MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_017326	GCG	2	6	800850	800855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539002
19002	NC_017326	TCG	2	6	800868	800873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539002
19003	NC_017326	ATC	2	6	800900	800905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539002
19004	NC_017326	CGA	2	6	800919	800924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539002
19005	NC_017326	CGG	2	6	800926	800931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539002
19006	NC_017326	CG	3	6	800944	800949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19007	NC_017326	GCCG	2	8	800959	800966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19008	NC_017326	CGGC	2	8	800975	800982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19009	NC_017326	GCC	2	6	801005	801010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19010	NC_017326	ACG	2	6	801051	801056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_017326	GGCC	2	8	801085	801092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19012	NC_017326	CAA	2	6	801180	801185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539003
19013	NC_017326	TTC	2	6	801280	801285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539003
19014	NC_017326	CTT	2	6	801300	801305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539003
19015	NC_017326	TCG	2	6	801311	801316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539003
19016	NC_017326	CG	3	6	801329	801334	0 %	0 %	50 %	50 %	384539003
19017	NC_017326	GAC	2	6	801382	801387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539003
19018	NC_017326	ATC	2	6	801502	801507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539003
19019	NC_017326	TCT	2	6	801512	801517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539003
19020	NC_017326	CGC	2	6	801540	801545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539003
19021	NC_017326	GC	3	6	801606	801611	0 %	0 %	50 %	50 %	384539003
19022	NC_017326	GTC	2	6	801622	801627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539003
19023	NC_017326	GC	3	6	801704	801709	0 %	0 %	50 %	50 %	384539003
19024	NC_017326	TTC	2	6	801721	801726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539003
19025	NC_017326	GGA	2	6	801756	801761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539003
19026	NC_017326	TGC	2	6	801824	801829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539003
19027	NC_017326	GC	3	6	801873	801878	0 %	0 %	50 %	50 %	384539003
19028	NC_017326	CGA	2	6	801881	801886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539003
19029	NC_017326	CGG	2	6	801900	801905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539003
19030	NC_017326	GGC	2	6	801907	801912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539003
19031	NC_017326	CTC	2	6	801922	801927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539003
19032	NC_017326	TCC	2	6	801974	801979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539003
19033	NC_017326	CGC	3	9	802027	802035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539003
19034	NC_017326	TCG	2	6	802037	802042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539003
19035	NC_017326	CAT	2	6	802077	802082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539004
19036	NC_017326	GC	3	6	802105	802110	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19037	NC_017326	GC	3	6	802129	802134	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19038	NC_017326	GTC	2	6	802152	802157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539004
19039	NC_017326	GCC	2	6	802159	802164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
19040	NC_017326	GCG	2	6	802167	802172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539004
19041	NC_017326	CGT	2	6	802197	802202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539004
19042	NC_017326	TGG	2	6	802222	802227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539004
19043	NC_017326	TTC	2	6	802228	802233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539004
19044	NC_017326	GCCAAT	2	12	802252	802263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384539004
19045	NC_017326	CGC	2	6	802370	802375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
19046	NC_017326	CGC	2	6	802437	802442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
19047	NC_017326	CCT	2	6	802481	802486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539004
19048	NC_017326	GC	3	6	802513	802518	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19049	NC_017326	CGC	2	6	802538	802543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
19050	NC_017326	GCC	2	6	802552	802557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
19051	NC_017326	GAA	2	6	802570	802575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539004
19052	NC_017326	CACG	2	8	802581	802588	25 %	0 %	25 %	50 %	384539004
19053	NC_017326	GTG	2	6	802591	802596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539004
19054	NC_017326	CA	3	6	802647	802652	50 %	0 %	0 %	50 %	384539004
19055	NC_017326	CCT	2	6	802718	802723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539004
19056	NC_017326	CAC	2	6	802770	802775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539004
19057	NC_017326	CGA	2	6	802797	802802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539004
19058	NC_017326	CTT	2	6	802821	802826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539004
19059	NC_017326	CTT	2	6	802863	802868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539004
19060	NC_017326	CCT	2	6	802892	802897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539004
19061	NC_017326	GC	3	6	802927	802932	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19062	NC_017326	TC	3	6	802938	802943	0 %	50 %	0 %	50 %	384539004
19063	NC_017326	AAC	2	6	802954	802959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539004
19064	NC_017326	GCA	2	6	802980	802985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539004
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19066	NC_017326	CCT	2	6	803048	803053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539004
19067	NC_017326	GC	3	6	803083	803088	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19068	NC_017326	GCC	2	6	803102	803107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
19069	NC_017326	TTC	2	6	803131	803136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539004
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19071	NC_017326	TTC	2	6	803176	803181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539004
19072	NC_017326	CG	3	6	803183	803188	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19073	NC_017326	CGGGCC	2	12	803193	803204	0 %	0 %	50 %	50 %	384539004
19074	NC_017326	TCT	2	6	803225	803230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539004
19075	NC_017326	CGA	2	6	803283	803288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539004
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19077	NC_017326	TCGG	2	8	803311	803318	0 %	25 %	50 %	25 %	384539004
19078	NC_017326	CGC	2	6	803319	803324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539004
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19080	NC_017326	GCCA	2	8	803377	803384	25 %	0 %	25 %	50 %	384539004
19081	NC_017326	CCA	2	6	803420	803425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539004
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19083	NC_017326	TGC	2	6	803516	803521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539004
19084	NC_017326	AC	3	6	803590	803595	50 %	0 %	0 %	50 %	384539004
19085	NC_017326	CCGC	2	8	803627	803634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19086	NC_017326	CTT	2	6	803649	803654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19087	NC_017326	CGACC	2	10	803683	803692	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19088	NC_017326	ATC	2	6	803697	803702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19089	NC_017326	ATCC	2	8	803786	803793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19090	NC_017326	TCA	2	6	803826	803831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_017326	TGT	2	6	803835	803840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_017326	TGA	2	6	803911	803916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_017326	AG	3	6	803917	803922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_017326	CGC	2	6	803954	803959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539005
19095	NC_017326	GACGC	2	10	804002	804011	20 %	0 %	40 %	40 %	384539005
19096	NC_017326	CGG	2	6	804018	804023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539005
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19104	NC_017326	CGCC	2	8	804348	804355	0 %	0 %	25 %	75 %	384539005
19105	NC_017326	GAG	2	6	804424	804429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539005
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19107	NC_017326	CGA	2	6	804542	804547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539005
19108	NC_017326	CGC	2	6	804568	804573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539005
19109	NC_017326	CTG	2	6	804598	804603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539005
19110	NC_017326	GGC	2	6	804610	804615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539005
19111	NC_017326	CGAA	2	8	804621	804628	50 %	0 %	25 %	25 %	384539005
19112	NC_017326	GGA	2	6	804682	804687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539006
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19116	NC_017326	GTC	2	6	804896	804901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539006
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19118	NC_017326	GCA	2	6	804981	804986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539006
19119	NC_017326	CAAG	2	8	805009	805016	50 %	0 %	25 %	25 %	384539006
19120	NC_017326	CTGCG	2	10	805049	805058	0 %	20 %	40 %	40 %	384539006
19121	NC_017326	CCG	2	6	805068	805073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539006
19122	NC_017326	CTA	2	6	805186	805191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539006
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19127	NC_017326	CGA	2	6	805333	805338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539006
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19131	NC_017326	GC	3	6	805455	805460	0 %	0 %	50 %	50 %	384539006
19132	NC_017326	CGC	2	6	805498	805503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539006
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19158	NC_017326	CGCCT	2	10	806390	806399	0 %	20 %	20 %	60 %	384539008
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19201	NC_017326	CGG	2	6	808121	808126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19233	NC_017326	CGCCT	2	10	809555	809564	0 %	20 %	20 %	60 %	384539010
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19238	NC_017326	ATT	2	6	809743	809748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539011
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19242	NC_017326	ATC	2	6	809862	809867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539011
19243	NC_017326	GGC	2	6	810024	810029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539011
19244	NC_017326	GAG	2	6	810075	810080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539011
19245	NC_017326	CG	3	6	810083	810088	0 %	0 %	50 %	50 %	384539011
19246	NC_017326	GGC	2	6	810096	810101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539011
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19483	NC_017326	CGTC	2	8	820509	820516	0 %	25 %	25 %	50 %	384539018
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