MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017326	CGC	2	6	632067	632072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15002	NC_017326	CGA	2	6	632095	632100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538859
15003	NC_017326	GCCG	2	8	632149	632156	0 %	0 %	50 %	50 %	384538859
15004	NC_017326	GATC	2	8	632158	632165	25 %	25 %	25 %	25 %	384538859
15005	NC_017326	CCA	2	6	632189	632194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538859
15006	NC_017326	GCCGA	2	10	632205	632214	20 %	0 %	40 %	40 %	384538859
15007	NC_017326	GC	3	6	632218	632223	0 %	0 %	50 %	50 %	384538859
15008	NC_017326	CGA	2	6	632224	632229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538859
15009	NC_017326	GAA	2	6	632231	632236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538859
15010	NC_017326	CCG	3	9	632265	632273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15011	NC_017326	GCC	3	9	632300	632308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15012	NC_017326	CGA	2	6	632341	632346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538859
15013	NC_017326	GC	3	6	632371	632376	0 %	0 %	50 %	50 %	384538859
15014	NC_017326	CGA	2	6	632377	632382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538859
15015	NC_017326	CCG	2	6	632404	632409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15016	NC_017326	GCC	2	6	632433	632438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15017	NC_017326	ATC	2	6	632445	632450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538859
15018	NC_017326	ACC	2	6	632487	632492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538859
15019	NC_017326	CCG	2	6	632553	632558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15020	NC_017326	ACG	2	6	632559	632564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538859
15021	NC_017326	GCC	2	6	632571	632576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15022	NC_017326	GATC	2	8	632584	632591	25 %	25 %	25 %	25 %	384538859
15023	NC_017326	CAG	2	6	632618	632623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538859
15024	NC_017326	GCC	2	6	632627	632632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15025	NC_017326	CCG	2	6	632662	632667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538859
15026	NC_017326	GCC	2	6	632719	632724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15027	NC_017326	TTC	2	6	632777	632782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_017326	GC	3	6	632842	632847	0 %	0 %	50 %	50 %	384538860
15029	NC_017326	TGG	2	6	632886	632891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538860
15030	NC_017326	TTG	2	6	632897	632902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538860
15031	NC_017326	TCC	3	9	632972	632980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538860
15032	NC_017326	CGG	2	6	632991	632996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538860
15033	NC_017326	GGGC	2	8	633023	633030	0 %	0 %	75 %	25 %	384538860
15034	NC_017326	GC	3	6	633101	633106	0 %	0 %	50 %	50 %	384538860
15035	NC_017326	TGC	2	6	633134	633139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15036	NC_017326	CGGC	3	12	633141	633152	0 %	0 %	50 %	50 %	384538860
15037	NC_017326	GCG	3	9	633182	633190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538860
15038	NC_017326	GTC	2	6	633200	633205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15039	NC_017326	CAG	2	6	633208	633213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15040	NC_017326	CGG	2	6	633282	633287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538860
15041	NC_017326	CGT	2	6	633288	633293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15042	NC_017326	GCC	2	6	633297	633302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538860
15043	NC_017326	CCG	2	6	633305	633310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538860
15044	NC_017326	CCA	2	6	633371	633376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538860
15045	NC_017326	GAC	2	6	633409	633414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15046	NC_017326	GCG	2	6	633468	633473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538860
15047	NC_017326	GCA	2	6	633474	633479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538860
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15049	NC_017326	GAC	2	6	633604	633609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15050	NC_017326	CGA	2	6	633648	633653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538860
15051	NC_017326	AGCG	2	8	633670	633677	25 %	0 %	50 %	25 %	384538860
15052	NC_017326	GGAC	2	8	633690	633697	25 %	0 %	50 %	25 %	384538860
15053	NC_017326	ATG	2	6	633711	633716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538860
15054	NC_017326	AGG	2	6	633731	633736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_017326	CGCCC	2	10	633884	633893	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15056	NC_017326	GCT	2	6	633903	633908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_017326	GTC	2	6	633932	633937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_017326	TGT	2	6	633979	633984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538861
15059	NC_017326	CCGG	2	8	634113	634120	0 %	0 %	50 %	50 %	384538861
15060	NC_017326	CGT	2	6	634202	634207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
15061	NC_017326	TCG	2	6	634275	634280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
15062	NC_017326	AGG	2	6	634284	634289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538861
15063	NC_017326	GC	3	6	634294	634299	0 %	0 %	50 %	50 %	384538861
15064	NC_017326	AGATC	2	10	634336	634345	40 %	20 %	20 %	20 %	384538861
15065	NC_017326	ATA	2	6	634367	634372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384538861
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15068	NC_017326	AAG	2	6	634520	634525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538861
15069	NC_017326	GAT	2	6	634565	634570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538861
15070	NC_017326	CGT	2	6	634594	634599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
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15072	NC_017326	GCC	2	6	634625	634630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538861
15073	NC_017326	CGA	2	6	634639	634644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538861
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15075	NC_017326	GTC	2	6	634692	634697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
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15079	NC_017326	TGC	2	6	634852	634857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
15080	NC_017326	CGGCCG	2	12	634858	634869	0 %	0 %	50 %	50 %	384538861
15081	NC_017326	GA	3	6	634896	634901	50 %	0 %	50 %	0 %	384538861
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15085	NC_017326	CGA	2	6	635117	635122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538861
15086	NC_017326	GCGTC	2	10	635224	635233	0 %	20 %	40 %	40 %	384538861
15087	NC_017326	GAT	2	6	635240	635245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538861
15088	NC_017326	CGG	2	6	635275	635280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538861
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15090	NC_017326	TCA	2	6	635377	635382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538861
15091	NC_017326	CGC	2	6	635416	635421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538861
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15099	NC_017326	GTT	2	6	635729	635734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538861
15100	NC_017326	GTCC	2	8	635735	635742	0 %	25 %	25 %	50 %	384538861
15101	NC_017326	CGA	2	6	635843	635848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538861
15102	NC_017326	GA	3	6	635847	635852	50 %	0 %	50 %	0 %	384538861
15103	NC_017326	TCG	2	6	635878	635883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
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15107	NC_017326	TGC	2	6	635959	635964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
15108	NC_017326	CACCGT	2	12	635989	636000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384538861
15109	NC_017326	GCT	2	6	636011	636016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538861
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15344	NC_017326	TGC	2	6	643019	643024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538865
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15346	NC_017326	CCAG	2	8	643034	643041	25 %	0 %	25 %	50 %	384538865
15347	NC_017326	GC	3	6	643059	643064	0 %	0 %	50 %	50 %	384538865
15348	NC_017326	GGCG	2	8	643098	643105	0 %	0 %	75 %	25 %	384538865
15349	NC_017326	CGC	2	6	643235	643240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538865
15350	NC_017326	CGG	2	6	643319	643324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538865
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15352	NC_017326	GCG	2	6	643338	643343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538865
15353	NC_017326	TCA	2	6	643358	643363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538865
15354	NC_017326	CA	3	6	643362	643367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15355	NC_017326	ACG	2	6	643440	643445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15356	NC_017326	ATA	2	6	643491	643496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384538866
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15358	NC_017326	CGC	2	6	643550	643555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538866
15359	NC_017326	CGC	2	6	643591	643596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538866
15360	NC_017326	GAT	2	6	643610	643615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538866
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15413	NC_017326	ATCG	2	8	645419	645426	25 %	25 %	25 %	25 %	384538866
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15430	NC_017326	ACGA	2	8	645722	645729	50 %	0 %	25 %	25 %	384538866
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15450	NC_017326	TCCA	2	8	646530	646537	25 %	25 %	0 %	50 %	384538866
15451	NC_017326	CGT	2	6	646541	646546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538866
15452	NC_017326	GT	3	6	646558	646563	0 %	50 %	50 %	0 %	384538866
15453	NC_017326	CGA	2	6	646567	646572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538866
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15457	NC_017326	CGCA	2	8	646897	646904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15458	NC_017326	AAT	2	6	646936	646941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15459	NC_017326	CGG	2	6	647004	647009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15460	NC_017326	CGC	2	6	647047	647052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538867
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15462	NC_017326	AAG	3	9	647070	647078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538867
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15469	NC_017326	AGAT	2	8	647263	647270	50 %	25 %	25 %	0 %	384538867
15470	NC_017326	GAA	2	6	647316	647321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538867
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15474	NC_017326	GCC	3	9	647691	647699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538867
15475	NC_017326	AAAGC	2	10	647824	647833	60 %	0 %	20 %	20 %	384538867
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15478	NC_017326	CAG	2	6	647889	647894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538867
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15480	NC_017326	CCG	2	6	648043	648048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538867
15481	NC_017326	GAC	2	6	648090	648095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538867
15482	NC_017326	GGC	2	6	648099	648104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538867
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