MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_017326	GCA	2	6	1517480	1517485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539682
35003	NC_017326	AGC	2	6	1517507	1517512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539682
35004	NC_017326	TGG	2	6	1517521	1517526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539682
35005	NC_017326	AGG	2	6	1517630	1517635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539682
35006	NC_017326	CTT	2	6	1517682	1517687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539682
35007	NC_017326	CGA	3	9	1517714	1517722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539682
35008	NC_017326	TCG	2	6	1517791	1517796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539682
35009	NC_017326	AGC	2	6	1517904	1517909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539682
35010	NC_017326	TAC	2	6	1517934	1517939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35011	NC_017326	GT	3	6	1518015	1518020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_017326	TCG	2	6	1518511	1518516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539683
35013	NC_017326	GC	4	8	1518527	1518534	0 %	0 %	50 %	50 %	384539683
35014	NC_017326	GGA	2	6	1518594	1518599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539683
35015	NC_017326	TCGC	2	8	1518633	1518640	0 %	25 %	25 %	50 %	384539683
35016	NC_017326	TGC	2	6	1518707	1518712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539683
35017	NC_017326	TCG	2	6	1518988	1518993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539684
35018	NC_017326	TTC	2	6	1519000	1519005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539684
35019	NC_017326	GCG	2	6	1519040	1519045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539684
35020	NC_017326	CGG	2	6	1519046	1519051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539684
35021	NC_017326	AGC	2	6	1519066	1519071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539684
35022	NC_017326	GC	3	6	1519100	1519105	0 %	0 %	50 %	50 %	384539684
35023	NC_017326	AGCC	2	8	1519135	1519142	25 %	0 %	25 %	50 %	384539684
35024	NC_017326	AGA	2	6	1519183	1519188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539684
35025	NC_017326	GC	3	6	1519261	1519266	0 %	0 %	50 %	50 %	384539684
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35031	NC_017326	AGAT	2	8	1519546	1519553	50 %	25 %	25 %	0 %	384539684
35032	NC_017326	GC	4	8	1519569	1519576	0 %	0 %	50 %	50 %	384539684
35033	NC_017326	TGC	2	6	1519598	1519603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539684
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35042	NC_017326	GCA	2	6	1519882	1519887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539684
35043	NC_017326	GCC	2	6	1519984	1519989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35044	NC_017326	ACA	2	6	1520001	1520006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35045	NC_017326	AAC	2	6	1520165	1520170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539685
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35056	NC_017326	CGC	2	6	1520627	1520632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539685
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35062	NC_017326	AC	3	6	1520956	1520961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35063	NC_017326	CCG	2	6	1521047	1521052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539686
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35067	NC_017326	GA	3	6	1521090	1521095	50 %	0 %	50 %	0 %	384539686
35068	NC_017326	ATCG	2	8	1521150	1521157	25 %	25 %	25 %	25 %	384539686
35069	NC_017326	GGC	2	6	1521198	1521203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539686
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35084	NC_017326	GTC	2	6	1521770	1521775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539687
35085	NC_017326	GACC	2	8	1521784	1521791	25 %	0 %	25 %	50 %	384539687
35086	NC_017326	CT	3	6	1521805	1521810	0 %	50 %	0 %	50 %	384539687
35087	NC_017326	CGAG	2	8	1521847	1521854	25 %	0 %	50 %	25 %	384539687
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35089	NC_017326	CGC	2	6	1521902	1521907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539687
35090	NC_017326	GCA	2	6	1521936	1521941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539687
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35095	NC_017326	GC	4	8	1522268	1522275	0 %	0 %	50 %	50 %	384539688
35096	NC_017326	ATGG	2	8	1522281	1522288	25 %	25 %	50 %	0 %	384539688
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35099	NC_017326	TCG	2	6	1522447	1522452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35100	NC_017326	CGA	2	6	1522463	1522468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35101	NC_017326	TCA	2	6	1522469	1522474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539688
35102	NC_017326	TCGA	2	8	1522561	1522568	25 %	25 %	25 %	25 %	384539688
35103	NC_017326	CCCGG	2	10	1522580	1522589	0 %	0 %	40 %	60 %	384539688
35104	NC_017326	CGA	2	6	1522637	1522642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35105	NC_017326	CGC	2	6	1522674	1522679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35106	NC_017326	GCT	2	6	1522872	1522877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35107	NC_017326	GCA	2	6	1522958	1522963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35108	NC_017326	TCGA	2	8	1523050	1523057	25 %	25 %	25 %	25 %	384539688
35109	NC_017326	TCC	2	6	1523089	1523094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539688
35110	NC_017326	GCC	3	9	1523176	1523184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35111	NC_017326	TG	3	6	1523202	1523207	0 %	50 %	50 %	0 %	384539688
35112	NC_017326	CCT	2	6	1523222	1523227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539688
35113	NC_017326	GCC	2	6	1523242	1523247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35114	NC_017326	TCG	2	6	1523263	1523268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35115	NC_017326	GCA	2	6	1523279	1523284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35116	NC_017326	GCT	2	6	1523327	1523332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35117	NC_017326	CGG	2	6	1523440	1523445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539688
35118	NC_017326	CGC	2	6	1523465	1523470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35119	NC_017326	CGC	2	6	1523639	1523644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35120	NC_017326	GCC	2	6	1523686	1523691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35121	NC_017326	GCA	2	6	1523693	1523698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35122	NC_017326	CTG	2	6	1523706	1523711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35123	NC_017326	TTC	2	6	1523725	1523730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539688
35124	NC_017326	GCA	2	6	1523834	1523839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35125	NC_017326	GGCCG	2	10	1523896	1523905	0 %	0 %	60 %	40 %	384539688
35126	NC_017326	TCC	2	6	1523917	1523922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539688
35127	NC_017326	CTTG	2	8	1523934	1523941	0 %	50 %	25 %	25 %	384539688
35128	NC_017326	CCG	2	6	1523948	1523953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539688
35129	NC_017326	GTC	2	6	1523961	1523966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35130	NC_017326	GCA	2	6	1524005	1524010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539688
35131	NC_017326	TCC	2	6	1524070	1524075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539688
35132	NC_017326	CCA	2	6	1524080	1524085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539688
35133	NC_017326	GCTC	2	8	1524140	1524147	0 %	25 %	25 %	50 %	384539688
35134	NC_017326	GAT	2	6	1524294	1524299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539688
35135	NC_017326	GATC	2	8	1524341	1524348	25 %	25 %	25 %	25 %	384539688
35136	NC_017326	GCG	2	6	1524352	1524357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539689
35137	NC_017326	CGCC	2	8	1524358	1524365	0 %	0 %	25 %	75 %	384539689
35138	NC_017326	CGA	2	6	1524445	1524450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35139	NC_017326	CAG	2	6	1524629	1524634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35140	NC_017326	TCG	2	6	1524639	1524644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35141	NC_017326	CTG	2	6	1524683	1524688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35142	NC_017326	TCC	2	6	1524795	1524800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539689
35143	NC_017326	GCC	2	6	1524801	1524806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539689
35144	NC_017326	TCC	2	6	1524837	1524842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539689
35145	NC_017326	ACC	2	6	1524858	1524863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539689
35146	NC_017326	AGC	2	6	1524927	1524932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539689
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35148	NC_017326	GCCG	2	8	1525004	1525011	0 %	0 %	50 %	50 %	384539689
35149	NC_017326	TCC	2	6	1525068	1525073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539689
35150	NC_017326	CCGGC	2	10	1525115	1525124	0 %	0 %	40 %	60 %	384539689
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35152	NC_017326	ATG	2	6	1525223	1525228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539689
35153	NC_017326	CAG	2	6	1525247	1525252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35154	NC_017326	CG	3	6	1525270	1525275	0 %	0 %	50 %	50 %	384539689
35155	NC_017326	GAC	2	6	1525307	1525312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35156	NC_017326	GTC	2	6	1525349	1525354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539689
35157	NC_017326	TCG	2	6	1525446	1525451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539689
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35162	NC_017326	CG	4	8	1525807	1525814	0 %	0 %	50 %	50 %	384539690
35163	NC_017326	CGG	2	6	1525831	1525836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539690
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35169	NC_017326	CTC	2	6	1526255	1526260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35170	NC_017326	TC	4	8	1526319	1526326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35171	NC_017326	CGT	2	6	1526333	1526338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35172	NC_017326	ACG	2	6	1526351	1526356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35173	NC_017326	ACACT	2	10	1526407	1526416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35174	NC_017326	GGC	2	6	1526479	1526484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539691
35175	NC_017326	CTT	2	6	1526510	1526515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539691
35176	NC_017326	TGC	2	6	1526532	1526537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539691
35177	NC_017326	TCC	2	6	1526616	1526621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539691
35178	NC_017326	TCCG	2	8	1526762	1526769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35179	NC_017326	TAAATT	2	12	1526802	1526813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35180	NC_017326	AAC	2	6	1526857	1526862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35181	NC_017326	GAT	2	6	1526904	1526909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539692
35182	NC_017326	GCC	2	6	1526931	1526936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539692
35183	NC_017326	TGC	2	6	1526993	1526998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539692
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35186	NC_017326	GC	3	6	1527063	1527068	0 %	0 %	50 %	50 %	384539692
35187	NC_017326	AAG	2	6	1527120	1527125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539692
35188	NC_017326	CG	3	6	1527183	1527188	0 %	0 %	50 %	50 %	384539692
35189	NC_017326	TCG	2	6	1527190	1527195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539692
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35193	NC_017326	TCG	3	9	1527481	1527489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539692
35194	NC_017326	CG	3	6	1527493	1527498	0 %	0 %	50 %	50 %	384539692
35195	NC_017326	TGC	2	6	1527526	1527531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539692
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35201	NC_017326	CGT	2	6	1527683	1527688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539692
35202	NC_017326	CGG	2	6	1527701	1527706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539692
35203	NC_017326	CTT	2	6	1527720	1527725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539692
35204	NC_017326	GGT	2	6	1527729	1527734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539692
35205	NC_017326	ATC	2	6	1527837	1527842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539692
35206	NC_017326	CGG	2	6	1527851	1527856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539692
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35208	NC_017326	C	6	6	1527940	1527945	0 %	0 %	0 %	100 %	384539693
35209	NC_017326	CG	3	6	1527984	1527989	0 %	0 %	50 %	50 %	384539693
35210	NC_017326	CGCAGC	2	12	1528241	1528252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384539693
35211	NC_017326	ACG	2	6	1528270	1528275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539693
35212	NC_017326	CCG	2	6	1528295	1528300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539693
35213	NC_017326	CTG	2	6	1528311	1528316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539693
35214	NC_017326	CCA	2	6	1528324	1528329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539693
35215	NC_017326	GGA	2	6	1528346	1528351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539693
35216	NC_017326	CGC	2	6	1528535	1528540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539693
35217	NC_017326	GATGCT	2	12	1528562	1528573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384539693
35218	NC_017326	CG	3	6	1528591	1528596	0 %	0 %	50 %	50 %	384539693
35219	NC_017326	CCCCG	2	10	1528631	1528640	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
35220	NC_017326	CTGG	2	8	1528648	1528655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35221	NC_017326	GAG	2	6	1528679	1528684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35222	NC_017326	CAA	2	6	1528687	1528692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35223	NC_017326	CGG	2	6	1528697	1528702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35224	NC_017326	TTG	2	6	1528780	1528785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539694
35225	NC_017326	GCC	2	6	1528793	1528798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539694
35226	NC_017326	GCC	2	6	1528837	1528842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539694
35227	NC_017326	GGC	2	6	1528854	1528859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539694
35228	NC_017326	CAG	2	6	1528908	1528913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539694
35229	NC_017326	GA	3	6	1528924	1528929	50 %	0 %	50 %	0 %	384539694
35230	NC_017326	GCCCGA	2	12	1528934	1528945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384539694
35231	NC_017326	CCG	2	6	1528961	1528966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539694
35232	NC_017326	GAT	2	6	1529013	1529018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539694
35233	NC_017326	GCC	2	6	1529083	1529088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539694
35234	NC_017326	GCC	2	6	1529112	1529117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539694
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35337	NC_017326	CCT	2	6	1533523	1533528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539697
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35340	NC_017326	CGA	2	6	1533590	1533595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539697
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35342	NC_017326	TGC	2	6	1533691	1533696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539697
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35344	NC_017326	TGC	2	6	1533769	1533774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539697
35345	NC_017326	GATCAA	2	12	1533785	1533796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384539697
35346	NC_017326	CGG	3	9	1533842	1533850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35347	NC_017326	CGC	2	6	1533857	1533862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35348	NC_017326	TTC	2	6	1533955	1533960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539698
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35452	NC_017326	CGA	2	6	1537564	1537569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539701
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35454	NC_017326	CG	4	8	1537636	1537643	0 %	0 %	50 %	50 %	384539701
35455	NC_017326	TCA	2	6	1537677	1537682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539701
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35460	NC_017326	CGGC	2	8	1537974	1537981	0 %	0 %	50 %	50 %	384539701
35461	NC_017326	CAG	2	6	1538072	1538077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539701
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35464	NC_017326	CGAG	2	8	1538199	1538206	25 %	0 %	50 %	25 %	384539701
35465	NC_017326	GCT	2	6	1538248	1538253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539701
35466	NC_017326	ACCGG	2	10	1538298	1538307	20 %	0 %	40 %	40 %	384539702
35467	NC_017326	ACCC	2	8	1538314	1538321	25 %	0 %	0 %	75 %	384539702
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35481	NC_017326	ATT	2	6	1538818	1538823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35484	NC_017326	GA	3	6	1539074	1539079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35485	NC_017326	TGA	2	6	1539081	1539086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539704
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35492	NC_017326	GGC	2	6	1539292	1539297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539704
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