MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25352	NC_017327	GGA	2	6	1202476	1202481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25353	NC_017327	GCA	4	12	1202612	1202623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541110
25354	NC_017327	CG	3	6	1202649	1202654	0 %	0 %	50 %	50 %	384541110
25355	NC_017327	GGT	2	6	1202718	1202723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541110
25356	NC_017327	TCT	2	6	1202828	1202833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541110
25357	NC_017327	GTG	2	6	1202834	1202839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541110
25358	NC_017327	TGCGC	2	10	1202937	1202946	0 %	20 %	40 %	40 %	384541110
25359	NC_017327	AGA	2	6	1203020	1203025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541110
25360	NC_017327	TAC	2	6	1203045	1203050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541110
25361	NC_017327	GCGGA	2	10	1203067	1203076	20 %	0 %	60 %	20 %	384541110
25362	NC_017327	GCT	2	6	1203106	1203111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541110
25363	NC_017327	CGC	3	9	1203195	1203203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541110
25364	NC_017327	GC	3	6	1203202	1203207	0 %	0 %	50 %	50 %	384541110
25365	NC_017327	CGCTTG	2	12	1203260	1203271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541110
25366	NC_017327	GC	3	6	1203277	1203282	0 %	0 %	50 %	50 %	384541110
25367	NC_017327	ACG	2	6	1203284	1203289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541110
25368	NC_017327	TCG	2	6	1203302	1203307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541110
25369	NC_017327	TTC	2	6	1203355	1203360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541110
25370	NC_017327	CGA	2	6	1203381	1203386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541110
25371	NC_017327	CTT	2	6	1203399	1203404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541110
25372	NC_017327	TCG	2	6	1203481	1203486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25373	NC_017327	TGA	2	6	1203500	1203505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25374	NC_017327	TCG	2	6	1203517	1203522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25375	NC_017327	GGA	2	6	1203624	1203629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25376	NC_017327	CCA	2	6	1203663	1203668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541111
25377	NC_017327	CGA	2	6	1203710	1203715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541111
25378	NC_017327	TCT	2	6	1203735	1203740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541111
25379	NC_017327	CGCT	2	8	1203825	1203832	0 %	25 %	25 %	50 %	384541111
25380	NC_017327	CG	3	6	1203845	1203850	0 %	0 %	50 %	50 %	384541111
25381	NC_017327	GGC	2	6	1203862	1203867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541111
25382	NC_017327	CGGT	2	8	1203882	1203889	0 %	25 %	50 %	25 %	384541111
25383	NC_017327	ATT	2	6	1203929	1203934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541111
25384	NC_017327	CGC	2	6	1203940	1203945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541111
25385	NC_017327	TCT	2	6	1203964	1203969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541111
25386	NC_017327	GGC	2	6	1204040	1204045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541111
25387	NC_017327	CAT	2	6	1204052	1204057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541111
25388	NC_017327	CCT	2	6	1204099	1204104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541111
25389	NC_017327	CGA	2	6	1204113	1204118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541111
25390	NC_017327	CAG	2	6	1204181	1204186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541111
25391	NC_017327	GA	3	6	1204296	1204301	50 %	0 %	50 %	0 %	384541111
25392	NC_017327	GTC	2	6	1204340	1204345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541111
25393	NC_017327	CTC	2	6	1204349	1204354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541111
25394	NC_017327	TCG	2	6	1204377	1204382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541111
25395	NC_017327	GCG	2	6	1204490	1204495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541111
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25397	NC_017327	ATG	2	6	1204643	1204648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541111
25398	NC_017327	TGG	2	6	1204650	1204655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541111
25399	NC_017327	GGC	2	6	1204663	1204668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541111
25400	NC_017327	GGC	2	6	1204804	1204809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541112
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25402	NC_017327	TGA	2	6	1205064	1205069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541112
25403	NC_017327	CAT	2	6	1205112	1205117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541112
25404	NC_017327	GC	4	8	1205190	1205197	0 %	0 %	50 %	50 %	384541112
25405	NC_017327	CAC	2	6	1205202	1205207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541112
25406	NC_017327	TCA	2	6	1205216	1205221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541112
25407	NC_017327	GC	3	6	1205222	1205227	0 %	0 %	50 %	50 %	384541112
25408	NC_017327	TGT	2	6	1205339	1205344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541112
25409	NC_017327	TGG	2	6	1205426	1205431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541112
25410	NC_017327	CTG	2	6	1205509	1205514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25411	NC_017327	CGAG	2	8	1205518	1205525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25412	NC_017327	GC	3	6	1205545	1205550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25413	NC_017327	CGA	2	6	1205580	1205585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25414	NC_017327	GCG	3	9	1205633	1205641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541113
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25416	NC_017327	CG	3	6	1205752	1205757	0 %	0 %	50 %	50 %	384541113
25417	NC_017327	TAT	2	6	1205767	1205772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541113
25418	NC_017327	CCA	2	6	1205786	1205791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541113
25419	NC_017327	TCG	2	6	1205799	1205804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541113
25420	NC_017327	ATC	2	6	1205820	1205825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541113
25421	NC_017327	CCA	2	6	1205849	1205854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541113
25422	NC_017327	CATC	2	8	1205872	1205879	25 %	25 %	0 %	50 %	384541113
25423	NC_017327	CGG	2	6	1205928	1205933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541113
25424	NC_017327	TCC	2	6	1205940	1205945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541113
25425	NC_017327	AGC	2	6	1205970	1205975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541113
25426	NC_017327	ATC	2	6	1205991	1205996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541113
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25428	NC_017327	TGT	2	6	1206082	1206087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541113
25429	NC_017327	GCCG	2	8	1206116	1206123	0 %	0 %	50 %	50 %	384541113
25430	NC_017327	GCT	2	6	1206130	1206135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541113
25431	NC_017327	TA	3	6	1206137	1206142	50 %	50 %	0 %	0 %	384541113
25432	NC_017327	TCT	2	6	1206163	1206168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541113
25433	NC_017327	CACGA	2	10	1206194	1206203	40 %	0 %	20 %	40 %	384541113
25434	NC_017327	CGC	2	6	1206244	1206249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541113
25435	NC_017327	GCCG	2	8	1206254	1206261	0 %	0 %	50 %	50 %	384541113
25436	NC_017327	GACGAT	2	12	1206278	1206289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384541113
25437	NC_017327	TCC	2	6	1206333	1206338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541113
25438	NC_017327	TCC	2	6	1206414	1206419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541113
25439	NC_017327	T	6	6	1206438	1206443	0 %	100 %	0 %	0 %	384541113
25440	NC_017327	GTC	2	6	1206446	1206451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541113
25441	NC_017327	CTC	2	6	1206473	1206478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25442	NC_017327	GCG	2	6	1206558	1206563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25443	NC_017327	CTC	2	6	1206573	1206578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541114
25444	NC_017327	CGA	2	6	1206663	1206668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541114
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25446	NC_017327	TGC	2	6	1206833	1206838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25447	NC_017327	CGA	2	6	1206843	1206848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25448	NC_017327	GGTC	2	8	1206852	1206859	0 %	25 %	50 %	25 %	384541114
25449	NC_017327	CGG	2	6	1206873	1206878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541114
25450	NC_017327	CAC	2	6	1206901	1206906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541114
25451	NC_017327	GAT	2	6	1206913	1206918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541114
25452	NC_017327	ATC	2	6	1206953	1206958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541114
25453	NC_017327	TCA	2	6	1206966	1206971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541114
25454	NC_017327	GCG	2	6	1207012	1207017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541114
25455	NC_017327	GCCG	2	8	1207036	1207043	0 %	0 %	50 %	50 %	384541114
25456	NC_017327	ATC	2	6	1207049	1207054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541114
25457	NC_017327	CTG	2	6	1207087	1207092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25458	NC_017327	CGG	2	6	1207101	1207106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541114
25459	NC_017327	TTG	2	6	1207220	1207225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541114
25460	NC_017327	CG	3	6	1207241	1207246	0 %	0 %	50 %	50 %	384541114
25461	NC_017327	CGA	2	6	1207296	1207301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25462	NC_017327	TTCA	2	8	1207342	1207349	25 %	50 %	0 %	25 %	384541114
25463	NC_017327	CGG	2	6	1207392	1207397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541114
25464	NC_017327	CAA	2	6	1207416	1207421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541114
25465	NC_017327	TGCCTC	2	12	1207423	1207434	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384541114
25466	NC_017327	CGG	2	6	1207451	1207456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541114
25467	NC_017327	TGC	2	6	1207468	1207473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25468	NC_017327	TCG	2	6	1207487	1207492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25469	NC_017327	GATG	2	8	1207616	1207623	25 %	25 %	50 %	0 %	384541114
25470	NC_017327	AGA	2	6	1207629	1207634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541114
25471	NC_017327	AGGC	2	8	1207664	1207671	25 %	0 %	50 %	25 %	384541114
25472	NC_017327	GCG	2	6	1207747	1207752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541114
25473	NC_017327	AGC	2	6	1207778	1207783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541114
25474	NC_017327	CGC	2	6	1207913	1207918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541115
25475	NC_017327	TCG	2	6	1207941	1207946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541115
25476	NC_017327	AGCG	3	12	1207977	1207988	25 %	0 %	50 %	25 %	384541115
25477	NC_017327	CGA	2	6	1208098	1208103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541115
25478	NC_017327	AAGACG	2	12	1208196	1208207	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384541115
25479	NC_017327	ATC	2	6	1208208	1208213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541115
25480	NC_017327	TGA	2	6	1208248	1208253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541115
25481	NC_017327	CGG	2	6	1208255	1208260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541115
25482	NC_017327	GCTG	2	8	1208336	1208343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25483	NC_017327	TAA	2	6	1208462	1208467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25484	NC_017327	TCA	2	6	1208492	1208497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25485	NC_017327	ACG	2	6	1208540	1208545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25486	NC_017327	TTGA	2	8	1208566	1208573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25487	NC_017327	CTG	2	6	1208593	1208598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25488	NC_017327	GCG	2	6	1208611	1208616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25489	NC_017327	ATC	2	6	1208628	1208633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25490	NC_017327	GAC	2	6	1208804	1208809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541116
25491	NC_017327	CAT	2	6	1208814	1208819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541116
25492	NC_017327	CGC	2	6	1208848	1208853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541116
25493	NC_017327	CG	3	6	1208887	1208892	0 %	0 %	50 %	50 %	384541116
25494	NC_017327	ATT	2	6	1208951	1208956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541116
25495	NC_017327	TGC	2	6	1209001	1209006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541116
25496	NC_017327	GGC	2	6	1209040	1209045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541116
25497	NC_017327	GCT	2	6	1209067	1209072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541116
25498	NC_017327	TCG	2	6	1209078	1209083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541116
25499	NC_017327	GGT	2	6	1209127	1209132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541116
25500	NC_017327	GATC	2	8	1209149	1209156	25 %	25 %	25 %	25 %	384541116

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