	2	6	29811	29816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541610
613	NC_017328	GC	3	6	29820	29825	0 %	0 %	50 %	50 %	384541610
614	NC_017328	CAT	2	6	29890	29895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541610
615	NC_017328	GACC	2	8	29896	29903	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
616	NC_017328	ATT	2	6	29960	29965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541610
617	NC_017328	TGC	2	6	29988	29993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541610
618	NC_017328	GC	3	6	30024	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	384541610
619	NC_017328	AGA	2	6	30109	30114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541610
620	NC_017328	CCG	2	6	30115	30120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541610
621	NC_017328	GAA	2	6	30139	30144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541610
622	NC_017328	CG	3	6	30160	30165	0 %	0 %	50 %	50 %	384541610
623	NC_017328	CA	3	6	30177	30182	50 %	0 %	0 %	50 %	384541610
624	NC_017328	GAA	2	6	30188	30193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541610
625	NC_017328	GCTG	2	8	30196	30203	0 %	25 %	50 %	25 %	384541610
626	NC_017328	ATT	2	6	30230	30235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541610
627	NC_017328	GCG	3	9	30261	30269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541610
628	NC_017328	GAA	2	6	30296	30301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541610
629	NC_017328	TC	4	8	30322	30329	0 %	50 %	0 %	50 %	384541610
630	NC_017328	TGAT	2	8	30345	30352	25 %	50 %	25 %	0 %	384541610
631	NC_017328	GTG	2	6	30389	30394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541610
632	NC_017328	CAT	2	6	30415	30420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541610
633	NC_017328	TGC	2	6	30543	30548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541610
634	NC_017328	GGT	2	6	30569	30574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541610
635	NC_017328	TTC	2	6	30649	30654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541610
636	NC_017328	GGC	2	6	30697	30702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541610
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639	NC_017328	CGCA	2	8	30896	30903	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
640	NC_017328	CG	3	6	31061	31066	0 %	0 %	50 %	50 %	384541610
641	NC_017328	CTGT	2	8	31070	31077	0 %	50 %	25 %	25 %	384541610
642	NC_017328	GAA	2	6	31130	31135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541610
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645	NC_017328	GAA	2	6	31373	31378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541610
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648	NC_017328	A	6	6	31410	31415	100 %	0 %	0 %	0 %	384541610
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652	NC_017328	CTGAAA	2	12	31784	31795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384541610
653	NC_017328	TGG	2	6	31866	31871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541610
654	NC_017328	CGTC	2	8	31874	31881	0 %	25 %	25 %	50 %	384541610
655	NC_017328	CGG	2	6	31891	31896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541610
656	NC_017328	CGG	2	6	31950	31955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541610
657	NC_017328	TGA	2	6	31999	32004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541610
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660	NC_017328	TGA	2	6	32205	32210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541610
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665	NC_017328	GCTG	2	8	32350	32357	0 %	25 %	50 %	25 %	384541610
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681	NC_017328	ACC	2	6	32855	32860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541610
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683	NC_017328	GCAC	2	8	32935	32942	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
684	NC_017328	ATA	2	6	32950	32955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541610
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687	NC_017328	TGA	2	6	33072	33077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
688	NC_017328	AT	3	6	33129	33134	50 %	50 %	0 %	0 %	384541611
689	NC_017328	TG	3	6	33216	33221	0 %	50 %	50 %	0 %	384541611
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693	NC_017328	GAT	2	6	33394	33399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541611
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734	NC_017328	CAC	2	6	35336	35341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541614
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755	NC_017328	GTT	2	6	36259	36264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541614
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