MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_017328	TAA	2	6	419164	419169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542001
8503	NC_017328	TGA	2	6	419177	419182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542001
8504	NC_017328	ACT	2	6	419269	419274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542001
8505	NC_017328	CTC	2	6	419296	419301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542001
8506	NC_017328	GCG	2	6	419364	419369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542001
8507	NC_017328	AGC	2	6	419396	419401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542001
8508	NC_017328	TAA	2	6	419417	419422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542001
8509	NC_017328	AAG	2	6	419567	419572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542001
8510	NC_017328	TAA	2	6	419613	419618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542001
8511	NC_017328	AAT	2	6	419654	419659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542001
8512	NC_017328	TAT	3	9	419793	419801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542001
8513	NC_017328	TGC	2	6	419840	419845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542001
8514	NC_017328	TAG	2	6	419894	419899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542001
8515	NC_017328	TGC	2	6	420005	420010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542001
8516	NC_017328	CAT	2	6	420034	420039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542001
8517	NC_017328	CCT	2	6	420129	420134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542001
8518	NC_017328	TGACGG	2	12	420198	420209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8519	NC_017328	ATT	2	6	420285	420290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_017328	TA	3	6	420313	420318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_017328	GAAA	2	8	420361	420368	75 %	0 %	25 %	0 %	384542002
8522	NC_017328	ATGG	2	8	420392	420399	25 %	25 %	50 %	0 %	384542002
8523	NC_017328	CAT	2	6	420419	420424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542002
8524	NC_017328	CT	3	6	420440	420445	0 %	50 %	0 %	50 %	384542002
8525	NC_017328	GCA	2	6	420514	420519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542002
8526	NC_017328	CG	3	6	420570	420575	0 %	0 %	50 %	50 %	384542002
8527	NC_017328	TGA	2	6	420607	420612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542002
8528	NC_017328	GCAT	2	8	420669	420676	25 %	25 %	25 %	25 %	384542002
8529	NC_017328	GAC	2	6	420686	420691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542002
8530	NC_017328	GGTT	2	8	420692	420699	0 %	50 %	50 %	0 %	384542002
8531	NC_017328	AG	3	6	420709	420714	50 %	0 %	50 %	0 %	384542002
8532	NC_017328	GTT	2	6	420721	420726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542002
8533	NC_017328	A	7	7	420773	420779	100 %	0 %	0 %	0 %	384542002
8534	NC_017328	ACG	2	6	420822	420827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542002
8535	NC_017328	TGC	2	6	420912	420917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542002
8536	NC_017328	TAT	2	6	421048	421053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542002
8537	NC_017328	GC	3	6	421075	421080	0 %	0 %	50 %	50 %	384542002
8538	NC_017328	TC	3	6	421128	421133	0 %	50 %	0 %	50 %	384542002
8539	NC_017328	CTGG	2	8	421147	421154	0 %	25 %	50 %	25 %	384542002
8540	NC_017328	T	9	9	421220	421228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_017328	GTG	2	6	421253	421258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542003
8542	NC_017328	A	7	7	421316	421322	100 %	0 %	0 %	0 %	384542003
8543	NC_017328	GCT	2	6	421363	421368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542003
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8546	NC_017328	ACC	2	6	421433	421438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542003
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8549	NC_017328	CTG	2	6	421499	421504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542003
8550	NC_017328	A	6	6	421512	421517	100 %	0 %	0 %	0 %	384542003
8551	NC_017328	CAG	2	6	421564	421569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542003
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8553	NC_017328	ACG	2	6	421689	421694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542003
8554	NC_017328	CTT	2	6	421779	421784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542003
8555	NC_017328	AATA	2	8	421794	421801	75 %	25 %	0 %	0 %	384542003
8556	NC_017328	TCAGG	2	10	421809	421818	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8557	NC_017328	ATT	2	6	421833	421838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542004
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8559	NC_017328	TGC	2	6	421916	421921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542004
8560	NC_017328	TGGT	2	8	421940	421947	0 %	50 %	50 %	0 %	384542004
8561	NC_017328	TTG	2	6	421949	421954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542004
8562	NC_017328	AAC	2	6	421970	421975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542004
8563	NC_017328	TAC	2	6	421980	421985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542004
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8573	NC_017328	CGACC	2	10	422559	422568	20 %	0 %	20 %	60 %	384542004
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8605	NC_017328	GCC	2	6	423824	423829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542005
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8992	NC_017328	ATCC	2	8	442295	442302	25 %	25 %	0 %	50 %	384542020
8993	NC_017328	GGACTG	2	12	442343	442354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384542020
8994	NC_017328	GCCTG	2	10	442425	442434	0 %	20 %	40 %	40 %	384542020
8995	NC_017328	GCT	2	6	442466	442471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542020
8996	NC_017328	GCTG	2	8	442504	442511	0 %	25 %	50 %	25 %	384542020
8997	NC_017328	AC	3	6	442573	442578	50 %	0 %	0 %	50 %	384542020
8998	NC_017328	CG	3	6	442605	442610	0 %	0 %	50 %	50 %	384542020
8999	NC_017328	ATT	2	6	442626	442631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542020
9000	NC_017328	A	6	6	442698	442703	100 %	0 %	0 %	0 %	384542020

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