MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017327	TGA	2	6	265144	265149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540109
5502	NC_017327	TCG	2	6	265170	265175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540109
5503	NC_017327	TTG	2	6	265224	265229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540109
5504	NC_017327	CCT	2	6	265284	265289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_017327	TCT	3	9	265324	265332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017327	CTT	2	6	265333	265338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017327	GCC	2	6	265435	265440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_017327	GAG	2	6	265454	265459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017327	GGA	2	6	265511	265516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017327	CCGG	2	8	265688	265695	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5511	NC_017327	GC	4	8	265721	265728	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5512	NC_017327	CG	3	6	265953	265958	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5513	NC_017327	GCG	2	6	265991	265996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5514	NC_017327	GA	3	6	266014	266019	50 %	0 %	50 %	0 %	384540110
5515	NC_017327	TGC	2	6	266036	266041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5516	NC_017327	GA	3	6	266053	266058	50 %	0 %	50 %	0 %	384540110
5517	NC_017327	TCG	2	6	266071	266076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5518	NC_017327	CG	4	8	266081	266088	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5519	NC_017327	AAC	2	6	266152	266157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540110
5520	NC_017327	TTG	2	6	266176	266181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540110
5521	NC_017327	CATC	2	8	266198	266205	25 %	25 %	0 %	50 %	384540110
5522	NC_017327	CGTC	2	8	266285	266292	0 %	25 %	25 %	50 %	384540110
5523	NC_017327	GCC	2	6	266299	266304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540110
5524	NC_017327	TCT	2	6	266324	266329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540110
5525	NC_017327	CGG	2	6	266367	266372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5526	NC_017327	TCG	2	6	266380	266385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5527	NC_017327	CCG	2	6	266386	266391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540110
5528	NC_017327	CAG	2	6	266412	266417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5529	NC_017327	CGG	2	6	266503	266508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5530	NC_017327	CCT	2	6	266582	266587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540110
5531	NC_017327	ACCCGC	2	12	266680	266691	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384540110
5532	NC_017327	TCG	2	6	266734	266739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5533	NC_017327	GCA	2	6	266807	266812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5534	NC_017327	GGC	2	6	266826	266831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5535	NC_017327	GCG	2	6	266915	266920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5536	NC_017327	CAT	2	6	266937	266942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540110
5537	NC_017327	AGC	3	9	266989	266997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5538	NC_017327	AT	3	6	267075	267080	50 %	50 %	0 %	0 %	384540110
5539	NC_017327	AAT	2	6	267083	267088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384540110
5540	NC_017327	CAC	2	6	267180	267185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540110
5541	NC_017327	GCCTG	2	10	267189	267198	0 %	20 %	40 %	40 %	384540110
5542	NC_017327	TTG	2	6	267220	267225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540110
5543	NC_017327	AAG	2	6	267250	267255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540110
5544	NC_017327	GC	4	8	267274	267281	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5545	NC_017327	GCC	2	6	267336	267341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540110
5546	NC_017327	TCG	2	6	267397	267402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5547	NC_017327	GAA	2	6	267495	267500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540110
5548	NC_017327	AGCGC	2	10	267512	267521	20 %	0 %	40 %	40 %	384540110
5549	NC_017327	CGC	2	6	267524	267529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540110
5550	NC_017327	GAA	2	6	267570	267575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540110
5551	NC_017327	GC	3	6	267600	267605	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5552	NC_017327	GGC	2	6	267674	267679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5553	NC_017327	AGC	2	6	267682	267687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5554	NC_017327	GAT	2	6	267761	267766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540110
5555	NC_017327	GGGA	2	8	267779	267786	25 %	0 %	75 %	0 %	384540110
5556	NC_017327	GTC	2	6	267885	267890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5557	NC_017327	CCT	2	6	267929	267934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540110
5558	NC_017327	GGC	2	6	268052	268057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540110
5559	NC_017327	CCG	2	6	268089	268094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540110
5560	NC_017327	CG	3	6	268093	268098	0 %	0 %	50 %	50 %	384540110
5561	NC_017327	CGT	2	6	268123	268128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5562	NC_017327	AGC	2	6	268270	268275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5563	NC_017327	CCA	2	6	268286	268291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540110
5564	NC_017327	TGC	2	6	268325	268330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540110
5565	NC_017327	GTG	2	6	268363	268368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540110
5566	NC_017327	GAT	2	6	268414	268419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017327	TGT	2	6	268534	268539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017327	ATT	2	6	268543	268548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017327	GTT	2	6	268552	268557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017327	CTTT	2	8	268620	268627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_017327	GAC	2	6	268650	268655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017327	GTC	2	6	268719	268724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_017327	GTG	2	6	268785	268790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017327	TCGG	2	8	268814	268821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_017327	CGC	2	6	268837	268842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_017327	AGG	2	6	268961	268966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017327	GTG	2	6	268980	268985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017327	CGT	2	6	269098	269103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540111
5579	NC_017327	GGA	2	6	269221	269226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017327	ATG	2	6	269231	269236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017327	GC	3	6	269260	269265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_017327	TGT	2	6	269344	269349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017327	GC	4	8	269394	269401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_017327	CTTT	2	8	269463	269470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_017327	GCG	2	6	269536	269541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540112
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5587	NC_017327	ATCA	2	8	269954	269961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_017327	GAG	2	6	270012	270017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017327	CAA	2	6	270035	270040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_017327	AACC	2	8	270071	270078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_017327	AGA	2	6	270104	270109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017327	GTC	2	6	270155	270160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_017327	GCC	2	6	270258	270263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_017327	TCA	2	6	270264	270269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_017327	GCATTC	2	12	270327	270338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_017327	CAT	2	6	270406	270411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540113
5597	NC_017327	GGA	2	6	270481	270486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540113
5598	NC_017327	GCC	2	6	270530	270535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540113
5599	NC_017327	CGC	2	6	270537	270542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540113
5600	NC_017327	CAG	2	6	270593	270598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017327	GAA	2	6	270628	270633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017327	ATC	2	6	270749	270754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_017327	GAG	2	6	270860	270865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017327	GAT	2	6	270911	270916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017327	CTT	2	6	270963	270968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_017327	GCC	2	6	271026	271031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_017327	TGG	2	6	271282	271287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017327	CAA	2	6	271293	271298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_017327	GCC	2	6	271325	271330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_017327	GCC	2	6	271350	271355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_017327	GCT	2	6	271394	271399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_017327	GCC	2	6	271478	271483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_017327	ATT	2	6	271504	271509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384540114
5614	NC_017327	CGGC	2	8	271526	271533	0 %	0 %	50 %	50 %	384540114
5615	NC_017327	GCC	2	6	271573	271578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540114
5616	NC_017327	CGG	2	6	271592	271597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540114
5617	NC_017327	TCG	2	6	271667	271672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540114
5618	NC_017327	CGTG	2	8	271763	271770	0 %	25 %	50 %	25 %	384540114
5619	NC_017327	TCACG	2	10	271796	271805	20 %	20 %	20 %	40 %	384540114
5620	NC_017327	GCTCGC	2	12	271835	271846	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384540114
5621	NC_017327	GAC	2	6	271950	271955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540114
5622	NC_017327	TCC	2	6	271993	271998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540114
5623	NC_017327	CGC	2	6	272012	272017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540114
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5625	NC_017327	GGGCT	2	10	272124	272133	0 %	20 %	60 %	20 %	384540114
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5992	NC_017327	CGG	2	6	290283	290288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5993	NC_017327	CAT	3	9	290354	290362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_017327	CGAT	2	8	290371	290378	25 %	25 %	25 %	25 %	384540133
5995	NC_017327	GCA	2	6	290416	290421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540133
5996	NC_017327	GCTGA	2	10	290449	290458	20 %	20 %	40 %	20 %	384540133
5997	NC_017327	GCCG	2	8	290461	290468	0 %	0 %	50 %	50 %	384540133
5998	NC_017327	TGCG	2	8	290507	290514	0 %	25 %	50 %	25 %	384540133
5999	NC_017327	GAG	2	6	290560	290565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540133
6000	NC_017327	TCCAA	2	10	290594	290603	40 %	20 %	0 %	40 %	384540133

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