MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017327	TCG	2	6	617838	617843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13002	NC_017327	CGCTT	2	10	617849	617858	0 %	40 %	20 %	40 %	384540501
13003	NC_017327	CA	3	6	617879	617884	50 %	0 %	0 %	50 %	384540501
13004	NC_017327	GGGGA	2	10	617888	617897	20 %	0 %	80 %	0 %	384540501
13005	NC_017327	TCG	2	6	617904	617909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13006	NC_017327	CGGC	2	8	617913	617920	0 %	0 %	50 %	50 %	384540501
13007	NC_017327	CATG	2	8	617953	617960	25 %	25 %	25 %	25 %	384540501
13008	NC_017327	GCACG	2	10	618010	618019	20 %	0 %	40 %	40 %	384540501
13009	NC_017327	TGA	2	6	618081	618086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540501
13010	NC_017327	ACG	2	6	618087	618092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13011	NC_017327	GC	3	6	618147	618152	0 %	0 %	50 %	50 %	384540501
13012	NC_017327	GAT	2	6	618238	618243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540501
13013	NC_017327	TGC	2	6	618259	618264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13014	NC_017327	CGC	2	6	618292	618297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540501
13015	NC_017327	CGG	2	6	618322	618327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540501
13016	NC_017327	GCC	2	6	618371	618376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540501
13017	NC_017327	GGC	2	6	618377	618382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540501
13018	NC_017327	GAC	2	6	618389	618394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13019	NC_017327	ACC	2	6	618404	618409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540501
13020	NC_017327	CG	4	8	618424	618431	0 %	0 %	50 %	50 %	384540501
13021	NC_017327	TCGGC	2	10	618462	618471	0 %	20 %	40 %	40 %	384540501
13022	NC_017327	GTG	2	6	618596	618601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540501
13023	NC_017327	CGCCA	2	10	618602	618611	20 %	0 %	20 %	60 %	384540501
13024	NC_017327	GCA	2	6	618667	618672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13025	NC_017327	CGC	2	6	618713	618718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540501
13026	NC_017327	AGCG	2	8	618838	618845	25 %	0 %	50 %	25 %	384540501
13027	NC_017327	TCG	2	6	618911	618916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13028	NC_017327	CCA	2	6	618960	618965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540501
13029	NC_017327	GCG	2	6	618996	619001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540501
13030	NC_017327	TGG	2	6	619044	619049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540501
13031	NC_017327	CGG	2	6	619066	619071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540501
13032	NC_017327	CCA	2	6	619147	619152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540501
13033	NC_017327	TCG	2	6	619158	619163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13034	NC_017327	AGG	2	6	619209	619214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540501
13035	NC_017327	GCG	2	6	619218	619223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540501
13036	NC_017327	CGG	2	6	619240	619245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540501
13037	NC_017327	TCG	2	6	619260	619265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13038	NC_017327	GC	3	6	619297	619302	0 %	0 %	50 %	50 %	384540501
13039	NC_017327	GTC	2	6	619326	619331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13040	NC_017327	TAA	2	6	619366	619371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384540501
13041	NC_017327	GCA	2	6	619381	619386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13042	NC_017327	CTG	2	6	619391	619396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13043	NC_017327	TGG	2	6	619401	619406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540501
13044	NC_017327	GAC	2	6	619462	619467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540501
13045	NC_017327	TCGT	2	8	619476	619483	0 %	50 %	25 %	25 %	384540501
13046	NC_017327	GGT	2	6	619511	619516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_017327	GTT	2	6	619547	619552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_017327	GGA	2	6	619567	619572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_017327	AGC	2	6	619627	619632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_017327	TGC	2	6	619664	619669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_017327	CG	3	6	619728	619733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_017327	GGA	2	6	619826	619831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_017327	TG	3	6	619907	619912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_017327	CGT	2	6	619913	619918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_017327	CCT	2	6	619928	619933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13056	NC_017327	TGC	2	6	619946	619951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_017327	AGA	2	6	619979	619984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017327	GCC	2	6	620011	620016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_017327	GCA	2	6	620049	620054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_017327	CGG	2	6	620124	620129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_017327	GC	3	6	620137	620142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_017327	CTG	2	6	620316	620321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_017327	GCT	2	6	620358	620363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540502
13064	NC_017327	TCA	2	6	620418	620423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540502
13065	NC_017327	CCCG	2	8	620516	620523	0 %	0 %	25 %	75 %	384540502
13066	NC_017327	ATG	2	6	620547	620552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540502
13067	NC_017327	CGT	2	6	620554	620559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540502
13068	NC_017327	GATG	2	8	620578	620585	25 %	25 %	50 %	0 %	384540502
13069	NC_017327	AAG	2	6	620586	620591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540502
13070	NC_017327	GGT	2	6	620614	620619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540502
13071	NC_017327	CG	4	8	620629	620636	0 %	0 %	50 %	50 %	384540502
13072	NC_017327	GC	3	6	620655	620660	0 %	0 %	50 %	50 %	384540502
13073	NC_017327	CGG	2	6	620662	620667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540502
13074	NC_017327	GGCT	2	8	620700	620707	0 %	25 %	50 %	25 %	384540502
13075	NC_017327	CTC	2	6	620714	620719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540502
13076	NC_017327	GGAC	2	8	620763	620770	25 %	0 %	50 %	25 %	384540502
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13081	NC_017327	AAGG	2	8	621229	621236	50 %	0 %	50 %	0 %	384540502
13082	NC_017327	ACT	2	6	621262	621267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_017327	ATA	2	6	621326	621331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_017327	TCG	2	6	621369	621374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_017327	ATTG	2	8	621404	621411	25 %	50 %	25 %	0 %	384540503
13086	NC_017327	CGGT	2	8	621461	621468	0 %	25 %	50 %	25 %	384540503
13087	NC_017327	CGA	2	6	621560	621565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_017327	CAT	2	6	621606	621611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_017327	TGG	2	6	621629	621634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_017327	CAC	2	6	621715	621720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13091	NC_017327	TGT	2	6	621758	621763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_017327	AC	3	6	621769	621774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13093	NC_017327	CAA	2	6	621841	621846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540504
13094	NC_017327	GAA	2	6	621943	621948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540504
13095	NC_017327	ACTGGC	2	12	621985	621996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384540504
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13097	NC_017327	TCG	2	6	622032	622037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540504
13098	NC_017327	GCA	2	6	622047	622052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540504
13099	NC_017327	AGG	2	6	622202	622207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_017327	TCGGCA	2	12	622308	622319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384540505
13101	NC_017327	CGAT	2	8	622329	622336	25 %	25 %	25 %	25 %	384540505
13102	NC_017327	GCG	2	6	622342	622347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540505
13103	NC_017327	TGGG	2	8	622383	622390	0 %	25 %	75 %	0 %	384540505
13104	NC_017327	GCT	2	6	622429	622434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540505
13105	NC_017327	TGCCGC	2	12	622436	622447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384540505
13106	NC_017327	GAGC	2	8	622486	622493	25 %	0 %	50 %	25 %	384540505
13107	NC_017327	A	7	7	622556	622562	100 %	0 %	0 %	0 %	384540505
13108	NC_017327	CGCC	2	8	622599	622606	0 %	0 %	25 %	75 %	384540505
13109	NC_017327	CCCG	2	8	622645	622652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13110	NC_017327	TGC	2	6	622676	622681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_017327	ATG	2	6	622736	622741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017327	GCT	2	6	622794	622799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_017327	GTG	3	9	622813	622821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_017327	ACGA	2	8	622873	622880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_017327	CGT	2	6	622901	622906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_017327	GTC	2	6	622920	622925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_017327	TGA	2	6	622972	622977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017327	CGGG	2	8	622979	622986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13119	NC_017327	GCG	2	6	623078	623083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_017327	CGT	2	6	623188	623193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_017327	AAC	2	6	623203	623208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_017327	GACA	2	8	623236	623243	50 %	0 %	25 %	25 %	384540506
13123	NC_017327	GCA	2	6	623357	623362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540506
13124	NC_017327	CGC	2	6	623409	623414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540506
13125	NC_017327	GC	3	6	623419	623424	0 %	0 %	50 %	50 %	384540506
13126	NC_017327	GAA	2	6	623437	623442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540506
13127	NC_017327	GATCG	2	10	623483	623492	20 %	20 %	40 %	20 %	384540506
13128	NC_017327	TGG	2	6	623499	623504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540506
13129	NC_017327	GAT	2	6	623512	623517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540506
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13131	NC_017327	GCTCT	2	10	623720	623729	0 %	40 %	20 %	40 %	384540506
13132	NC_017327	CGA	2	6	623905	623910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540506
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13134	NC_017327	AC	3	6	624111	624116	50 %	0 %	0 %	50 %	384540506
13135	NC_017327	TTC	2	6	624128	624133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540506
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13139	NC_017327	CTC	2	6	624538	624543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540507
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13145	NC_017327	ATAC	2	8	625048	625055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13146	NC_017327	CGC	2	6	625075	625080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13147	NC_017327	GAT	3	9	625084	625092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13149	NC_017327	TGG	2	6	625122	625127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13150	NC_017327	CGT	2	6	625145	625150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13151	NC_017327	GCA	2	6	625163	625168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13152	NC_017327	AGAT	2	8	625186	625193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_017327	CAT	2	6	625218	625223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13154	NC_017327	TG	3	6	625229	625234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13155	NC_017327	TC	3	6	625235	625240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13156	NC_017327	GCC	2	6	625260	625265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13157	NC_017327	GAT	2	6	625587	625592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540508
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13159	NC_017327	AGT	3	9	625599	625607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13172	NC_017327	TA	3	6	626125	626130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13173	NC_017327	GAT	2	6	626286	626291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540510
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13230	NC_017327	GCC	2	6	628883	628888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13231	NC_017327	CTGAA	2	10	628927	628936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13232	NC_017327	AGCAG	2	10	629035	629044	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13233	NC_017327	CGT	2	6	629128	629133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13235	NC_017327	AAG	2	6	629274	629279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_017327	TCGCGC	2	12	629332	629343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13237	NC_017327	TCG	2	6	629375	629380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_017327	GAT	2	6	629539	629544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13239	NC_017327	AGG	2	6	629548	629553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13240	NC_017327	TGC	2	6	629592	629597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540514
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13243	NC_017327	GGC	2	6	629667	629672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540514
13244	NC_017327	GCCG	2	8	629697	629704	0 %	0 %	50 %	50 %	384540514
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13246	NC_017327	AG	3	6	629730	629735	50 %	0 %	50 %	0 %	384540514
13247	NC_017327	CTA	2	6	629826	629831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540514
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13361	NC_017327	CGT	2	6	635025	635030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540519
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13364	NC_017327	GC	3	6	635179	635184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13365	NC_017327	CGAG	2	8	635256	635263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13366	NC_017327	GCC	2	6	635292	635297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540520
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13491	NC_017327	GCA	2	6	641693	641698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540525
13492	NC_017327	CGT	2	6	641755	641760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540525
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13495	NC_017327	GCA	2	6	641891	641896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_017327	GTC	2	6	641929	641934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540526
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