MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

< Previous12...3233343536373839404142...6970Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017327	TGA	2	6	850331	850336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540725
18003	NC_017327	TCC	2	6	850374	850379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540725
18004	NC_017327	AGA	2	6	850385	850390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540725
18005	NC_017327	CGT	2	6	850418	850423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540725
18006	NC_017327	GAA	2	6	850476	850481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540725
18007	NC_017327	ACC	2	6	850595	850600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540725
18008	NC_017327	AGT	2	6	850661	850666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540725
18009	NC_017327	GGCC	2	8	850739	850746	0 %	0 %	50 %	50 %	384540725
18010	NC_017327	GCG	2	6	850753	850758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540725
18011	NC_017327	CGA	2	6	850778	850783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540725
18012	NC_017327	TCC	2	6	851037	851042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18013	NC_017327	CCCG	2	8	851055	851062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18014	NC_017327	CGG	2	6	851071	851076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_017327	TCC	2	6	851090	851095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18016	NC_017327	GCG	2	6	851110	851115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_017327	TCC	3	9	851118	851126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18018	NC_017327	GCA	2	6	851168	851173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540726
18019	NC_017327	GTA	2	6	851182	851187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540726
18020	NC_017327	TCG	2	6	851217	851222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540726
18021	NC_017327	CAT	2	6	851335	851340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18022	NC_017327	GCGG	2	8	851366	851373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18023	NC_017327	CCG	2	6	851412	851417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540727
18024	NC_017327	GCT	2	6	851429	851434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540727
18025	NC_017327	GCC	2	6	851435	851440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540727
18026	NC_017327	GC	3	6	851457	851462	0 %	0 %	50 %	50 %	384540727
18027	NC_017327	GCT	2	6	851541	851546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540727
18028	NC_017327	CCTG	2	8	851648	851655	0 %	25 %	25 %	50 %	384540727
18029	NC_017327	CGAG	2	8	851673	851680	25 %	0 %	50 %	25 %	384540727
18030	NC_017327	CAC	2	6	851815	851820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540727
18031	NC_017327	GCC	2	6	851834	851839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540727
18032	NC_017327	GC	3	6	851867	851872	0 %	0 %	50 %	50 %	384540727
18033	NC_017327	CTCA	2	8	851896	851903	25 %	25 %	0 %	50 %	384540727
18034	NC_017327	TGCGGG	2	12	851958	851969	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384540727
18035	NC_017327	CGG	2	6	851985	851990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540727
18036	NC_017327	GGA	2	6	851995	852000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540727
18037	NC_017327	GGC	2	6	852076	852081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_017327	GGC	2	6	852086	852091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540728
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18040	NC_017327	GCC	2	6	852116	852121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540728
18041	NC_017327	GAG	2	6	852125	852130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540728
18042	NC_017327	CGT	2	6	852147	852152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540728
18043	NC_017327	GGA	2	6	852174	852179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540728
18044	NC_017327	GCGG	2	8	852211	852218	0 %	0 %	75 %	25 %	384540728
18045	NC_017327	CCG	2	6	852275	852280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540728
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18048	NC_017327	GCCC	2	8	852384	852391	0 %	0 %	25 %	75 %	384540728
18049	NC_017327	GAC	2	6	852394	852399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540728
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18051	NC_017327	GGC	3	9	852424	852432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540728
18052	NC_017327	CCG	2	6	852449	852454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540728
18053	NC_017327	CAT	3	9	852543	852551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540728
18054	NC_017327	A	6	6	852606	852611	100 %	0 %	0 %	0 %	384540728
18055	NC_017327	GGA	2	6	852651	852656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540728
18056	NC_017327	GAC	2	6	852699	852704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540728
18057	NC_017327	TG	3	6	852709	852714	0 %	50 %	50 %	0 %	384540728
18058	NC_017327	CGG	2	6	852777	852782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540728
18059	NC_017327	ACG	3	9	852838	852846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540728
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18062	NC_017327	TGC	2	6	852875	852880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540728
18063	NC_017327	GC	3	6	852910	852915	0 %	0 %	50 %	50 %	384540728
18064	NC_017327	CCGG	2	8	852998	853005	0 %	0 %	50 %	50 %	384540728
18065	NC_017327	GGA	2	6	853053	853058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540728
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18074	NC_017327	ATC	2	6	853476	853481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540729
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18088	NC_017327	G	6	6	854019	854024	0 %	0 %	100 %	0 %	384540729
18089	NC_017327	GGA	2	6	854039	854044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540729
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18091	NC_017327	GCAG	2	8	854134	854141	25 %	0 %	50 %	25 %	384540729
18092	NC_017327	GGA	2	6	854198	854203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18112	NC_017327	GC	3	6	855105	855110	0 %	0 %	50 %	50 %	384540731
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18120	NC_017327	CGG	2	6	855395	855400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540731
18121	NC_017327	TCGAT	2	10	855487	855496	20 %	40 %	20 %	20 %	384540731
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18123	NC_017327	GAT	2	6	855545	855550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540731
18124	NC_017327	CGG	2	6	855556	855561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540731
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18136	NC_017327	GTA	2	6	855904	855909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18138	NC_017327	GCGT	2	8	855964	855971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18139	NC_017327	TGA	2	6	856002	856007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18142	NC_017327	TAT	2	6	856202	856207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18143	NC_017327	GAG	2	6	856386	856391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18144	NC_017327	GGA	2	6	856489	856494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18173	NC_017327	ACA	2	6	858071	858076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18177	NC_017327	GTC	2	6	858218	858223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18220	NC_017327	CGC	2	6	860538	860543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18231	NC_017327	TC	3	6	861020	861025	0 %	50 %	0 %	50 %	384540737
18232	NC_017327	TCG	2	6	861036	861041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540737
18233	NC_017327	CAGC	2	8	861045	861052	25 %	0 %	25 %	50 %	384540737
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18236	NC_017327	GC	4	8	861187	861194	0 %	0 %	50 %	50 %	384540737
18237	NC_017327	GCG	2	6	861225	861230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540737
18238	NC_017327	GAC	2	6	861282	861287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540737
18239	NC_017327	CGC	2	6	861332	861337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18240	NC_017327	GAC	2	6	861435	861440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540738
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18355	NC_017327	CGAT	2	8	866816	866823	25 %	25 %	25 %	25 %	384540745
18356	NC_017327	CT	3	6	866879	866884	0 %	50 %	0 %	50 %	384540745
18357	NC_017327	TCT	2	6	866888	866893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540745
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18450	NC_017327	TGA	2	6	870999	871004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540750
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18453	NC_017327	TTC	2	6	871139	871144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18466	NC_017327	AACC	2	8	871787	871794	50 %	0 %	0 %	50 %	384540751
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18475	NC_017327	AAGCG	2	10	872294	872303	40 %	0 %	40 %	20 %	384540751
18476	NC_017327	GGCC	2	8	872332	872339	0 %	0 %	50 %	50 %	384540751
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