MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_017327	CCCG	2	8	1604906	1604913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34002	NC_017327	CGGG	2	8	1604921	1604928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34003	NC_017327	TGCC	2	8	1604933	1604940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34004	NC_017327	CG	3	6	1605016	1605021	0 %	0 %	50 %	50 %	384541530
34005	NC_017327	ACC	2	6	1605022	1605027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541530
34006	NC_017327	CAT	2	6	1605096	1605101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541530
34007	NC_017327	TCG	2	6	1605125	1605130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34008	NC_017327	GCGGAG	2	12	1605146	1605157	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384541530
34009	NC_017327	GGC	2	6	1605168	1605173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34010	NC_017327	TCG	2	6	1605197	1605202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34011	NC_017327	ACA	2	6	1605266	1605271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541530
34012	NC_017327	ATGC	2	8	1605283	1605290	25 %	25 %	25 %	25 %	384541530
34013	NC_017327	CAT	2	6	1605315	1605320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541530
34014	NC_017327	CGG	2	6	1605357	1605362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34015	NC_017327	CAA	2	6	1605414	1605419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541530
34016	NC_017327	AAG	2	6	1605484	1605489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541530
34017	NC_017327	GCG	2	6	1605518	1605523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34018	NC_017327	GAG	2	6	1605622	1605627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541530
34019	NC_017327	CAA	2	6	1605660	1605665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541530
34020	NC_017327	ATT	2	6	1605668	1605673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541530
34021	NC_017327	GCG	2	6	1605705	1605710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34022	NC_017327	CCA	2	6	1605740	1605745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541530
34023	NC_017327	CGT	2	6	1605750	1605755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34024	NC_017327	AGC	2	6	1605767	1605772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34025	NC_017327	CCA	2	6	1605776	1605781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541530
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34028	NC_017327	GGC	2	6	1605832	1605837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34029	NC_017327	GGC	2	6	1605855	1605860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34030	NC_017327	TCG	2	6	1605901	1605906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34031	NC_017327	CCA	2	6	1605929	1605934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541530
34032	NC_017327	TGC	2	6	1605935	1605940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34033	NC_017327	ATC	2	6	1606009	1606014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541530
34034	NC_017327	CGG	2	6	1606017	1606022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34035	NC_017327	CGG	2	6	1606131	1606136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541530
34036	NC_017327	TCCC	2	8	1606155	1606162	0 %	25 %	0 %	75 %	384541530
34037	NC_017327	CGT	2	6	1606179	1606184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34038	NC_017327	GTC	2	6	1606222	1606227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541530
34039	NC_017327	TCTT	2	8	1606270	1606277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34040	NC_017327	CAG	2	6	1606322	1606327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_017327	GCC	2	6	1606336	1606341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34042	NC_017327	GT	3	6	1606395	1606400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34043	NC_017327	TCT	2	6	1606539	1606544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34044	NC_017327	AGTT	2	8	1606607	1606614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34045	NC_017327	GCA	2	6	1606654	1606659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34046	NC_017327	GTT	2	6	1606749	1606754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34047	NC_017327	CTTG	2	8	1606855	1606862	0 %	50 %	25 %	25 %	384541531
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34050	NC_017327	GCA	2	6	1606990	1606995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541531
34051	NC_017327	CGCGG	2	10	1607012	1607021	0 %	0 %	60 %	40 %	384541531
34052	NC_017327	CGG	2	6	1607046	1607051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541531
34053	NC_017327	CAA	2	6	1607077	1607082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541531
34054	NC_017327	TGC	2	6	1607104	1607109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541531
34055	NC_017327	GGC	2	6	1607111	1607116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541531
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34057	NC_017327	CGAG	2	8	1607172	1607179	25 %	0 %	50 %	25 %	384541531
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34063	NC_017327	TCG	2	6	1607439	1607444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541531
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34066	NC_017327	GGCC	2	8	1607639	1607646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34067	NC_017327	GA	3	6	1607711	1607716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34068	NC_017327	GACG	2	8	1607779	1607786	25 %	0 %	50 %	25 %	384541532
34069	NC_017327	GC	3	6	1607872	1607877	0 %	0 %	50 %	50 %	384541532
34070	NC_017327	TCGAT	2	10	1607880	1607889	20 %	40 %	20 %	20 %	384541532
34071	NC_017327	GC	3	6	1607969	1607974	0 %	0 %	50 %	50 %	384541532
34072	NC_017327	GCTT	2	8	1608016	1608023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34073	NC_017327	ACG	2	6	1608062	1608067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541533
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34079	NC_017327	ACG	2	6	1608389	1608394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541533
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34086	NC_017327	CA	3	6	1608662	1608667	50 %	0 %	0 %	50 %	384541533
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34089	NC_017327	GAG	2	6	1608709	1608714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541533
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34092	NC_017327	CAAGGC	2	12	1608849	1608860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541533
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34094	NC_017327	CG	3	6	1608895	1608900	0 %	0 %	50 %	50 %	384541533
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34098	NC_017327	CG	3	6	1609032	1609037	0 %	0 %	50 %	50 %	384541533
34099	NC_017327	CAG	2	6	1609080	1609085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34100	NC_017327	GA	3	6	1609104	1609109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34101	NC_017327	GCA	2	6	1609113	1609118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34102	NC_017327	CGC	3	9	1609199	1609207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541534
34103	NC_017327	GGA	2	6	1609262	1609267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541534
34104	NC_017327	TCGGC	2	10	1609268	1609277	0 %	20 %	40 %	40 %	384541534
34105	NC_017327	CAC	2	6	1609295	1609300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541534
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34111	NC_017327	GATT	2	8	1609600	1609607	25 %	50 %	25 %	0 %	384541534
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34115	NC_017327	GGA	2	6	1609688	1609693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541534
34116	NC_017327	GCA	2	6	1609700	1609705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541534
34117	NC_017327	CGA	2	6	1609808	1609813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541534
34118	NC_017327	CGC	2	6	1609832	1609837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541534
34119	NC_017327	CTGG	2	8	1609871	1609878	0 %	25 %	50 %	25 %	384541534
34120	NC_017327	CCG	2	6	1609929	1609934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541534
34121	NC_017327	CGC	2	6	1609969	1609974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541534
34122	NC_017327	GGC	2	6	1610012	1610017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541534
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34124	NC_017327	ATTG	2	8	1610297	1610304	25 %	50 %	25 %	0 %	384541535
34125	NC_017327	TGGT	2	8	1610440	1610447	0 %	50 %	50 %	0 %	384541535
34126	NC_017327	TCG	2	6	1610452	1610457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541535
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34128	NC_017327	CCG	2	6	1610518	1610523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541535
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34130	NC_017327	GCG	2	6	1610591	1610596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541535
34131	NC_017327	TCC	2	6	1610620	1610625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541535
34132	NC_017327	ATG	2	6	1610788	1610793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541535
34133	NC_017327	AT	3	6	1610835	1610840	50 %	50 %	0 %	0 %	384541535
34134	NC_017327	GAC	2	6	1610880	1610885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541535
34135	NC_017327	CGGCG	2	10	1610938	1610947	0 %	0 %	60 %	40 %	384541535
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34138	NC_017327	TGT	2	6	1611085	1611090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541535
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34145	NC_017327	TCGAGA	2	12	1611271	1611282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384541535
34146	NC_017327	TCG	2	6	1611295	1611300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541535
34147	NC_017327	AGC	2	6	1611301	1611306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541535
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34150	NC_017327	CGA	2	6	1611497	1611502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541535
34151	NC_017327	GATCCG	2	12	1611524	1611535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384541535
34152	NC_017327	CCG	2	6	1611563	1611568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541535
34153	NC_017327	CCGA	2	8	1611614	1611621	25 %	0 %	25 %	50 %	384541535
34154	NC_017327	TCG	2	6	1611691	1611696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541535
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34159	NC_017327	GCCG	2	8	1611915	1611922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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34163	NC_017327	C	6	6	1612058	1612063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34164	NC_017327	ACG	2	6	1612194	1612199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541536
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34201	NC_017327	TGCCGT	2	12	1613974	1613985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541537
34202	NC_017327	GCCTCG	2	12	1614029	1614040	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384541537
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34204	NC_017327	CGG	2	6	1614108	1614113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541538
34205	NC_017327	TGC	2	6	1614144	1614149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34206	NC_017327	GGC	2	6	1614202	1614207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34207	NC_017327	CTG	2	6	1614208	1614213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34208	NC_017327	GACT	2	8	1614266	1614273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34209	NC_017327	GCG	2	6	1614274	1614279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34210	NC_017327	GTGA	2	8	1614303	1614310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34211	NC_017327	GCT	2	6	1614335	1614340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34212	NC_017327	GGA	2	6	1614341	1614346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34213	NC_017327	TGA	2	6	1614348	1614353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541539
34214	NC_017327	CAG	2	6	1614428	1614433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541539
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34216	NC_017327	CTC	2	6	1614473	1614478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541539
34217	NC_017327	GAT	2	6	1614497	1614502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541539
34218	NC_017327	GCC	2	6	1614503	1614508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541539
34219	NC_017327	GAC	2	6	1614521	1614526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541539
34220	NC_017327	CCA	2	6	1614543	1614548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541539
34221	NC_017327	TTC	2	6	1614554	1614559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541539
34222	NC_017327	TCG	2	6	1614567	1614572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541539
34223	NC_017327	CGC	2	6	1614598	1614603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541539
34224	NC_017327	TCG	2	6	1614663	1614668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541539
34225	NC_017327	CAA	2	6	1614679	1614684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541539
34226	NC_017327	GCG	2	6	1614720	1614725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541539
34227	NC_017327	CGG	2	6	1614760	1614765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541539
34228	NC_017327	CGAG	2	8	1614825	1614832	25 %	0 %	50 %	25 %	384541539
34229	NC_017327	CGC	2	6	1614836	1614841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541539
34230	NC_017327	GGC	2	6	1614845	1614850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541539
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34347	NC_017327	CG	3	6	1619804	1619809	0 %	0 %	50 %	50 %	384541549
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34349	NC_017327	GCT	3	9	1620088	1620096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541549
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34351	NC_017327	TCA	2	6	1620180	1620185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34454	NC_017327	CGA	2	6	1625683	1625688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541554
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34459	NC_017327	GC	3	6	1626005	1626010	0 %	0 %	50 %	50 %	384541554
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34464	NC_017327	CCG	2	6	1626118	1626123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541554
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