MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_017328	CTT	3	9	347025	347033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541927
7004	NC_017328	GGA	2	6	347152	347157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541928
7005	NC_017328	AAG	2	6	347275	347280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541928
7006	NC_017328	ATAC	2	8	347347	347354	50 %	25 %	0 %	25 %	384541928
7007	NC_017328	ACC	2	6	347362	347367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541928
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7009	NC_017328	TCT	2	6	347428	347433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_017328	TAA	2	6	347440	347445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017328	ATC	2	6	347463	347468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017328	ATCG	2	8	347478	347485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7013	NC_017328	TGA	2	6	347500	347505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017328	CA	3	6	347518	347523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7015	NC_017328	TG	3	6	347566	347571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017328	AT	4	8	347609	347616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017328	CAT	2	6	347622	347627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_017328	TCA	2	6	347628	347633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_017328	TGCT	2	8	347679	347686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7020	NC_017328	TAT	2	6	347748	347753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017328	CAT	2	6	347781	347786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541929
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7023	NC_017328	CGTG	2	8	347855	347862	0 %	25 %	50 %	25 %	384541929
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7046	NC_017328	T	7	7	349166	349172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017328	AT	3	6	349174	349179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017328	CAGC	2	8	349240	349247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7055	NC_017328	TG	3	6	349720	349725	0 %	50 %	50 %	0 %	384541931
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7059	NC_017328	CCAC	2	8	349937	349944	25 %	0 %	0 %	75 %	384541931
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7064	NC_017328	CAT	2	6	350330	350335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7112	NC_017328	CG	3	6	353145	353150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7126	NC_017328	GAA	2	6	353920	353925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541935
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7357	NC_017328	ACC	2	6	364089	364094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541945
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7365	NC_017328	ACA	2	6	364499	364504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7366	NC_017328	AGA	2	6	364537	364542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541947
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7368	NC_017328	GGC	2	6	364685	364690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541947
7369	NC_017328	TCA	2	6	364704	364709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541947
7370	NC_017328	GTG	2	6	364748	364753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541947
7371	NC_017328	GAA	3	9	364772	364780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541947
7372	NC_017328	TGG	2	6	364848	364853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541947
7373	NC_017328	GGCG	2	8	364954	364961	0 %	0 %	75 %	25 %	384541947
7374	NC_017328	CTG	2	6	364997	365002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541947
7375	NC_017328	T	6	6	365006	365011	0 %	100 %	0 %	0 %	384541947
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7380	NC_017328	TGC	2	6	365309	365314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541948
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7382	NC_017328	TGG	2	6	365423	365428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541948
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7393	NC_017328	TACG	2	8	365904	365911	25 %	25 %	25 %	25 %	384541948
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7399	NC_017328	GATA	2	8	366172	366179	50 %	25 %	25 %	0 %	384541948
7400	NC_017328	CGG	2	6	366412	366417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541948
7401	NC_017328	ATC	2	6	366456	366461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541948
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7403	NC_017328	T	6	6	366654	366659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7404	NC_017328	TGGT	2	8	366707	366714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7405	NC_017328	TA	3	6	366728	366733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7406	NC_017328	CCT	2	6	366751	366756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7407	NC_017328	ACTG	2	8	366805	366812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7408	NC_017328	TTC	2	6	366839	366844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7409	NC_017328	ATC	2	6	366898	366903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7410	NC_017328	ACA	2	6	366933	366938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7411	NC_017328	CG	3	6	366982	366987	0 %	0 %	50 %	50 %	384541949
7412	NC_017328	ATC	2	6	366990	366995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541949
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7430	NC_017328	CT	3	6	367896	367901	0 %	50 %	0 %	50 %	384541949
7431	NC_017328	CGG	2	6	367925	367930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541949
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7438	NC_017328	CG	3	6	368244	368249	0 %	0 %	50 %	50 %	384541949
7439	NC_017328	GTC	2	6	368254	368259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541949
7440	NC_017328	T	6	6	368328	368333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7441	NC_017328	GTT	2	6	368489	368494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541950
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7447	NC_017328	TGA	2	6	368773	368778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541950
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7453	NC_017328	CGG	2	6	368927	368932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541950
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7472	NC_017328	GCTG	2	8	369713	369720	0 %	25 %	50 %	25 %	384541950
7473	NC_017328	AAT	2	6	369727	369732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541950
7474	NC_017328	AGG	2	6	369756	369761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7475	NC_017328	TCC	3	9	369801	369809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7476	NC_017328	GAT	2	6	369825	369830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7477	NC_017328	TCA	2	6	369871	369876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7478	NC_017328	ATG	2	6	369887	369892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541951
7479	NC_017328	CAAAG	2	10	369932	369941	60 %	0 %	20 %	20 %	384541951
7480	NC_017328	TGC	2	6	369996	370001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
7481	NC_017328	GAA	2	6	370019	370024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541951
7482	NC_017328	AGC	2	6	370044	370049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541951
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7484	NC_017328	TC	3	6	370096	370101	0 %	50 %	0 %	50 %	384541951
7485	NC_017328	CGG	2	6	370115	370120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
7486	NC_017328	CTG	2	6	370136	370141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
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7488	NC_017328	T	6	6	370260	370265	0 %	100 %	0 %	0 %	384541951
7489	NC_017328	CAT	2	6	370334	370339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541951
7490	NC_017328	ATC	2	6	370355	370360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541951
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7492	NC_017328	GGC	2	6	370415	370420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
7493	NC_017328	TGC	2	6	370575	370580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
7494	NC_017328	GCA	2	6	370597	370602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541951
7495	NC_017328	G	6	6	370687	370692	0 %	0 %	100 %	0 %	384541951
7496	NC_017328	TGA	2	6	370741	370746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541951
7497	NC_017328	TGGCT	2	10	370763	370772	0 %	40 %	40 %	20 %	384541951
7498	NC_017328	TGAA	2	8	370815	370822	50 %	25 %	25 %	0 %	384541951
7499	NC_017328	GGC	2	6	370887	370892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
7500	NC_017328	GC	3	6	370928	370933	0 %	0 %	50 %	50 %	384541951

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