MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
92001	NC_017328	ATG	2	6	4514081	4514086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92002	NC_017328	CCTT	2	8	4514109	4514116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92003	NC_017328	T	6	6	4514118	4514123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92004	NC_017328	A	6	6	4514169	4514174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92005	NC_017328	T	6	6	4514195	4514200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92006	NC_017328	TAC	2	6	4514206	4514211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92007	NC_017328	TCA	2	6	4514234	4514239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545816
92008	NC_017328	GTAA	2	8	4514416	4514423	50 %	25 %	25 %	0 %	384545816
92009	NC_017328	CTT	2	6	4514460	4514465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545816
92010	NC_017328	CAG	2	6	4514497	4514502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545816
92011	NC_017328	TGGCC	2	10	4514544	4514553	0 %	20 %	40 %	40 %	384545816
92012	NC_017328	CTG	2	6	4514595	4514600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545816
92013	NC_017328	GTG	2	6	4514612	4514617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545816
92014	NC_017328	AAC	2	6	4514662	4514667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545816
92015	NC_017328	ATG	2	6	4514687	4514692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545816
92016	NC_017328	AGA	2	6	4514749	4514754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545816
92017	NC_017328	GC	3	6	4514808	4514813	0 %	0 %	50 %	50 %	384545816
92018	NC_017328	CATAA	2	10	4514821	4514830	60 %	20 %	0 %	20 %	384545816
92019	NC_017328	T	6	6	4514902	4514907	0 %	100 %	0 %	0 %	384545816
92020	NC_017328	CAG	3	9	4514980	4514988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545816
92021	NC_017328	CTT	3	9	4515015	4515023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545816
92022	NC_017328	CAG	2	6	4515025	4515030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545816
92023	NC_017328	CGT	2	6	4515219	4515224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545816
92024	NC_017328	GCC	2	6	4515355	4515360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545816
92025	NC_017328	GTT	2	6	4515400	4515405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545816
92026	NC_017328	TCA	2	6	4515413	4515418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545816
92027	NC_017328	ATG	2	6	4515428	4515433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545816
92028	NC_017328	TTTG	2	8	4515469	4515476	0 %	75 %	25 %	0 %	384545816
92029	NC_017328	T	6	6	4515490	4515495	0 %	100 %	0 %	0 %	384545816
92030	NC_017328	TGT	2	6	4515540	4515545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545816
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92032	NC_017328	TCT	2	6	4515629	4515634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545816
92033	NC_017328	TGT	2	6	4515645	4515650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545816
92034	NC_017328	CTT	2	6	4515664	4515669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545816
92035	NC_017328	AC	3	6	4515697	4515702	50 %	0 %	0 %	50 %	384545816
92036	NC_017328	AT	3	6	4515706	4515711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92037	NC_017328	CGAC	2	8	4515730	4515737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92038	NC_017328	TGC	2	6	4515775	4515780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92039	NC_017328	ATT	2	6	4515835	4515840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92040	NC_017328	TAC	2	6	4515871	4515876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92041	NC_017328	GCT	2	6	4515972	4515977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92042	NC_017328	GCA	2	6	4516167	4516172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545817
92043	NC_017328	A	6	6	4516172	4516177	100 %	0 %	0 %	0 %	384545817
92044	NC_017328	GGC	2	6	4516179	4516184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545817
92045	NC_017328	GCG	2	6	4516198	4516203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545817
92046	NC_017328	GAT	2	6	4516206	4516211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545817
92047	NC_017328	ATT	2	6	4516228	4516233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545817
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92049	NC_017328	TTA	2	6	4516249	4516254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545817
92050	NC_017328	TCT	2	6	4516281	4516286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545817
92051	NC_017328	GCC	2	6	4516296	4516301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545817
92052	NC_017328	GGC	2	6	4516360	4516365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545817
92053	NC_017328	GAT	2	6	4516423	4516428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545817
92054	NC_017328	GACCGC	2	12	4516429	4516440	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384545817
92055	NC_017328	CCA	2	6	4516542	4516547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545818
92056	NC_017328	ACC	2	6	4516616	4516621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545818
92057	NC_017328	AGT	2	6	4516625	4516630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545818
92058	NC_017328	AAT	2	6	4516646	4516651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545818
92059	NC_017328	GCAT	2	8	4516665	4516672	25 %	25 %	25 %	25 %	384545818
92060	NC_017328	ATA	2	6	4516685	4516690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545818
92061	NC_017328	ATAA	2	8	4516705	4516712	75 %	25 %	0 %	0 %	384545818
92062	NC_017328	CAC	2	6	4516759	4516764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545818
92063	NC_017328	GCA	2	6	4516765	4516770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545818
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92066	NC_017328	GACCA	2	10	4516856	4516865	40 %	0 %	20 %	40 %	384545818
92067	NC_017328	GGCG	2	8	4516866	4516873	0 %	0 %	75 %	25 %	384545818
92068	NC_017328	TA	3	6	4516882	4516887	50 %	50 %	0 %	0 %	384545818
92069	NC_017328	AAC	2	6	4516955	4516960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545818
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92083	NC_017328	CAGC	2	8	4517470	4517477	25 %	0 %	25 %	50 %	384545818
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92089	NC_017328	T	8	8	4517891	4517898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92227	NC_017328	GGC	2	6	4524243	4524248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545826
92228	NC_017328	TCA	2	6	4524313	4524318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545826
92229	NC_017328	TC	3	6	4524346	4524351	0 %	50 %	0 %	50 %	384545826
92230	NC_017328	GAT	2	6	4524413	4524418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92231	NC_017328	TTGC	2	8	4524441	4524448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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92233	NC_017328	TC	3	6	4524520	4524525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92234	NC_017328	TCT	2	6	4524544	4524549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92235	NC_017328	ATC	2	6	4524560	4524565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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92238	NC_017328	TAT	2	6	4524595	4524600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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