MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017327	GC	4	8	242720	242727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_017327	TGAG	2	8	242805	242812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017327	GCG	2	6	242867	242872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017327	CG	3	6	242894	242899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_017327	GCA	2	6	242914	242919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017327	AAC	2	6	243074	243079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017327	GGC	2	6	243087	243092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017327	CAA	2	6	243098	243103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_017327	CGG	2	6	243121	243126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017327	GCCG	2	8	243151	243158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_017327	CCG	2	6	243201	243206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_017327	CCAA	2	8	243241	243248	50 %	0 %	0 %	50 %	384540087
5013	NC_017327	CT	3	6	243249	243254	0 %	50 %	0 %	50 %	384540087
5014	NC_017327	ACG	2	6	243269	243274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540087
5015	NC_017327	CGC	2	6	243344	243349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540087
5016	NC_017327	AAG	2	6	243368	243373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540087
5017	NC_017327	GCTC	2	8	243382	243389	0 %	25 %	25 %	50 %	384540087
5018	NC_017327	GA	3	6	243408	243413	50 %	0 %	50 %	0 %	384540087
5019	NC_017327	CCAA	2	8	243433	243440	50 %	0 %	0 %	50 %	384540087
5020	NC_017327	ATT	2	6	243486	243491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384540087
5021	NC_017327	TGT	2	6	243493	243498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540087
5022	NC_017327	GAA	2	6	243571	243576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540087
5023	NC_017327	CAT	2	6	243629	243634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540087
5024	NC_017327	CTT	2	6	243674	243679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540087
5025	NC_017327	GTA	2	6	243683	243688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540087
5026	NC_017327	TTG	2	6	243693	243698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540087
5027	NC_017327	ATG	2	6	243708	243713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540087
5028	NC_017327	TTC	2	6	243716	243721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540087
5029	NC_017327	G	7	7	243809	243815	0 %	0 %	100 %	0 %	384540087
5030	NC_017327	TCT	2	6	243835	243840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540087
5031	NC_017327	TCC	2	6	243917	243922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_017327	TGT	2	6	243935	243940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017327	AAG	2	6	243944	243949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017327	CTGGCG	2	12	243970	243981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017327	CGG	2	6	244067	244072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017327	T	6	6	244083	244088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017327	TGG	2	6	244115	244120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017327	GAT	2	6	244141	244146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540088
5039	NC_017327	CGC	2	6	244166	244171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540088
5040	NC_017327	CTT	2	6	244192	244197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540088
5041	NC_017327	CGTT	2	8	244220	244227	0 %	50 %	25 %	25 %	384540088
5042	NC_017327	GCT	2	6	244547	244552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017327	CAT	2	6	244574	244579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017327	TCA	2	6	244591	244596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017327	GCC	2	6	244717	244722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_017327	TC	3	6	244740	244745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_017327	CA	3	6	244758	244763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_017327	CT	3	6	244843	244848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_017327	CGA	2	6	244933	244938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5050	NC_017327	TCG	2	6	244986	244991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5051	NC_017327	ACG	2	6	245019	245024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5052	NC_017327	T	6	6	245038	245043	0 %	100 %	0 %	0 %	384540089
5053	NC_017327	CAT	2	6	245065	245070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540089
5054	NC_017327	GCA	2	6	245131	245136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5055	NC_017327	CGTCGC	2	12	245140	245151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384540089
5056	NC_017327	CGA	2	6	245197	245202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5057	NC_017327	CGCA	2	8	245237	245244	25 %	0 %	25 %	50 %	384540089
5058	NC_017327	TCG	2	6	245331	245336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5059	NC_017327	GATC	2	8	245476	245483	25 %	25 %	25 %	25 %	384540089
5060	NC_017327	TCG	2	6	245613	245618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5061	NC_017327	CCGCGC	2	12	245684	245695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540089
5062	NC_017327	CGT	3	9	245716	245724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5063	NC_017327	GACC	2	8	245725	245732	25 %	0 %	25 %	50 %	384540089
5064	NC_017327	GGCA	2	8	245737	245744	25 %	0 %	50 %	25 %	384540089
5065	NC_017327	CGG	2	6	245760	245765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
5066	NC_017327	CGG	2	6	245827	245832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
5067	NC_017327	CA	3	6	245852	245857	50 %	0 %	0 %	50 %	384540089
5068	NC_017327	CGG	2	6	245889	245894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
5069	NC_017327	CAG	2	6	245897	245902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5070	NC_017327	CGA	2	6	246052	246057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5071	NC_017327	AAG	2	6	246230	246235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540089
5072	NC_017327	GGC	2	6	246298	246303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
5073	NC_017327	CTG	2	6	246344	246349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
5074	NC_017327	GAA	2	6	246350	246355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540089
5075	NC_017327	CTA	2	6	246373	246378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540089
5076	NC_017327	GAT	2	6	246415	246420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540089
5077	NC_017327	CTC	2	6	246439	246444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_017327	TCC	2	6	246526	246531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540090
5079	NC_017327	GAC	2	6	246579	246584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540090
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5081	NC_017327	TGG	2	6	246684	246689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540090
5082	NC_017327	CGA	2	6	246708	246713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540090
5083	NC_017327	CTG	2	6	246744	246749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540090
5084	NC_017327	AGA	2	6	246792	246797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540090
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5086	NC_017327	CGA	2	6	246876	246881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540090
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5088	NC_017327	GCC	2	6	246940	246945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540090
5089	NC_017327	CTG	2	6	246949	246954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540090
5090	NC_017327	ATT	2	6	246959	246964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384540090
5091	NC_017327	GAT	2	6	247012	247017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540090
5092	NC_017327	TCT	2	6	247032	247037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540090
5093	NC_017327	CAA	2	6	247074	247079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540090
5094	NC_017327	GATCTC	2	12	247102	247113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384540090
5095	NC_017327	CTG	2	6	247180	247185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540090
5096	NC_017327	TTTCGA	2	12	247209	247220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384540090
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5099	NC_017327	GCGA	2	8	247386	247393	25 %	0 %	50 %	25 %	384540090
5100	NC_017327	CTT	2	6	247398	247403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540090
5101	NC_017327	TGG	2	6	247483	247488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540090
5102	NC_017327	ATC	2	6	247517	247522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540090
5103	NC_017327	GCC	2	6	247534	247539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540090
5104	NC_017327	GATG	2	8	247609	247616	25 %	25 %	50 %	0 %	384540090
5105	NC_017327	TGCC	2	8	247642	247649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_017327	AGGC	2	8	247718	247725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_017327	CTGG	2	8	247785	247792	0 %	25 %	50 %	25 %	384540091
5108	NC_017327	GCC	2	6	247893	247898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540091
5109	NC_017327	GGC	3	9	247950	247958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540091
5110	NC_017327	TCGC	2	8	247974	247981	0 %	25 %	25 %	50 %	384540091
5111	NC_017327	GCC	2	6	247993	247998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540091
5112	NC_017327	TTC	2	6	248008	248013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540091
5113	NC_017327	GCG	2	6	248052	248057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540091
5114	NC_017327	CT	3	6	248090	248095	0 %	50 %	0 %	50 %	384540091
5115	NC_017327	TTCGG	2	10	248205	248214	0 %	40 %	40 %	20 %	384540092
5116	NC_017327	AGC	2	6	248273	248278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540092
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5119	NC_017327	ACC	3	9	248343	248351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540092
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5121	NC_017327	TGT	2	6	248415	248420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540092
5122	NC_017327	CAAC	2	8	248469	248476	50 %	0 %	0 %	50 %	384540092
5123	NC_017327	GTT	2	6	248520	248525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540092
5124	NC_017327	TCG	2	6	248563	248568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540092
5125	NC_017327	CGAG	2	8	248608	248615	25 %	0 %	50 %	25 %	384540092
5126	NC_017327	GCC	2	6	248631	248636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540092
5127	NC_017327	GGA	2	6	248667	248672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540092
5128	NC_017327	GCA	2	6	248712	248717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540093
5129	NC_017327	ACT	2	6	248723	248728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540093
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5134	NC_017327	TTC	2	6	248870	248875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540093
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5138	NC_017327	GCC	2	6	249224	249229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5139	NC_017327	CAG	2	6	249366	249371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_017327	GCT	2	6	249434	249439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_017327	GAG	2	6	249671	249676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_017327	GCC	2	6	249751	249756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5143	NC_017327	CT	3	6	249780	249785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5144	NC_017327	TTG	2	6	249800	249805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540094
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5146	NC_017327	ATT	2	6	249931	249936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_017327	GTT	2	6	249940	249945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_017327	GC	4	8	249970	249977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5149	NC_017327	GGC	2	6	250006	250011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_017327	CTTT	2	8	250038	250045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5152	NC_017327	CTG	3	9	250087	250095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540095
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5156	NC_017327	GAC	2	6	250331	250336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540095
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5159	NC_017327	CGTCT	2	10	250559	250568	0 %	40 %	20 %	40 %	384540095
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5173	NC_017327	TGG	2	6	251240	251245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5175	NC_017327	ACC	2	6	251366	251371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5181	NC_017327	GCCG	2	8	251772	251779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5182	NC_017327	ATC	2	6	251848	251853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540098
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5235	NC_017327	TGC	3	9	254039	254047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540100
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5242	NC_017327	GCA	2	6	254522	254527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540101
5243	NC_017327	CGAG	2	8	254687	254694	25 %	0 %	50 %	25 %	384540101
5244	NC_017327	GGA	2	6	254765	254770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540101
5245	NC_017327	CCT	2	6	254798	254803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540101
5246	NC_017327	TGG	2	6	254809	254814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540101
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5493	NC_017327	TTC	2	6	264953	264958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540109
5494	NC_017327	GTC	2	6	264960	264965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540109
5495	NC_017327	TCG	2	6	264966	264971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540109
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