MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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79002	NC_017328	CTGG	2	8	3876438	3876445	0 %	25 %	50 %	25 %	384545269
79003	NC_017328	TTA	2	6	3876555	3876560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545269
79004	NC_017328	CGA	2	6	3876651	3876656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545269
79005	NC_017328	CCGAA	2	10	3876659	3876668	40 %	0 %	20 %	40 %	384545269
79006	NC_017328	TGA	2	6	3876702	3876707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545269
79007	NC_017328	CGG	2	6	3876783	3876788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545269
79008	NC_017328	AGA	2	6	3876933	3876938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545269
79009	NC_017328	CAT	2	6	3876970	3876975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545269
79010	NC_017328	GCCA	2	8	3877079	3877086	25 %	0 %	25 %	50 %	384545269
79011	NC_017328	TTC	2	6	3877180	3877185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545269
79012	NC_017328	AGA	2	6	3877227	3877232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545269
79013	NC_017328	TTA	2	6	3877266	3877271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545269
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79015	NC_017328	TAA	2	6	3877305	3877310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545269
79016	NC_017328	TGC	2	6	3877406	3877411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545269
79017	NC_017328	ATG	2	6	3877431	3877436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79018	NC_017328	TTCCAT	2	12	3877461	3877472	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79019	NC_017328	TCCT	2	8	3877479	3877486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79020	NC_017328	GTG	2	6	3877504	3877509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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79022	NC_017328	GTGAT	2	10	3877753	3877762	20 %	40 %	40 %	0 %	384545270
79023	NC_017328	GCTG	2	8	3877819	3877826	0 %	25 %	50 %	25 %	384545270
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79025	NC_017328	TCT	2	6	3877904	3877909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545270
79026	NC_017328	CTG	2	6	3877914	3877919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545270
79027	NC_017328	TGGC	2	8	3877952	3877959	0 %	25 %	50 %	25 %	384545270
79028	NC_017328	AATCTG	2	12	3878034	3878045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384545270
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79030	NC_017328	CCTTT	2	10	3878309	3878318	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79031	NC_017328	A	6	6	3878388	3878393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79032	NC_017328	TC	3	6	3878395	3878400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79033	NC_017328	CCT	2	6	3878450	3878455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79034	NC_017328	TCA	2	6	3878477	3878482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545272
79035	NC_017328	ACC	2	6	3878487	3878492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545272
79036	NC_017328	TAC	2	6	3878546	3878551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545272
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79039	NC_017328	TGC	2	6	3878681	3878686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545272
79040	NC_017328	ATG	2	6	3878700	3878705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545272
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79042	NC_017328	CTT	2	6	3878844	3878849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545272
79043	NC_017328	CGTT	2	8	3878864	3878871	0 %	50 %	25 %	25 %	384545272
79044	NC_017328	GAT	2	6	3878876	3878881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545272
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79052	NC_017328	CTT	2	6	3879400	3879405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545272
79053	NC_017328	GTT	2	6	3879474	3879479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545272
79054	NC_017328	CTG	2	6	3879483	3879488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545272
79055	NC_017328	CTG	2	6	3879492	3879497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545272
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79057	NC_017328	TGA	2	6	3879574	3879579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545272
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79059	NC_017328	TGA	2	6	3879646	3879651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545272
79060	NC_017328	TGA	2	6	3879709	3879714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545272
79061	NC_017328	ATC	2	6	3879756	3879761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545272
79062	NC_017328	GCT	2	6	3879767	3879772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545272
79063	NC_017328	CATG	2	8	3879835	3879842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79064	NC_017328	T	6	6	3879855	3879860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79065	NC_017328	GGT	2	6	3879916	3879921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545273
79066	NC_017328	ATCA	2	8	3879935	3879942	50 %	25 %	0 %	25 %	384545273
79067	NC_017328	CGC	2	6	3879979	3879984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545273
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79069	NC_017328	GC	4	8	3880055	3880062	0 %	0 %	50 %	50 %	384545273
79070	NC_017328	AGT	2	6	3880174	3880179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545273
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79088	NC_017328	T	6	6	3881310	3881315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79089	NC_017328	CAG	2	6	3881438	3881443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79090	NC_017328	T	7	7	3881463	3881469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79091	NC_017328	CAAC	2	8	3881500	3881507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79092	NC_017328	GTA	2	6	3881528	3881533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79093	NC_017328	GCGCG	2	10	3881543	3881552	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79094	NC_017328	TCCT	2	8	3881697	3881704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79095	NC_017328	TAA	2	6	3881730	3881735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79097	NC_017328	GCTG	2	8	3881911	3881918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79098	NC_017328	AT	3	6	3881979	3881984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79099	NC_017328	A	7	7	3881986	3881992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79100	NC_017328	ACA	2	6	3882051	3882056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79101	NC_017328	TTA	2	6	3882105	3882110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79102	NC_017328	CAGA	2	8	3882134	3882141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79103	NC_017328	TGA	2	6	3882150	3882155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79104	NC_017328	CGG	2	6	3882214	3882219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79105	NC_017328	CAT	2	6	3882246	3882251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79106	NC_017328	CGAACC	2	12	3882332	3882343	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79107	NC_017328	CTG	2	6	3882367	3882372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79108	NC_017328	CA	3	6	3882435	3882440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79109	NC_017328	CCA	2	6	3882588	3882593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79110	NC_017328	TAA	2	6	3882756	3882761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79111	NC_017328	CGT	2	6	3882820	3882825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79112	NC_017328	ATC	2	6	3882872	3882877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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79114	NC_017328	A	7	7	3882890	3882896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79115	NC_017328	GAT	2	6	3883019	3883024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79116	NC_017328	CGAG	2	8	3883107	3883114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79117	NC_017328	CAC	2	6	3883151	3883156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79118	NC_017328	ATC	3	9	3883255	3883263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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