MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31504	NC_017326	TCG	2	6	1364893	1364898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539528
31505	NC_017326	GCTC	2	8	1364939	1364946	0 %	25 %	25 %	50 %	384539528
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31508	NC_017326	CAT	2	6	1364996	1365001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539528
31509	NC_017326	CCG	2	6	1365155	1365160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539528
31510	NC_017326	CGG	2	6	1365221	1365226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539528
31511	NC_017326	CGT	2	6	1365306	1365311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539528
31512	NC_017326	GCG	2	6	1365326	1365331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539528
31513	NC_017326	AT	3	6	1365342	1365347	50 %	50 %	0 %	0 %	384539528
31514	NC_017326	CCG	2	6	1365350	1365355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539528
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31519	NC_017326	CGG	2	6	1365535	1365540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539529
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31522	NC_017326	TGA	2	6	1365681	1365686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539529
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31539	NC_017326	CATC	2	8	1366959	1366966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31540	NC_017326	GTC	2	6	1367013	1367018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539530
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31562	NC_017326	CTTT	2	8	1367708	1367715	0 %	75 %	0 %	25 %	384539530
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31568	NC_017326	GCCG	2	8	1368048	1368055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31569	NC_017326	GCA	2	6	1368059	1368064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31601	NC_017326	GA	3	6	1369657	1369662	50 %	0 %	50 %	0 %	384539532
31602	NC_017326	CCG	2	6	1369671	1369676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539532
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31852	NC_017326	GACTT	2	10	1381758	1381767	20 %	40 %	20 %	20 %	384539543
31853	NC_017326	GCT	2	6	1381777	1381782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539543
31854	NC_017326	GCC	2	6	1381795	1381800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539543
31855	NC_017326	CGG	2	6	1381803	1381808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539543
31856	NC_017326	GC	3	6	1381819	1381824	0 %	0 %	50 %	50 %	384539543
31857	NC_017326	TCC	2	6	1381842	1381847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539543
31858	NC_017326	CTG	2	6	1381873	1381878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539543
31859	NC_017326	TGGA	2	8	1381883	1381890	25 %	25 %	50 %	0 %	384539543
31860	NC_017326	CAT	2	6	1381900	1381905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539543
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31862	NC_017326	TCG	2	6	1382058	1382063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539543
31863	NC_017326	GCG	2	6	1382092	1382097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539543
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31867	NC_017326	TCTGCC	2	12	1382183	1382194	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384539544
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31870	NC_017326	CGG	3	9	1382331	1382339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539544
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31872	NC_017326	TCG	2	6	1382375	1382380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
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31874	NC_017326	TCG	2	6	1382429	1382434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
31875	NC_017326	CTCGG	2	10	1382443	1382452	0 %	20 %	40 %	40 %	384539544
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31879	NC_017326	CAT	2	6	1382565	1382570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539544
31880	NC_017326	TCG	2	6	1382588	1382593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
31881	NC_017326	CTG	2	6	1382659	1382664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
31882	NC_017326	CG	3	6	1382717	1382722	0 %	0 %	50 %	50 %	384539544
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31885	NC_017326	TCG	2	6	1382870	1382875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
31886	NC_017326	ATG	2	6	1382920	1382925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539544
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31893	NC_017326	CGT	3	9	1383198	1383206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
31894	NC_017326	GTC	2	6	1383208	1383213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539544
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31897	NC_017326	GGC	2	6	1383264	1383269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539544
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31900	NC_017326	CCAG	2	8	1383404	1383411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31901	NC_017326	CCTT	2	8	1383441	1383448	0 %	50 %	0 %	50 %	384539545
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31919	NC_017326	CGA	2	6	1383919	1383924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539545
31920	NC_017326	ACG	2	6	1383953	1383958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539545
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31924	NC_017326	ATC	2	6	1384202	1384207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539545
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31926	NC_017326	CTC	2	6	1384271	1384276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539545
31927	NC_017326	GCCG	2	8	1384328	1384335	0 %	0 %	50 %	50 %	384539545
31928	NC_017326	ATC	2	6	1384337	1384342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539545
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31931	NC_017326	AG	3	6	1384525	1384530	50 %	0 %	50 %	0 %	384539546
31932	NC_017326	GAG	2	6	1384534	1384539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539546
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31935	NC_017326	CGG	3	9	1384584	1384592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539546
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31938	NC_017326	TCG	2	6	1384844	1384849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539547
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31941	NC_017326	CCG	2	6	1384911	1384916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539547
31942	NC_017326	CTT	2	6	1384939	1384944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539547
31943	NC_017326	GGAAG	2	10	1384998	1385007	40 %	0 %	60 %	0 %	384539547
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31949	NC_017326	CCGCC	2	10	1385127	1385136	0 %	0 %	20 %	80 %	384539547
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31951	NC_017326	GCC	2	6	1385255	1385260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539547
31952	NC_017326	GCA	2	6	1385293	1385298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539547
31953	NC_017326	GGC	2	6	1385331	1385336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539547
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31955	NC_017326	CG	3	6	1385391	1385396	0 %	0 %	50 %	50 %	384539547
31956	NC_017326	GGC	2	6	1385460	1385465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539547
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31958	NC_017326	GGC	2	6	1385490	1385495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539547
31959	NC_017326	GCT	2	6	1385518	1385523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539547
31960	NC_017326	CGGC	2	8	1385585	1385592	0 %	0 %	50 %	50 %	384539547
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31964	NC_017326	CGA	2	6	1385861	1385866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
31965	NC_017326	GAT	2	6	1385880	1385885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539548
31966	NC_017326	CGA	2	6	1385912	1385917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
31967	NC_017326	TTG	2	6	1385929	1385934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539548
31968	NC_017326	GC	4	8	1385997	1386004	0 %	0 %	50 %	50 %	384539548
31969	NC_017326	GAC	2	6	1386012	1386017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
31970	NC_017326	ATAG	2	8	1386198	1386205	50 %	25 %	25 %	0 %	384539548
31971	NC_017326	CAG	2	6	1386390	1386395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
31972	NC_017326	CGC	2	6	1386491	1386496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539548
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31974	NC_017326	TGA	2	6	1386563	1386568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539548
31975	NC_017326	GCA	2	6	1386583	1386588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
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31979	NC_017326	ACG	2	6	1386727	1386732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
31980	NC_017326	ACG	2	6	1386745	1386750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539548
31981	NC_017326	GAAG	2	8	1386752	1386759	50 %	0 %	50 %	0 %	384539548
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31986	NC_017326	GTC	2	6	1387000	1387005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539549
31987	NC_017326	TGA	3	9	1387008	1387016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539549
31988	NC_017326	ATG	2	6	1387049	1387054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539549
31989	NC_017326	GGCTC	2	10	1387116	1387125	0 %	20 %	40 %	40 %	384539549
31990	NC_017326	CAGC	2	8	1387132	1387139	25 %	0 %	25 %	50 %	384539549
31991	NC_017326	CTG	2	6	1387156	1387161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539549
31992	NC_017326	GCC	2	6	1387165	1387170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539549
31993	NC_017326	TCG	2	6	1387220	1387225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539549
31994	NC_017326	CGG	2	6	1387253	1387258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539549
31995	NC_017326	GTCG	2	8	1387287	1387294	0 %	25 %	50 %	25 %	384539549
31996	NC_017326	GGAT	2	8	1387320	1387327	25 %	25 %	50 %	0 %	384539549
31997	NC_017326	TCC	2	6	1387358	1387363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539549
31998	NC_017326	GAC	2	6	1387403	1387408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539549
31999	NC_017326	CTGC	2	8	1387421	1387428	0 %	25 %	25 %	50 %	384539549
32000	NC_017326	CGC	2	6	1387445	1387450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539549

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