MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_017327	CGC	2	6	1423724	1423729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541330
30002	NC_017327	CGC	2	6	1423745	1423750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541330
30003	NC_017327	CAT	2	6	1423776	1423781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541330
30004	NC_017327	CGC	2	6	1423854	1423859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541330
30005	NC_017327	CGT	2	6	1423874	1423879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541330
30006	NC_017327	GAT	2	6	1423899	1423904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541330
30007	NC_017327	ATC	2	6	1423927	1423932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541330
30008	NC_017327	CGC	2	6	1423952	1423957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541330
30009	NC_017327	CGC	2	6	1424001	1424006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541330
30010	NC_017327	CCG	2	6	1424012	1424017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541330
30011	NC_017327	CTC	2	6	1424058	1424063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541330
30012	NC_017327	ATG	2	6	1424142	1424147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30013	NC_017327	GGA	2	6	1424201	1424206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541331
30014	NC_017327	GAAGA	2	10	1424233	1424242	60 %	0 %	40 %	0 %	384541331
30015	NC_017327	CGG	2	6	1424246	1424251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541331
30016	NC_017327	GAT	2	6	1424268	1424273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541331
30017	NC_017327	CG	3	6	1424357	1424362	0 %	0 %	50 %	50 %	384541331
30018	NC_017327	TCG	2	6	1424425	1424430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541331
30019	NC_017327	AAG	2	6	1424433	1424438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541331
30020	NC_017327	GCGA	2	8	1424455	1424462	25 %	0 %	50 %	25 %	384541331
30021	NC_017327	GCT	3	9	1424480	1424488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541331
30022	NC_017327	CGA	2	6	1424537	1424542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541331
30023	NC_017327	GACA	2	8	1424545	1424552	50 %	0 %	25 %	25 %	384541331
30024	NC_017327	CG	3	6	1424569	1424574	0 %	0 %	50 %	50 %	384541331
30025	NC_017327	ATG	2	6	1424614	1424619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541331
30026	NC_017327	CGG	2	6	1424627	1424632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541331
30027	NC_017327	CGC	2	6	1424680	1424685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541331
30028	NC_017327	AGC	2	6	1424771	1424776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541331
30029	NC_017327	CGC	2	6	1424828	1424833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541331
30030	NC_017327	CGA	2	6	1424900	1424905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541331
30031	NC_017327	ACG	2	6	1424970	1424975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541332
30032	NC_017327	AGG	2	6	1425071	1425076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541332
30033	NC_017327	GGT	2	6	1425124	1425129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541332
30034	NC_017327	GCG	2	6	1425173	1425178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541332
30035	NC_017327	GTC	3	9	1425241	1425249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541332
30036	NC_017327	GCC	2	6	1425281	1425286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541332
30037	NC_017327	TGG	2	6	1425360	1425365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541332
30038	NC_017327	CTTC	2	8	1425366	1425373	0 %	50 %	0 %	50 %	384541332
30039	NC_017327	GCC	2	6	1425397	1425402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541332
30040	NC_017327	ACG	2	6	1425461	1425466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541332
30041	NC_017327	AGC	2	6	1425554	1425559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541332
30042	NC_017327	GGAC	2	8	1425621	1425628	25 %	0 %	50 %	25 %	384541332
30043	NC_017327	ATC	2	6	1425641	1425646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541332
30044	NC_017327	GTC	2	6	1425667	1425672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541332
30045	NC_017327	GAGG	2	8	1425673	1425680	25 %	0 %	75 %	0 %	384541332
30046	NC_017327	GCG	2	6	1425695	1425700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541332
30047	NC_017327	AAG	2	6	1425715	1425720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541332
30048	NC_017327	CGA	2	6	1425723	1425728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541332
30049	NC_017327	AGA	2	6	1425734	1425739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541332
30050	NC_017327	GGT	2	6	1425784	1425789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30051	NC_017327	CTT	2	6	1425799	1425804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30052	NC_017327	GCG	2	6	1425905	1425910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541333
30053	NC_017327	GAT	2	6	1425988	1425993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541333
30054	NC_017327	TGA	2	6	1426014	1426019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541333
30055	NC_017327	GCG	2	6	1426068	1426073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541333
30056	NC_017327	CAGCGC	2	12	1426105	1426116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384541333
30057	NC_017327	GC	3	6	1426155	1426160	0 %	0 %	50 %	50 %	384541333
30058	NC_017327	AAGG	2	8	1426177	1426184	50 %	0 %	50 %	0 %	384541333
30059	NC_017327	GCC	2	6	1426211	1426216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541333
30060	NC_017327	ATA	2	6	1426258	1426263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541333
30061	NC_017327	AGC	2	6	1426283	1426288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541333
30062	NC_017327	GCA	2	6	1426356	1426361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541333
30063	NC_017327	ATG	2	6	1426379	1426384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541333
30064	NC_017327	CCG	3	9	1426385	1426393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541333
30065	NC_017327	GGC	3	9	1426495	1426503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541334
30066	NC_017327	CGA	2	6	1426582	1426587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541334
30067	NC_017327	ATC	2	6	1426629	1426634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541334
30068	NC_017327	CAG	2	6	1426691	1426696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541334
30069	NC_017327	CGG	2	6	1426739	1426744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541334
30070	NC_017327	GCC	2	6	1426794	1426799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541334
30071	NC_017327	GCC	2	6	1426829	1426834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541334
30072	NC_017327	GCC	2	6	1426856	1426861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541334
30073	NC_017327	GCG	2	6	1426897	1426902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541334
30074	NC_017327	GAA	2	6	1426931	1426936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541334
30075	NC_017327	CAG	2	6	1426955	1426960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541334
30076	NC_017327	ACC	2	6	1426974	1426979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541334
30077	NC_017327	GCC	2	6	1427060	1427065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541334
30078	NC_017327	CGA	2	6	1427074	1427079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541334
30079	NC_017327	T	6	6	1427193	1427198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30080	NC_017327	CCA	2	6	1427297	1427302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541335
30081	NC_017327	GAT	2	6	1427321	1427326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541335
30082	NC_017327	CGAG	2	8	1427362	1427369	25 %	0 %	50 %	25 %	384541335
30083	NC_017327	TTC	2	6	1427393	1427398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541335
30084	NC_017327	CCGA	2	8	1427406	1427413	25 %	0 %	25 %	50 %	384541335
30085	NC_017327	CGC	2	6	1427470	1427475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541335
30086	NC_017327	GATCG	2	10	1427498	1427507	20 %	20 %	40 %	20 %	384541335
30087	NC_017327	CCG	2	6	1427541	1427546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541335
30088	NC_017327	ATG	2	6	1427553	1427558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541335
30089	NC_017327	TCG	2	6	1427598	1427603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541335
30090	NC_017327	CGCAAG	2	12	1427609	1427620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541335
30091	NC_017327	CCA	2	6	1427749	1427754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541335
30092	NC_017327	TC	3	6	1427760	1427765	0 %	50 %	0 %	50 %	384541335
30093	NC_017327	GTC	2	6	1427768	1427773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541335
30094	NC_017327	GCG	2	6	1428005	1428010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541336
30095	NC_017327	CAA	2	6	1428013	1428018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541336
30096	NC_017327	CAGC	2	8	1428028	1428035	25 %	0 %	25 %	50 %	384541336
30097	NC_017327	GGA	2	6	1428064	1428069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541336
30098	NC_017327	GGC	2	6	1428102	1428107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541336
30099	NC_017327	GCGAGG	2	12	1428123	1428134	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384541336
30100	NC_017327	GAT	2	6	1428157	1428162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541336
30101	NC_017327	GC	3	6	1428170	1428175	0 %	0 %	50 %	50 %	384541336
30102	NC_017327	TCCCT	2	10	1428261	1428270	0 %	40 %	0 %	60 %	384541336
30103	NC_017327	CGC	2	6	1428310	1428315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541336
30104	NC_017327	CT	3	6	1428350	1428355	0 %	50 %	0 %	50 %	384541336
30105	NC_017327	GCT	2	6	1428361	1428366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541336
30106	NC_017327	CT	3	6	1428380	1428385	0 %	50 %	0 %	50 %	384541336
30107	NC_017327	CGC	2	6	1428387	1428392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541336
30108	NC_017327	GCCA	2	8	1428449	1428456	25 %	0 %	25 %	50 %	384541336
30109	NC_017327	CGA	2	6	1428487	1428492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541336
30110	NC_017327	CAC	2	6	1428550	1428555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541336
30111	NC_017327	CGC	2	6	1428565	1428570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541336
30112	NC_017327	GCT	2	6	1428670	1428675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541336
30113	NC_017327	GAC	2	6	1428721	1428726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541336
30114	NC_017327	AACA	2	8	1428754	1428761	75 %	0 %	0 %	25 %	384541336
30115	NC_017327	TC	3	6	1428792	1428797	0 %	50 %	0 %	50 %	384541336
30116	NC_017327	GAT	2	6	1428799	1428804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541336
30117	NC_017327	ATC	2	6	1428843	1428848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30118	NC_017327	GCA	2	6	1428852	1428857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30119	NC_017327	TGAC	2	8	1428861	1428868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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30139	NC_017327	A	6	6	1429765	1429770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30465	NC_017327	TGA	2	6	1444866	1444871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541356
30466	NC_017327	GC	3	6	1444986	1444991	0 %	0 %	50 %	50 %	384541356
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30475	NC_017327	CG	3	6	1445571	1445576	0 %	0 %	50 %	50 %	384541357
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30480	NC_017327	T	6	6	1445815	1445820	0 %	100 %	0 %	0 %	384541357
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30484	NC_017327	GGC	2	6	1446068	1446073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541357
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30486	NC_017327	CG	3	6	1446143	1446148	0 %	0 %	50 %	50 %	384541357
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30488	NC_017327	CCG	2	6	1446213	1446218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541357
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30490	NC_017327	GGC	2	6	1446346	1446351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541357
30491	NC_017327	TGA	2	6	1446364	1446369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541357
30492	NC_017327	CCG	2	6	1446383	1446388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541357
30493	NC_017327	AAACG	2	10	1446540	1446549	60 %	0 %	20 %	20 %	384541357
30494	NC_017327	AGGA	2	8	1446674	1446681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30495	NC_017327	CGG	2	6	1446700	1446705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30496	NC_017327	CGGC	2	8	1446766	1446773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30497	NC_017327	GTG	2	6	1446789	1446794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541358
30498	NC_017327	TCGACC	2	12	1446843	1446854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384541358
30499	NC_017327	CTTC	2	8	1446859	1446866	0 %	50 %	0 %	50 %	384541358
30500	NC_017327	GGC	2	6	1446885	1446890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541358

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