MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017328	CGTC	2	8	220838	220845	0 %	25 %	25 %	50 %	384541774
4503	NC_017328	CAG	2	6	220854	220859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541774
4504	NC_017328	CAG	2	6	220890	220895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541774
4505	NC_017328	T	6	6	220930	220935	0 %	100 %	0 %	0 %	384541774
4506	NC_017328	GAT	2	6	220967	220972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541774
4507	NC_017328	ATC	2	6	221026	221031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541774
4508	NC_017328	TAA	2	6	221083	221088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541774
4509	NC_017328	TTC	2	6	221161	221166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541774
4510	NC_017328	CAG	2	6	221190	221195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541774
4511	NC_017328	AC	3	6	221315	221320	50 %	0 %	0 %	50 %	384541774
4512	NC_017328	CAG	2	6	221331	221336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541774
4513	NC_017328	GCG	2	6	221360	221365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541774
4514	NC_017328	CGG	2	6	221404	221409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541774
4515	NC_017328	GCA	2	6	221480	221485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541774
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4517	NC_017328	CAT	2	6	221559	221564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541774
4518	NC_017328	GGCAA	2	10	221610	221619	40 %	0 %	40 %	20 %	384541774
4519	NC_017328	GA	3	6	221621	221626	50 %	0 %	50 %	0 %	384541774
4520	NC_017328	A	7	7	221721	221727	100 %	0 %	0 %	0 %	384541774
4521	NC_017328	CTC	2	6	221805	221810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541775
4522	NC_017328	CCA	2	6	221940	221945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541775
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4531	NC_017328	TTGC	2	8	222612	222619	0 %	50 %	25 %	25 %	384541775
4532	NC_017328	CGA	2	6	222657	222662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541775
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4534	NC_017328	ATTT	2	8	222739	222746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017328	AAT	2	6	222796	222801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017328	A	6	6	222948	222953	100 %	0 %	0 %	0 %	384541776
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4555	NC_017328	ATG	2	6	224191	224196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541777
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4557	NC_017328	GTGAA	2	10	224212	224221	40 %	20 %	40 %	0 %	384541777
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4560	NC_017328	TAG	2	6	224467	224472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541777
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4563	NC_017328	A	6	6	224594	224599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017328	TAT	2	6	224625	224630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017328	TGT	3	9	224653	224661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541778
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4580	NC_017328	GTA	3	9	225622	225630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541778
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4593	NC_017328	ATTA	2	8	226135	226142	50 %	50 %	0 %	0 %	384541779
4594	NC_017328	A	7	7	226163	226169	100 %	0 %	0 %	0 %	384541779
4595	NC_017328	T	6	6	226217	226222	0 %	100 %	0 %	0 %	384541779
4596	NC_017328	ATA	2	6	226246	226251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541779
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4600	NC_017328	CGC	2	6	226434	226439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541779
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4611	NC_017328	TTA	2	6	227170	227175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541780
4612	NC_017328	TGAT	2	8	227195	227202	25 %	50 %	25 %	0 %	384541780
4613	NC_017328	TGGC	2	8	227205	227212	0 %	25 %	50 %	25 %	384541780
4614	NC_017328	ACTGG	2	10	227322	227331	20 %	20 %	40 %	20 %	384541780
4615	NC_017328	CT	3	6	227332	227337	0 %	50 %	0 %	50 %	384541780
4616	NC_017328	TTG	2	6	227338	227343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541780
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4618	NC_017328	AACA	2	8	227389	227396	75 %	0 %	0 %	25 %	384541780
4619	NC_017328	GGA	2	6	227398	227403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541780
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4622	NC_017328	TCA	2	6	227629	227634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541781
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4728	NC_017328	A	7	7	232685	232691	100 %	0 %	0 %	0 %	384541787
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4741	NC_017328	CAG	2	6	233222	233227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4742	NC_017328	TC	3	6	233284	233289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4990	NC_017328	CTG	2	6	245660	245665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541801
4991	NC_017328	GAG	2	6	245689	245694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541801
4992	NC_017328	TCG	2	6	245764	245769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541801
4993	NC_017328	AAG	2	6	245854	245859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541801
4994	NC_017328	GTT	2	6	245866	245871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541801
4995	NC_017328	CTG	2	6	245923	245928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541801
4996	NC_017328	TTC	2	6	245965	245970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541801
4997	NC_017328	AAC	2	6	245980	245985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541801
4998	NC_017328	AC	3	6	246104	246109	50 %	0 %	0 %	50 %	384541801
4999	NC_017328	CAG	2	6	246114	246119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541801
5000	NC_017328	GCG	2	6	246127	246132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541801

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