MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017326	CG	3	6	547479	547484	0 %	0 %	50 %	50 %	384538778
13003	NC_017326	CGA	2	6	547512	547517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538778
13004	NC_017326	GCGA	2	8	547571	547578	25 %	0 %	50 %	25 %	384538778
13005	NC_017326	TAA	2	6	547589	547594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384538778
13006	NC_017326	GCC	2	6	547610	547615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538778
13007	NC_017326	GTT	2	6	547701	547706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_017326	CTC	2	6	547712	547717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_017326	TTG	2	6	547772	547777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_017326	CCG	2	6	547804	547809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_017326	GATG	2	8	547896	547903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_017326	CG	3	6	547904	547909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_017326	CGT	2	6	547919	547924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_017326	TGC	2	6	547965	547970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_017326	GGCC	2	8	547985	547992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_017326	T	6	6	547993	547998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_017326	CGC	2	6	548050	548055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_017326	A	7	7	548074	548080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_017326	CG	3	6	548096	548101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_017326	ATG	2	6	548144	548149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017326	CGA	2	6	548191	548196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_017326	GCG	2	6	548312	548317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_017326	CAT	2	6	548327	548332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13025	NC_017326	CTCG	2	8	548442	548449	0 %	25 %	25 %	50 %	384538779
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13031	NC_017326	TCA	2	6	548577	548582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538779
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13038	NC_017326	CGA	2	6	548821	548826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538779
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13043	NC_017326	CGAACT	2	12	548896	548907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384538779
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13046	NC_017326	TGC	2	6	549237	549242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538780
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13055	NC_017326	CGC	2	6	549736	549741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538780
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13057	NC_017326	GAG	2	6	549790	549795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538780
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13121	NC_017326	TCT	2	6	551858	551863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538782
13122	NC_017326	TCA	2	6	551867	551872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538782
13123	NC_017326	TCA	2	6	551879	551884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538782
13124	NC_017326	TCA	2	6	551891	551896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538782
13125	NC_017326	CGC	2	6	551944	551949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538782
13126	NC_017326	TTC	2	6	552055	552060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538782
13127	NC_017326	CG	3	6	552066	552071	0 %	0 %	50 %	50 %	384538782
13128	NC_017326	GA	3	6	552086	552091	50 %	0 %	50 %	0 %	384538782
13129	NC_017326	GGC	2	6	552182	552187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538782
13130	NC_017326	CGT	2	6	552192	552197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538782
13131	NC_017326	GCCG	2	8	552226	552233	0 %	0 %	50 %	50 %	384538782
13132	NC_017326	CGA	2	6	552246	552251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538782
13133	NC_017326	TCG	2	6	552293	552298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538782
13134	NC_017326	ATC	2	6	552307	552312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538782
13135	NC_017326	GCTC	2	8	552374	552381	0 %	25 %	25 %	50 %	384538782
13136	NC_017326	GGC	2	6	552382	552387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538782
13137	NC_017326	CGA	2	6	552420	552425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538782
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13139	NC_017326	TGC	2	6	552449	552454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538782
13140	NC_017326	CT	4	8	552469	552476	0 %	50 %	0 %	50 %	384538782
13141	NC_017326	TGCG	2	8	552490	552497	0 %	25 %	50 %	25 %	384538782
13142	NC_017326	CCT	2	6	552530	552535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538782
13143	NC_017326	GC	3	6	552605	552610	0 %	0 %	50 %	50 %	384538782
13144	NC_017326	CGC	2	6	552657	552662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538782
13145	NC_017326	ATG	2	6	552667	552672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538782
13146	NC_017326	GCT	2	6	552684	552689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538782
13147	NC_017326	GCG	2	6	552690	552695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538782
13148	NC_017326	AGA	2	6	552781	552786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13149	NC_017326	GCC	2	6	552836	552841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538783
13150	NC_017326	TTG	2	6	552936	552941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538783
13151	NC_017326	CGC	2	6	552969	552974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538783
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13153	NC_017326	AGA	2	6	553092	553097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538783
13154	NC_017326	CG	3	6	553106	553111	0 %	0 %	50 %	50 %	384538783
13155	NC_017326	CGCA	2	8	553152	553159	25 %	0 %	25 %	50 %	384538783
13156	NC_017326	CG	3	6	553168	553173	0 %	0 %	50 %	50 %	384538783
13157	NC_017326	CGC	2	6	553209	553214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538783
13158	NC_017326	ATCG	2	8	553226	553233	25 %	25 %	25 %	25 %	384538783
13159	NC_017326	CATC	2	8	553423	553430	25 %	25 %	0 %	50 %	384538783
13160	NC_017326	GTT	2	6	553535	553540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538783
13161	NC_017326	GGC	2	6	553550	553555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538783
13162	NC_017326	ATC	2	6	553584	553589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538783
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13164	NC_017326	TGT	3	9	553804	553812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538783
13165	NC_017326	GAT	2	6	553834	553839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13166	NC_017326	CGCGG	2	10	553935	553944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13167	NC_017326	GCG	2	6	554001	554006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13168	NC_017326	GCA	2	6	554031	554036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13169	NC_017326	ATCAG	2	10	554116	554125	40 %	20 %	20 %	20 %	384538784
13170	NC_017326	TCT	2	6	554148	554153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538784
13171	NC_017326	CTT	2	6	554203	554208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13172	NC_017326	GCA	2	6	554210	554215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13173	NC_017326	CTT	3	9	554241	554249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13174	NC_017326	GC	3	6	554372	554377	0 %	0 %	50 %	50 %	384538785
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13180	NC_017326	GCG	2	6	554537	554542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538785
13181	NC_017326	CGA	2	6	554545	554550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538785
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13183	NC_017326	GGC	2	6	554572	554577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538785
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13191	NC_017326	CTC	2	6	554801	554806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538785
13192	NC_017326	GAT	2	6	554872	554877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538785
13193	NC_017326	ATC	2	6	554885	554890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538785
13194	NC_017326	GCTCG	2	10	554893	554902	0 %	20 %	40 %	40 %	384538785
13195	NC_017326	CGT	2	6	555025	555030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538785
13196	NC_017326	CG	3	6	555061	555066	0 %	0 %	50 %	50 %	384538785
13197	NC_017326	CG	3	6	555117	555122	0 %	0 %	50 %	50 %	384538785
13198	NC_017326	TGC	2	6	555153	555158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538785
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13200	NC_017326	CTG	2	6	555194	555199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538785
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13205	NC_017326	CT	3	6	555456	555461	0 %	50 %	0 %	50 %	384538785
13206	NC_017326	CGGC	2	8	555486	555493	0 %	0 %	50 %	50 %	384538785
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13210	NC_017326	CAG	2	6	555635	555640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538785
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13212	NC_017326	CGCT	2	8	555677	555684	0 %	25 %	25 %	50 %	384538785
13213	NC_017326	GAG	2	6	555734	555739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538785
13214	NC_017326	GC	3	6	555756	555761	0 %	0 %	50 %	50 %	384538785
13215	NC_017326	CGC	2	6	555772	555777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538785
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13217	NC_017326	CATCCT	2	12	555883	555894	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384538785
13218	NC_017326	CAG	2	6	555941	555946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538785
13219	NC_017326	TGA	2	6	555960	555965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538785
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13222	NC_017326	GC	3	6	556071	556076	0 %	0 %	50 %	50 %	384538785
13223	NC_017326	GGC	2	6	556091	556096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538785
13224	NC_017326	GC	3	6	556256	556261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13225	NC_017326	CGG	2	6	556333	556338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538786
13226	NC_017326	CCT	2	6	556393	556398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538786
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13228	NC_017326	ATC	2	6	556481	556486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538786
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13230	NC_017326	ATCGG	2	10	556514	556523	20 %	20 %	40 %	20 %	384538786
13231	NC_017326	CGA	2	6	556531	556536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538786
13232	NC_017326	CGGA	2	8	556548	556555	25 %	0 %	50 %	25 %	384538786
13233	NC_017326	GGT	2	6	556585	556590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538786
13234	NC_017326	CAT	2	6	556606	556611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538786
13235	NC_017326	CCG	2	6	556665	556670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538786
13236	NC_017326	GCCG	2	8	556704	556711	0 %	0 %	50 %	50 %	384538786
13237	NC_017326	TCG	2	6	556812	556817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538786
13238	NC_017326	CGGA	2	8	556818	556825	25 %	0 %	50 %	25 %	384538786
13239	NC_017326	ATG	2	6	557017	557022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538786
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13241	NC_017326	GC	3	6	557093	557098	0 %	0 %	50 %	50 %	384538787
13242	NC_017326	TCG	2	6	557120	557125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538787
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13361	NC_017326	TCG	2	6	561913	561918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538793
13362	NC_017326	TCG	2	6	561934	561939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538793
13363	NC_017326	CGA	2	6	562088	562093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538793
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13365	NC_017326	CGA	2	6	562130	562135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538793
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13385	NC_017326	TTCG	2	8	562932	562939	0 %	50 %	25 %	25 %	384538793
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13393	NC_017326	CGT	2	6	563189	563194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538793
13394	NC_017326	CGA	2	6	563204	563209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538793
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13421	NC_017326	A	6	6	564303	564308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13452	NC_017326	CA	3	6	565625	565630	50 %	0 %	0 %	50 %	384538794
13453	NC_017326	CGA	2	6	565672	565677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538794
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13458	NC_017326	GCG	2	6	565880	565885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13459	NC_017326	TCG	2	6	565958	565963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538795
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13464	NC_017326	CGT	2	6	566286	566291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538795
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13469	NC_017326	GATGGC	2	12	566635	566646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384538795
13470	NC_017326	GAA	2	6	566794	566799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538795
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13473	NC_017326	CGGCAA	2	12	566877	566888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538795
13474	NC_017326	TCC	2	6	566912	566917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538795
13475	NC_017326	CG	3	6	566935	566940	0 %	0 %	50 %	50 %	384538795
13476	NC_017326	GGC	3	9	566973	566981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538795
13477	NC_017326	CG	4	8	567026	567033	0 %	0 %	50 %	50 %	384538795
13478	NC_017326	AGC	2	6	567042	567047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538795
13479	NC_017326	GCC	2	6	567061	567066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538795
13480	NC_017326	CTC	2	6	567106	567111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13481	NC_017326	CG	3	6	567130	567135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13482	NC_017326	ATTG	2	8	567206	567213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_017326	GGC	2	6	567280	567285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13484	NC_017326	GCT	2	6	567288	567293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13485	NC_017326	TCGCTC	2	12	567378	567389	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384538796
13486	NC_017326	GCG	2	6	567394	567399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538796
13487	NC_017326	GGT	2	6	567401	567406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538796
13488	NC_017326	GAT	2	6	567452	567457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538796
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13491	NC_017326	CCG	2	6	567674	567679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538796
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13499	NC_017326	AG	3	6	568112	568117	50 %	0 %	50 %	0 %	384538797
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